MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008010	GT	3	6	332	337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008010	CG	3	6	8514	8519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008010	GC	3	6	8685	8690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008010	AC	3	6	10083	10088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008010	AC	3	6	10252	10257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008010	AC	4	8	10514	10521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008010	GA	3	6	10719	10724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008010	CG	3	6	11055	11060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008010	CG	3	6	11194	11199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008010	GC	3	6	12301	12306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008010	GA	3	6	12307	12312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008010	AG	3	6	39140	39145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008010	CT	3	6	39282	39287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008010	CT	3	6	39295	39300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008010	TG	3	6	53733	53738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008010	TC	3	6	57682	57687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008010	TG	3	6	57770	57775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008010	AG	4	8	58291	58298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008010	CG	3	6	59235	59240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008010	GA	3	6	74514	74519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008010	CG	4	8	81074	81081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008010	GA	3	6	81093	81098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008010	TG	3	6	88459	88464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008010	CG	3	6	89913	89918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008010	GC	3	6	94385	94390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008010	AC	5	10	95209	95218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008010	TC	3	6	95608	95613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008010	CT	3	6	97095	97100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008010	GC	3	6	99895	99900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008010	AG	3	6	109650	109655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008010	CA	3	6	111718	111723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008010	TC	3	6	116715	116720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008010	TG	3	6	117609	117614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008010	GA	3	6	120149	120154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008010	CG	3	6	150481	150486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008010	CG	3	6	160621	160626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008010	GC	3	6	163929	163934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008010	GC	3	6	166485	166490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008010	CG	3	6	167486	167491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008010	CT	4	8	169295	169302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008010	AG	3	6	173845	173850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008010	CA	3	6	173910	173915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008010	AG	3	6	176115	176120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008010	CT	3	6	176917	176922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008010	GC	3	6	182657	182662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008010	TG	3	6	188336	188341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008010	GC	3	6	204021	204026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008010	CA	3	6	209049	209054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008010	AG	3	6	214306	214311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008010	CG	3	6	214539	214544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008010	GT	3	6	214612	214617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008010	GC	3	6	214906	214911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008010	CG	3	6	218364	218369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008010	GC	4	8	218453	218460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008010	AG	3	6	218953	218958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008010	AG	4	8	219147	219154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008010	AG	3	6	219221	219226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008010	GC	3	6	219824	219829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008010	CG	3	6	221500	221505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008010	CA	3	6	221972	221977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008010	CT	3	6	224475	224480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008010	AT	3	6	224569	224574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008010	AG	3	6	224734	224739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008010	CT	3	6	233600	233605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008010	GC	3	6	238298	238303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008010	GA	3	6	247807	247812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008010	GC	3	6	249037	249042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008010	GC	3	6	251136	251141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008010	GC	3	6	251327	251332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008010	GA	3	6	251393	251398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008010	GA	3	6	251606	251611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008010	GA	3	6	252369	252374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008010	CT	3	6	258729	258734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008010	TA	3	6	270939	270944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008010	CG	3	6	273423	273428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008010	CT	3	6	275303	275308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008010	CG	3	6	275358	275363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008010	TC	3	6	292048	292053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008010	TC	3	6	301239	301244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008010	CG	3	6	307101	307106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008010	CT	3	6	307115	307120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008010	AG	3	6	307138	307143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008010	AC	3	6	307149	307154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008010	CA	3	6	308492	308497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008010	TC	3	6	312654	312659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008010	AC	3	6	314378	314383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008010	GC	3	6	314810	314815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008010	GC	3	6	315008	315013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008010	TC	3	6	336901	336906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008010	CG	3	6	352059	352064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008010	AC	3	6	354695	354700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008010	GC	3	6	355774	355779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008010	GC	3	6	355846	355851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008010	AG	3	6	376978	376983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008010	CT	3	6	393112	393117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008010	GC	3	6	403610	403615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008010	AC	3	6	403970	403975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008010	AC	3	6	405068	405073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008010	CA	3	6	405268	405273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008010	AC	3	6	406407	406412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008010	AC	3	6	406834	406839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008010	TC	3	6	424160	424165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008010	AG	3	6	424191	424196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008010	TC	3	6	429139	429144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008010	TC	3	6	435821	435826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008010	TC	3	6	440968	440973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008010	CA	3	6	458482	458487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008010	GA	3	6	461025	461030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008010	CA	3	6	466095	466100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008010	TG	3	6	468761	468766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008010	TG	3	6	470633	470638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008010	CG	3	6	475571	475576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008010	CA	3	6	479794	479799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008010	AG	3	6	483693	483698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008010	CG	3	6	484552	484557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008010	CG	3	6	485827	485832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008010	CG	3	6	485916	485921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008010	GC	3	6	490844	490849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008010	GA	4	8	497133	497140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008010	CT	3	6	505250	505255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008010	GC	3	6	505528	505533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008010	GC	3	6	509385	509390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008010	GC	3	6	518104	518109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008010	GA	3	6	518673	518678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008010	AG	3	6	525832	525837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008010	GC	3	6	525840	525845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008010	GC	3	6	525865	525870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008010	CT	3	6	528991	528996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008010	GC	3	6	536283	536288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008010	CT	3	6	541388	541393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008010	GA	3	6	548922	548927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008010	GT	4	8	551065	551072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008010	GA	3	6	552552	552557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008010	GC	3	6	555964	555969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008010	GC	3	6	560704	560709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008010	GC	3	6	562054	562059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008010	CG	3	6	562069	562074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008010	CG	3	6	562111	562116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008010	CG	3	6	562703	562708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008010	GC	3	6	566474	566479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008010	CT	3	6	568521	568526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008010	CT	3	6	574108	574113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.