MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008012	AT	3	6	251	256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008012	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008012	AT	3	6	687	692	50 %	50 %	0 %	0 %	94972344
4	NC_008012	AT	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	94972345
5	NC_008012	AT	3	6	1982	1987	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
6	NC_008012	AT	3	6	2105	2110	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
7	NC_008012	TA	3	6	2169	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	94972346
8	NC_008012	AT	3	6	2493	2498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008012	AT	3	6	3003	3008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008012	TC	3	6	3728	3733	0 %	50 %	0 %	50 %	94972348
11	NC_008012	AT	3	6	3840	3845	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
12	NC_008012	TC	3	6	3915	3920	0 %	50 %	0 %	50 %	94972348
13	NC_008012	AT	3	6	4038	4043	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
14	NC_008012	GA	3	6	4609	4614	50 %	0 %	50 %	0 %	94972348
15	NC_008012	TA	3	6	4995	5000	50 %	50 %	0 %	0 %	94972348
16	NC_008012	TA	3	6	5321	5326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008012	AT	3	6	5353	5358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008012	TA	3	6	5373	5378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008012	AT	4	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008012	TA	3	6	6308	6313	50 %	50 %	0 %	0 %	94972349
21	NC_008012	AT	3	6	6412	6417	50 %	50 %	0 %	0 %	94972349
22	NC_008012	AT	3	6	6628	6633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008012	TA	7	14	6741	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008012	AG	3	6	6802	6807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008012	AT	4	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	94972350
26	NC_008012	AT	3	6	7912	7917	50 %	50 %	0 %	0 %	94972351
27	NC_008012	AT	3	6	8641	8646	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
28	NC_008012	AT	3	6	8941	8946	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
29	NC_008012	AT	3	6	8995	9000	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
30	NC_008012	AT	3	6	9005	9010	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
31	NC_008012	AT	3	6	9070	9075	50 %	50 %	0 %	0 %	94972352
32	NC_008012	GT	3	6	9228	9233	0 %	50 %	50 %	0 %	94972352
33	NC_008012	AG	3	6	9497	9502	50 %	0 %	50 %	0 %	94972352
34	NC_008012	TA	4	8	9644	9651	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
35	NC_008012	AT	3	6	9677	9682	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
36	NC_008012	AT	3	6	10166	10171	50 %	50 %	0 %	0 %	94972353
37	NC_008012	AT	3	6	11025	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
38	NC_008012	TA	3	6	11244	11249	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
39	NC_008012	AT	3	6	11311	11316	50 %	50 %	0 %	0 %	94972354
40	NC_008012	AT	4	8	11447	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
41	NC_008012	TA	3	6	11698	11703	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
42	NC_008012	AT	3	6	11756	11761	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
43	NC_008012	AT	3	6	11976	11981	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
44	NC_008012	AT	3	6	12010	12015	50 %	50 %	0 %	0 %	94972355
45	NC_008012	TG	3	6	12688	12693	0 %	50 %	50 %	0 %	94972356
46	NC_008012	AT	7	14	12727	12740	50 %	50 %	0 %	0 %	94972356
47	NC_008012	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008012	TA	3	6	13039	13044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008012	TA	7	14	13681	13694	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
50	NC_008012	GT	3	6	13712	13717	0 %	50 %	50 %	0 %	94972357
51	NC_008012	AT	3	6	13770	13775	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
52	NC_008012	AT	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	94972357
53	NC_008012	TA	3	6	13979	13984	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
54	NC_008012	CA	3	6	14304	14309	50 %	0 %	0 %	50 %	94972358
55	NC_008012	TA	7	14	14579	14592	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
56	NC_008012	AT	3	6	14929	14934	50 %	50 %	0 %	0 %	94972358
57	NC_008012	AT	3	6	15520	15525	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
58	NC_008012	AT	3	6	15610	15615	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
59	NC_008012	TA	3	6	16019	16024	50 %	50 %	0 %	0 %	94972359
60	NC_008012	TC	3	6	16065	16070	0 %	50 %	0 %	50 %	94972360
61	NC_008012	AT	3	6	16173	16178	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
62	NC_008012	AT	3	6	16243	16248	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
63	NC_008012	AT	3	6	16782	16787	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
64	NC_008012	TA	3	6	17024	17029	50 %	50 %	0 %	0 %	94972360
65	NC_008012	TA	3	6	17787	17792	50 %	50 %	0 %	0 %	94972361
66	NC_008012	TA	3	6	18913	18918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008012	TA	3	6	18944	18949	50 %	50 %	0 %	0 %	94972364
68	NC_008012	TA	3	6	19364	19369	50 %	50 %	0 %	0 %	94972365
69	NC_008012	TA	6	12	19872	19883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008012	AG	3	6	19886	19891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008012	TA	3	6	20019	20024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008012	AT	3	6	20049	20054	50 %	50 %	0 %	0 %	94972366
73	NC_008012	CT	3	6	20132	20137	0 %	50 %	0 %	50 %	94972366
74	NC_008012	AT	4	8	20412	20419	50 %	50 %	0 %	0 %	94972366
75	NC_008012	TA	3	6	21078	21083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008012	AT	7	14	21098	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008012	TA	3	6	21204	21209	50 %	50 %	0 %	0 %	94972367
78	NC_008012	AT	4	8	21857	21864	50 %	50 %	0 %	0 %	94972367
79	NC_008012	GA	3	6	21870	21875	50 %	0 %	50 %	0 %	94972367
80	NC_008012	CT	3	6	22108	22113	0 %	50 %	0 %	50 %	94972368
81	NC_008012	TA	3	6	22550	22555	50 %	50 %	0 %	0 %	94972369
82	NC_008012	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
83	NC_008012	CT	3	6	23263	23268	0 %	50 %	0 %	50 %	94972370
84	NC_008012	TA	3	6	23346	23351	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
85	NC_008012	AT	3	6	23507	23512	50 %	50 %	0 %	0 %	94972370
86	NC_008012	AT	3	6	24216	24221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008012	TA	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008012	TA	4	8	24255	24262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008012	AT	3	6	24841	24846	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
90	NC_008012	TA	3	6	25133	25138	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
91	NC_008012	AT	3	6	25273	25278	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
92	NC_008012	AT	3	6	25438	25443	50 %	50 %	0 %	0 %	94972371
93	NC_008012	GA	3	6	25536	25541	50 %	0 %	50 %	0 %	94972371

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.