MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008010	GCCA	2	8	68	75	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008010	TTTG	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008010	GTTC	2	8	314	321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008010	GGCC	2	8	2490	2497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008010	AACT	2	8	9018	9025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008010	CTTC	2	8	10413	10420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008010	CCTA	2	8	11239	11246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008010	ACAG	2	8	12971	12978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008010	GCAC	2	8	13463	13470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008010	CCTC	2	8	13756	13763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_008010	GTCT	3	12	13780	13791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008010	TCTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008010	AGCC	2	8	22876	22883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008010	GGGA	2	8	27860	27867	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008010	TGTT	2	8	27956	27963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008010	GACC	2	8	57601	57608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008010	CGAC	2	8	57825	57832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008010	CACT	2	8	58006	58013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008010	CTGC	2	8	58335	58342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008010	CCTC	2	8	65489	65496	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008010	CGCC	2	8	88533	88540	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008010	CGCC	2	8	95539	95546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008010	CATG	3	12	103568	103579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008010	AGGA	2	8	116834	116841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008010	TCCT	2	8	126411	126418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008010	GCAC	2	8	153178	153185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008010	AGGC	2	8	165254	165261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008010	CTGG	2	8	167628	167635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008010	ATTC	2	8	182136	182143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008010	CGCC	2	8	187951	187958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_008010	GGAC	2	8	193369	193376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008010	TCCA	2	8	204052	204059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008010	TCCT	2	8	204351	204358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008010	TGGC	2	8	205717	205724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008010	GGGC	2	8	218209	218216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008010	GGCG	2	8	218374	218381	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008010	TTCT	2	8	220077	220084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008010	TGAC	2	8	227467	227474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008010	CTCC	2	8	229996	230003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008010	CGGA	2	8	235968	235975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008010	CCCT	2	8	237215	237222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008010	CCGG	2	8	238308	238315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008010	GCCC	2	8	239161	239168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_008010	TCCA	2	8	239253	239260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008010	CAGC	2	8	249330	249337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008010	GTGA	2	8	249583	249590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008010	TGCC	2	8	249849	249856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008010	AAGG	2	8	250899	250906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008010	GATG	2	8	252218	252225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008010	CTAT	2	8	258817	258824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008010	GCGG	2	8	259689	259696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008010	CTGG	2	8	270904	270911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008010	TCCT	2	8	278213	278220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008010	TCCA	2	8	282297	282304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008010	CAGG	2	8	288194	288201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008010	CAGA	2	8	290061	290068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008010	ACTC	2	8	290176	290183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008010	TTTG	2	8	301118	301125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008010	TCGC	2	8	301188	301195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008010	CCAG	2	8	302602	302609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008010	CTGC	2	8	302646	302653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008010	CCGC	2	8	307200	307207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_008010	GAGG	2	8	311789	311796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008010	GACC	2	8	311871	311878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008010	GCGG	2	8	312710	312717	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008010	CTGA	2	8	314729	314736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008010	TCCC	2	8	314958	314965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_008010	GGGC	2	8	314977	314984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008010	GGTT	2	8	325664	325671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008010	AGCT	2	8	325878	325885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008010	TCCA	2	8	329983	329990	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008010	GTCT	2	8	343603	343610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008010	TAAG	2	8	345508	345515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008010	TGGG	2	8	345544	345551	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008010	ACTT	2	8	345770	345777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008010	CGCT	2	8	347567	347574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008010	CCAA	2	8	347985	347992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008010	AGAC	2	8	351701	351708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008010	CGGG	2	8	374786	374793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008010	AGGA	2	8	374813	374820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008010	AAAG	2	8	392932	392939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008010	CGAA	2	8	397708	397715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008010	TCAG	2	8	398069	398076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008010	CCAG	2	8	399290	399297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008010	CAGC	2	8	400943	400950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008010	GCTG	2	8	403014	403021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008010	CATT	2	8	405392	405399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008010	CGGA	2	8	405405	405412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008010	GCGG	2	8	405829	405836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008010	GCCC	2	8	406889	406896	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_008010	CGGG	2	8	411973	411980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008010	CTTT	2	8	419381	419388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008010	AAGG	2	8	431320	431327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008010	AGAC	2	8	433226	433233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008010	ACTC	2	8	440860	440867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008010	GCAG	2	8	445884	445891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008010	CCGA	2	8	445906	445913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008010	CGTC	2	8	460804	460811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008010	GCTG	2	8	469103	469110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008010	GAGC	2	8	469876	469883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008010	TGGC	2	8	475552	475559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008010	GCCT	2	8	478686	478693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008010	CACC	2	8	479856	479863	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_008010	AGCC	2	8	483750	483757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008010	GCTG	2	8	485808	485815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008010	GCTG	2	8	485833	485840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008010	GGGA	2	8	486027	486034	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008010	GGCG	2	8	486139	486146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008010	TGGT	2	8	487064	487071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008010	CGCA	2	8	487569	487576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008010	CGCC	3	12	490053	490064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_008010	GTCA	2	8	490168	490175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008010	CGCC	2	8	492006	492013	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_008010	GCCC	2	8	493169	493176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_008010	GCTG	2	8	495963	495970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008010	TTCT	2	8	497102	497109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008010	GAAG	2	8	499668	499675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008010	TCCC	2	8	503979	503986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_008010	CCCT	2	8	509214	509221	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008010	TGTA	2	8	514024	514031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008010	GTGC	2	8	514488	514495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008010	TTTC	2	8	515151	515158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008010	CAGG	2	8	515256	515263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008010	GGAA	2	8	521771	521778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008010	CCGG	2	8	522040	522047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008010	GAAC	2	8	523273	523280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008010	CAGC	2	8	524243	524250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008010	TTCG	2	8	525935	525942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008010	GCGT	2	8	529087	529094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008010	AGGA	2	8	530889	530896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008010	CCGC	2	8	534262	534269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_008010	ACCG	2	8	536151	536158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008010	CGGG	2	8	536251	536258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008010	TGCT	2	8	539491	539498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008010	TCAC	2	8	539540	539547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008010	ACTT	2	8	551047	551054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008010	TAGA	2	8	556484	556491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008010	TTCC	2	8	562642	562649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008010	TGAC	2	8	566491	566498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008010	AACC	2	8	569200	569207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.