MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	AAAAG	2	10	3397	3406	80 %	0 %	20 %	0 %	94972376
2	NC_008013	TTTGC	2	10	5785	5794	0 %	60 %	20 %	20 %	94972377
3	NC_008013	TAAGG	2	10	6645	6654	40 %	20 %	40 %	0 %	94972377
4	NC_008013	ATTAT	2	10	7861	7870	40 %	60 %	0 %	0 %	94972377
5	NC_008013	TGTAT	2	10	9016	9025	20 %	60 %	20 %	0 %	94972378
6	NC_008013	CTATG	2	10	9167	9176	20 %	40 %	20 %	20 %	94972378
7	NC_008013	CTTTT	2	10	10583	10592	0 %	80 %	0 %	20 %	94972379
8	NC_008013	AAAGT	2	10	11820	11829	60 %	20 %	20 %	0 %	94972379
9	NC_008013	GGCTT	2	10	11882	11891	0 %	40 %	40 %	20 %	94972379
10	NC_008013	TGTCC	2	10	13607	13616	0 %	40 %	20 %	40 %	94972380
11	NC_008013	ATGGA	2	10	13763	13772	40 %	20 %	40 %	0 %	94972380
12	NC_008013	AGTAT	2	10	14203	14212	40 %	40 %	20 %	0 %	94972380
13	NC_008013	TTGCA	2	10	15603	15612	20 %	40 %	20 %	20 %	94972382
14	NC_008013	TTTTA	2	10	15675	15684	20 %	80 %	0 %	0 %	94972382
15	NC_008013	TAATT	2	10	16099	16108	40 %	60 %	0 %	0 %	94972382
16	NC_008013	TTTTA	2	10	16617	16626	20 %	80 %	0 %	0 %	94972383
17	NC_008013	AAAAT	2	10	19978	19987	80 %	20 %	0 %	0 %	94972386
18	NC_008013	TGATA	2	10	20033	20042	40 %	40 %	20 %	0 %	94972386
19	NC_008013	AGAAA	2	10	20489	20498	80 %	0 %	20 %	0 %	94972386
20	NC_008013	GTCTT	2	10	21448	21457	0 %	60 %	20 %	20 %	94972387
21	NC_008013	ATGAA	2	10	22009	22018	60 %	20 %	20 %	0 %	94972388
22	NC_008013	TACAT	2	10	22085	22094	40 %	40 %	0 %	20 %	94972388
23	NC_008013	TACAC	2	10	22332	22341	40 %	20 %	0 %	40 %	94972388
24	NC_008013	AAATG	2	10	22961	22970	60 %	20 %	20 %	0 %	94972389
25	NC_008013	TGTAA	2	10	25245	25254	40 %	40 %	20 %	0 %	94972391
26	NC_008013	AAATA	2	10	27656	27665	80 %	20 %	0 %	0 %	94972393
27	NC_008013	ATAAA	2	10	27783	27792	80 %	20 %	0 %	0 %	94972393
28	NC_008013	ATTTT	2	10	37733	37742	20 %	80 %	0 %	0 %	94972396
29	NC_008013	AACTT	2	10	38829	38838	40 %	40 %	0 %	20 %	94972397

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.