MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008012	TTTA	2	8	212	219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008012	GAAA	2	8	2410	2417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008012	CTTT	2	8	2480	2487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008012	GTAA	2	8	2516	2523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008012	TAAA	2	8	3255	3262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008012	GGTA	2	8	3285	3292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008012	TAAA	2	8	5394	5401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008012	CTAA	2	8	5467	5474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008012	AATA	2	8	5519	5526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008012	AAAG	2	8	5680	5687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008012	GAAG	2	8	6523	6530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008012	TTTA	2	8	10636	10643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008012	TAAA	2	8	10828	10835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008012	TAAC	2	8	12889	12896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008012	ATTA	2	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008012	ATAA	2	8	12981	12988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008012	TAAA	2	8	13024	13031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008012	AACT	2	8	13919	13926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008012	ATAG	2	8	15196	15203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008012	CTAT	2	8	15238	15245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008012	CTAT	2	8	19998	20005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008012	TAAT	2	8	21945	21952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008012	AATA	2	8	22697	22704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008012	TAAA	2	8	26739	26746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008012	TAAA	3	12	26784	26795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008012	TAAA	2	8	26833	26840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008012	TAAA	2	8	26874	26881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.