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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008011	AGAT	2	8	40	47	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008011	TAAT	2	8	233	240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008011	TAAA	2	8	248	255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008011	TAAT	2	8	2949	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008011	TATT	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008011	TTAT	2	8	7293	7300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008011	ATAC	2	8	7522	7529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008011	TAAA	2	8	7570	7577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008011	TTAT	2	8	7657	7664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008011	TAAC	2	8	13595	13602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008011	TCTA	2	8	13837	13844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008011	ATTT	2	8	13867	13874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008011	TAGT	2	8	14001	14008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008011	TTTG	2	8	14031	14038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008011	AGAA	2	8	16827	16834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008011	TATT	2	8	17470	17477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008011	CTAT	2	8	17492	17499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008011	AAAG	2	8	17531	17538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008011	TAAA	2	8	17575	17582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008011	TAGA	2	8	19293	19300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008011	TTTA	2	8	20883	20890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008011	TATG	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008011	TAAC	2	8	25091	25098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008011	AAAT	2	8	34502	34509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008011	TAGA	2	8	34586	34593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008011	TAGT	2	8	35882	35889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008011	AGTA	2	8	38017	38024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008011	GTTT	2	8	38257	38264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008011	AATA	3	12	40876	40887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008011	AATT	2	8	40963	40970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008011	TAGA	2	8	42680	42687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008011	ATAA	2	8	44279	44286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008011	TTGT	2	8	45267	45274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008011	AATA	2	8	45833	45840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008011	AGTT	2	8	47567	47574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008011	TAAA	2	8	47628	47635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008011	TAAT	3	12	47636	47647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008011	TACA	2	8	49819	49826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008011	ACAA	2	8	53300	53307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008011	TAGC	2	8	53693	53700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008011	TAGT	2	8	53852	53859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008011	TAAC	2	8	55860	55867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008011	TATT	2	8	55981	55988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008011	ATAG	2	8	56159	56166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008011	ATAG	2	8	56194	56201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008011	AAGA	2	8	56448	56455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008011	TTAA	2	8	56461	56468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008011	TAAA	2	8	56518	56525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008011	ATAA	2	8	56585	56592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008011	TTAA	2	8	56713	56720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008011	ATTA	2	8	59430	59437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008011	ACTT	2	8	59609	59616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008011	TTAA	2	8	59642	59649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008011	TTAT	2	8	59704	59711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008011	TTTA	2	8	60966	60973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008011	TAAC	2	8	64393	64400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008011	TTAA	2	8	64411	64418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008011	GTAG	2	8	65266	65273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008011	CAGT	2	8	65398	65405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008011	AGTA	2	8	65548	65555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008011	TAAA	2	8	65807	65814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008011	GAAA	2	8	73671	73678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008011	TAAA	2	8	73945	73952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008011	TATG	2	8	73964	73971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008011	TAAC	2	8	74079	74086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008011	GTTA	2	8	74107	74114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008011	TTAT	2	8	74749	74756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008011	TTAT	2	8	75783	75790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008011	AGTT	2	8	77658	77665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008011	AAAT	2	8	80115	80122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008011	TAAT	2	8	81197	81204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008011	TATT	2	8	81224	81231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008011	TAAT	2	8	81233	81240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008011	GAAA	2	8	81601	81608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008011	TTAC	2	8	81619	81626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008011	CAAT	2	8	82888	82895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008011	TACA	2	8	83013	83020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008011	AGTT	2	8	83109	83116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008011	GTAT	2	8	83318	83325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008011	TATT	2	8	84215	84222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008011	ATTT	2	8	84244	84251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008011	TATT	2	8	84341	84348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008011	TATT	2	8	85530	85537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008011	AGTA	2	8	85734	85741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008011	GTTA	2	8	85802	85809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008011	TAAC	2	8	86263	86270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008011	TGTT	2	8	90578	90585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008011	TTAT	2	8	91499	91506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008011	AATA	2	8	91519	91526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008011	ATTC	2	8	91774	91781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008011	TCAA	2	8	92002	92009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008011	TTAT	2	8	92228	92235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008011	GAAG	2	8	92294	92301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008011	