MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 1

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008012	T	6	6	445	450	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
2	NC_008012	A	6	6	520	525	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
3	NC_008012	T	7	7	618	624	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
4	NC_008012	A	8	8	976	983	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
5	NC_008012	T	8	8	1032	1039	0 %	100 %	0 %	0 %	94972344
6	NC_008012	A	6	6	1140	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	94972344
7	NC_008012	T	6	6	1809	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	94972345
8	NC_008012	T	7	7	2205	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	94972346
9	NC_008012	T	9	9	2422	2430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008012	T	6	6	2818	2823	0 %	100 %	0 %	0 %	94972347
11	NC_008012	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	94972347
12	NC_008012	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008012	T	6	6	3244	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008012	T	6	6	3321	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008012	T	6	6	3426	3431	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
16	NC_008012	A	7	7	3779	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
17	NC_008012	A	6	6	3984	3989	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
18	NC_008012	T	6	6	4019	4024	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
19	NC_008012	T	6	6	4032	4037	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
20	NC_008012	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
21	NC_008012	A	6	6	4169	4174	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
22	NC_008012	A	6	6	4506	4511	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
23	NC_008012	A	6	6	4833	4838	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
24	NC_008012	T	7	7	4905	4911	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
25	NC_008012	T	6	6	4919	4924	0 %	100 %	0 %	0 %	94972348
26	NC_008012	A	7	7	4944	4950	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
27	NC_008012	A	6	6	5143	5148	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
28	NC_008012	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
29	NC_008012	A	7	7	5225	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	94972348
30	NC_008012	T	6	6	5704	5709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008012	A	7	7	5883	5889	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
32	NC_008012	A	6	6	5945	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
33	NC_008012	A	6	6	5979	5984	100 %	0 %	0 %	0 %	94972349
34	NC_008012	T	6	6	6013	6018	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
35	NC_008012	T	6	6	6100	6105	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
36	NC_008012	T	6	6	6280	6285	0 %	100 %	0 %	0 %	94972349
37	NC_008012	A	9	9	6564	6572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008012	A	7	7	6670	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008012	T	7	7	6773	6779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008012	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008012	T	8	8	6909	6916	0 %	100 %	0 %	0 %	94972350
42	NC_008012	A	7	7	7193	7199	100 %	0 %	0 %	0 %	94972350
43	NC_008012	T	7	7	7222	7228	0 %	100 %	0 %	0 %	94972350
44	NC_008012	T	6	6	7470	7475	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
45	NC_008012	T	6	6	7490	7495	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
46	NC_008012	A	6	6	7709	7714	100 %	0 %	0 %	0 %	94972351
47	NC_008012	T	7	7	7723	7729	0 %	100 %	0 %	0 %	94972351
48	NC_008012	A	6	6	8499	8504	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
49	NC_008012	A	7	7	8676	8682	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
50	NC_008012	A	7	7	8836	8842	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
51	NC_008012	A	6	6	9103	9108	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
52	NC_008012	T	6	6	9109	9114	0 %	100 %	0 %	0 %	94972352
53	NC_008012	A	6	6	9287	9292	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
54	NC_008012	A	6	6	9310	9315	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
55	NC_008012	A	6	6	9447	9452	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
56	NC_008012	T	7	7	9453	9459	0 %	100 %	0 %	0 %	94972352
57	NC_008012	A	8	8	9477	9484	100 %	0 %	0 %	0 %	94972352
58	NC_008012	T	8	8	9594	9601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_008012	T	7	7	9924	9930	0 %	100 %	0 %	0 %	94972353
61	NC_008012	T	8	8	9962	9969	0 %	100 %	0 %	0 %	94972353
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63	NC_008012	T	8	8	11157	11164	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
64	NC_008012	A	6	6	11206	11211	100 %	0 %	0 %	0 %	94972354
65	NC_008012	T	8	8	11284	11291	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
66	NC_008012	T	6	6	11322	11327	0 %	100 %	0 %	0 %	94972354
67	NC_008012	T	7	7	11387	11393	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
68	NC_008012	T	6	6	11535	11540	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
69	NC_008012	C	7	7	11668	11674	0 %	0 %	0 %	100 %	94972355
70	NC_008012	A	7	7	11785	11791	100 %	0 %	0 %	0 %	94972355
71	NC_008012	T	8	8	11888	11895	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
72	NC_008012	A	6	6	11937	11942	100 %	0 %	0 %	0 %	94972355
73	NC_008012	T	6	6	12033	12038	0 %	100 %	0 %	0 %	94972355
74	NC_008012	T	6	6	12105	12110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_008012	T	6	6	14223	14228	0 %	100 %	0 %	0 %	94972358
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93	NC_008012	T	7	7	15231	15237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_008012	A	6	6	18190	18195	100 %	0 %	0 %	0 %	94972362
112	NC_008012	A	6	6	18332	18337	100 %	0 %	0 %	0 %	94972362
113	NC_008012	T	6	6	18370	18375	0 %	100 %	0 %	0 %	94972362
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115	NC_008012	A	7	7	18659	18665	100 %	0 %	0 %	0 %	94972363
116	NC_008012	A	6	6	18753	18758	100 %	0 %	0 %	0 %	94972363
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118	NC_008012	A	6	6	19072	19077	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
119	NC_008012	A	6	6	19153	19158	100 %	0 %	0 %	0 %	94972364
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.