MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	A	6	6	2496	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	94972375
2	NC_008013	T	6	6	2502	2507	0 %	100 %	0 %	0 %	94972375
3	NC_008013	A	7	7	3412	3418	100 %	0 %	0 %	0 %	94972376
4	NC_008013	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	94972376
5	NC_008013	A	8	8	3678	3685	100 %	0 %	0 %	0 %	94972376
6	NC_008013	T	6	6	5647	5652	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
7	NC_008013	T	7	7	7200	7206	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
8	NC_008013	A	7	7	7707	7713	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
9	NC_008013	A	6	6	7761	7766	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
10	NC_008013	T	6	6	7784	7789	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
11	NC_008013	A	6	6	7806	7811	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
12	NC_008013	T	6	6	8380	8385	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
13	NC_008013	T	6	6	8766	8771	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
14	NC_008013	T	6	6	8843	8848	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
15	NC_008013	A	6	6	9080	9085	100 %	0 %	0 %	0 %	94972378
16	NC_008013	T	8	8	9272	9279	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
17	NC_008013	C	6	6	9305	9310	0 %	0 %	0 %	100 %	94972378
18	NC_008013	T	6	6	10817	10822	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
19	NC_008013	A	6	6	10921	10926	100 %	0 %	0 %	0 %	94972379
20	NC_008013	A	6	6	10958	10963	100 %	0 %	0 %	0 %	94972379
21	NC_008013	T	6	6	11208	11213	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
22	NC_008013	T	6	6	11862	11867	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
23	NC_008013	T	7	7	12586	12592	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
24	NC_008013	T	6	6	12768	12773	0 %	100 %	0 %	0 %	94972380
25	NC_008013	T	7	7	13065	13071	0 %	100 %	0 %	0 %	94972380
26	NC_008013	G	7	7	14713	14719	0 %	0 %	100 %	0 %	94972381
27	NC_008013	A	6	6	15062	15067	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
28	NC_008013	A	6	6	15204	15209	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
29	NC_008013	T	7	7	15220	15226	0 %	100 %	0 %	0 %	94972381
30	NC_008013	T	8	8	15288	15295	0 %	100 %	0 %	0 %	94972381
31	NC_008013	A	7	7	15319	15325	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
32	NC_008013	A	7	7	15659	15665	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
33	NC_008013	T	7	7	15857	15863	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
34	NC_008013	A	6	6	15875	15880	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
35	NC_008013	T	8	8	16244	16251	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
36	NC_008013	T	8	8	16377	16384	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
37	NC_008013	T	6	6	16411	16416	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
38	NC_008013	A	6	6	16417	16422	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
39	NC_008013	T	8	8	16432	16439	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
40	NC_008013	T	6	6	16957	16962	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
41	NC_008013	T	6	6	17056	17061	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
42	NC_008013	T	7	7	17175	17181	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
43	NC_008013	T	8	8	17554	17561	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
44	NC_008013	A	6	6	18195	18200	100 %	0 %	0 %	0 %	94972384
45	NC_008013	T	6	6	19009	19014	0 %	100 %	0 %	0 %	94972385
46	NC_008013	A	6	6	19035	19040	100 %	0 %	0 %	0 %	94972385
47	NC_008013	A	7	7	19707	19713	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
48	NC_008013	A	7	7	19952	19958	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
49	NC_008013	A	6	6	20022	20027	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
50	NC_008013	T	7	7	20050	20056	0 %	100 %	0 %	0 %	94972386
51	NC_008013	A	6	6	20350	20355	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
52	NC_008013	T	6	6	20465	20470	0 %	100 %	0 %	0 %	94972386
53	NC_008013	T	6	6	20590	20595	0 %	100 %	0 %	0 %	94972386
54	NC_008013	T	6	6	21188	21193	0 %	100 %	0 %	0 %	94972387
55	NC_008013	G	13	13	21209	21221	0 %	0 %	100 %	0 %	94972387
56	NC_008013	A	6	6	22470	22475	100 %	0 %	0 %	0 %	94972388
57	NC_008013	G	10	10	22770	22779	0 %	0 %	100 %	0 %	94972389
58	NC_008013	A	8	8	22916	22923	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
59	NC_008013	A	6	6	23140	23145	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
60	NC_008013	A	6	6	23354	23359	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
61	NC_008013	A	6	6	23422	23427	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