TATT	2	8	92429	92436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008011	GTTT	2	8	95438	95445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008011	TCTA	2	8	96193	96200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008011	ATCC	2	8	96260	96267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008011	GATA	2	8	96576	96583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008011	TCTA	2	8	96620	96627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008011	TAAA	2	8	96651	96658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008011	ATGA	2	8	97125	97132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008011	ATTA	2	8	97246	97253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008011	GAAA	2	8	97374	97381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008011	AGAA	2	8	100078	100085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008011	CTAT	2	8	103319	103326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008011	TTAT	2	8	103335	103342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008011	TATC	2	8	105034	105041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008011	GTAT	2	8	105076	105083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008011	TCTA	2	8	108520	108527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008011	TAAA	2	8	108599	108606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008011	AGAT	2	8	108854	108861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008011	ATGG	2	8	108938	108945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008011	AGCC	2	8	109064	109071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008011	TGTT	2	8	109718	109725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008011	CTTT	2	8	110035	110042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008011	GGGA	2	8	110167	110174	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008011	ATAA	2	8	110231	110238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008011	GCTG	2	8	110298	110305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008011	TCCC	2	8	110360	110367	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008011	ATAA	2	8	111392	111399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008011	ATTT	2	8	111558	111565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008011	TAAA	2	8	112206	112213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008011	TAGT	2	8	112235	112242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008011	ACTA	2	8	112505	112512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008011	TTAA	2	8	112524	112531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008011	TAAT	2	8	114923	114930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008011	AGAA	2	8	116525	116532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008011	TATT	2	8	119016	119023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008011	ATAG	2	8	123566	123573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008011	ATTA	2	8	123611	123618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008011	GTTA	2	8	123842	123849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008011	AAAT	2	8	123888	123895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008011	TTTA	2	8	124145	124152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008011	GAAT	2	8	124234	124241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008011	TAAT	2	8	124298	124305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008011	TTAA	2	8	124314	124321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008011	AGAT	2	8	125305	125312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008011	TATT	2	8	127606	127613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008011	ATTT	2	8	133173	133180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008011	TCTA	2	8	133188	133195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008011	TAAA	3	12	134256	134267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008011	GTAT	2	8	138374	138381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008011	AGGT	2	8	138382	138389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008011	ATAA	2	8	138492	138499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008011	ATGA	2	8	138655	138662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008011	GATA	2	8	142866	142873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008011	AGAA	2	8	144367	144374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008011	AAAG	2	8	145802	145809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008011	GTTA	2	8	147681	147688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008011	AGTT	2	8	151774	151781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008011	AACA	2	8	151926	151933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008011	TAAT	2	8	151947	151954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008011	ATAA	2	8	151988	151995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008011	GTTA	2	8	152017	152024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008011	AATT	2	8	153803	153810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008011	TGTT	2	8	153950	153957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008011	ATTT	2	8	175027	175034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008011	TTTA	2	8	175041	175048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_008011	ATTA	2	8	181622	181629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_008011	GATA	2	8	181708	181715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_008011	ATTA	2	8	181941	181948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008011	ATTA	2	8	360271	360278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008011	TAAA	2	8	360660	360667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_008011	TACA	2	8	360730	360737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
295	NC_008011	ATTA	4	16	360917	360932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008011	AAAT	2	8	612140	612147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008011	CCTA	2	8	614485	614492	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_008011	TAAC	2	8	614551	614558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_008011	AATA	2	8	616487	616494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_008011	TATG	2	8	616710	616717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_008011	CTAA	2	8	624138	624145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_008011	TATC	2	8	624178	624185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_008011	AATG	2	8	627593	627600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_008011	TAGT	3	12	628921	628932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_008011	ACTA	2	8	651231	651238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_008011	TTAA	2	8	651332	651339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_008011	ATAC	2	8	664397	664404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
480	NC_008011	TATT	2	8	664455	664462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_008011	ACTA	2	8	664507	664514	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_008011	AATT	2	8	664549	664556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_008011	TGAT	2	8	664769	664776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_008011	ATGA	2	8	684212	684219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008011	TAAT	2	8	685061	685068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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