MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	GTTAT	2	10	896	905	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008013	TTTAT	2	10	934	943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008013	ACAAA	2	10	1059	1068	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008013	TAAAA	2	10	2530	2539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008013	TATTG	2	10	8114	8123	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008013	AAGTA	2	10	9378	9387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008013	CAATT	2	10	10210	10219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008013	TACAT	2	10	19302	19311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008013	ATAAA	2	10	19344	19353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008013	GTTAT	2	10	20624	20633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008013	AGAAA	2	10	24885	24894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008013	ATTAA	2	10	27333	27342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008013	ATTAA	2	10	27361	27370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008013	ATTAT	2	10	27390	27399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008013	AATTA	2	10	29238	29247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008013	ATCAA	2	10	29536	29545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008013	TATAA	2	10	29648	29657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008013	TTCCC	2	10	29903	29912	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008013	TATAT	2	10	30860	30869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008013	AATAG	2	10	31717	31726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008013	AACAA	2	10	32830	32839	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008013	TAATA	2	10	33287	33296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008013	AGCTA	2	10	33432	33441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008013	TAAAT	2	10	33473	33482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008013	TATTT	2	10	36704	36713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008013	GGATA	2	10	36833	36842	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008013	ATATA	2	10	38493	38502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.