62	NC_008013	A	6	6	23465	23470	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
63	NC_008013	A	6	6	23581	23586	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
64	NC_008013	A	6	6	24959	24964	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
65	NC_008013	A	6	6	25122	25127	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
66	NC_008013	A	6	6	25192	25197	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
67	NC_008013	A	6	6	25632	25637	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
68	NC_008013	A	7	7	25803	25809	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
69	NC_008013	A	6	6	26019	26024	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
70	NC_008013	A	6	6	26120	26125	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
71	NC_008013	A	7	7	26159	26165	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
72	NC_008013	T	6	6	26560	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	94972392
73	NC_008013	T	7	7	26586	26592	0 %	100 %	0 %	0 %	94972392
74	NC_008013	T	6	6	27571	27576	0 %	100 %	0 %	0 %	94972393
75	NC_008013	A	6	6	27790	27795	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
76	NC_008013	A	6	6	28126	28131	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
77	NC_008013	A	6	6	28214	28219	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
78	NC_008013	A	6	6	28470	28475	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
79	NC_008013	A	6	6	31308	31313	100 %	0 %	0 %	0 %	94972394
80	NC_008013	A	6	6	31615	31620	100 %	0 %	0 %	0 %	94972394
81	NC_008013	T	7	7	33697	33703	0 %	100 %	0 %	0 %	94972395
82	NC_008013	A	6	6	33895	33900	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
83	NC_008013	A	7	7	33933	33939	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
84	NC_008013	A	8	8	33994	34001	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
85	NC_008013	A	8	8	34008	34015	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
86	NC_008013	A	8	8	34039	34046	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
87	NC_008013	A	6	6	34181	34186	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
88	NC_008013	A	8	8	34212	34219	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
89	NC_008013	A	6	6	34234	34239	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
90	NC_008013	A	6	6	34328	34333	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
91	NC_008013	A	6	6	34377	34382	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
92	NC_008013	A	6	6	34435	34440	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
93	NC_008013	A	7	7	34480	34486	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
94	NC_008013	A	6	6	34588	34593	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
95	NC_008013	A	7	7	34621	34627	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
96	NC_008013	A	6	6	34633	34638	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
97	NC_008013	A	7	7	34713	34719	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
98	NC_008013	A	7	7	34769	34775	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
99	NC_008013	A	7	7	34899	34905	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
100	NC_008013	A	7	7	34930	34936	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
101	NC_008013	T	6	6	35020	35025	0 %	100 %	0 %	0 %	94972395
102	NC_008013	A	6	6	35420	35425	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
103	NC_008013	T	6	6	35460	35465	0 %	100 %	0 %	0 %	94972395
104	NC_008013	T	7	7	35647	35653	0 %	100 %	0 %	0 %	94972395
105	NC_008013	A	6	6	35957	35962	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
106	NC_008013	T	8	8	36292	36299	0 %	100 %	0 %	0 %	94972395
107	NC_008013	A	6	6	36316	36321	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
108	NC_008013	A	6	6	36323	36328	100 %	0 %	0 %	0 %	94972395
109	NC_008013	A	8	8	36992	36999	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
110	NC_008013	A	6	6	37103	37108	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
111	NC_008013	A	7	7	37110	37116	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
112	NC_008013	A	8	8	37190	37197	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
113	NC_008013	A	7	7	37293	37299	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
114	NC_008013	A	6	6	37460	37465	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
115	NC_008013	A	6	6	37491	37496	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
116	NC_008013	A	7	7	37653	37659	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
117	NC_008013	A	7	7	37974	37980	100 %	0 %	0 %	0 %	94972396
118	NC_008013	A	7	7	38891	38897	100 %	0 %	0 %	0 %	94972397

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.