MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	TCAACC	2	12	11341	11352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	94972379
2	NC_008013	TATTAA	2	12	11610	11621	50 %	50 %	0 %	0 %	94972379
3	NC_008013	AGCAAA	2	12	11956	11967	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94972379
4	NC_008013	TACCAG	2	12	13536	13547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94972380
5	NC_008013	ATTGCA	2	12	15407	15418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94972381
6	NC_008013	CATAAA	2	12	15866	15877	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94972382
7	NC_008013	TTTTGT	2	12	18991	19002	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	94972385
8	NC_008013	TTTTTG	2	12	19717	19728	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	94972386
9	NC_008013	TAGATA	2	12	22858	22869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94972389
10	NC_008013	ATATTT	2	12	24193	24204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972390
11	NC_008013	TGAAGA	2	12	24392	24403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94972390
12	NC_008013	AAATTT	2	12	25956	25967	50 %	50 %	0 %	0 %	94972391
13	NC_008013	GAAAAA	2	12	34906	34917	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972395
14	NC_008013	TAGTAA	2	12	35155	35166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94972395
15	NC_008013	GATAAA	2	12	35765	35776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94972395
16	NC_008013	GAAAAA	2	12	37117	37128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972396
17	NC_008013	TTAACA	2	12	37300	37311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94972396
18	NC_008013	AGCATT	2	12	38723	38734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94972397
19	NC_008013	GACTAT	2	12	39003	39014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94972397
20	NC_008013	TAAAAG	2	12	39178	39189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94972397

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.