MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Koribacter versatilis Ellin345 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008009	AGAATG	2	12	7792	7803	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008009	GAGAAA	2	12	29626	29637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008009	CGCAAC	2	12	58993	59004	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008009	GAAAGG	2	12	78390	78401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008009	CGGTAG	2	12	93197	93208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008009	AGGCGC	2	12	98395	98406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008009	TAGGTT	2	12	191125	191136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008009	CAACGG	2	12	193460	193471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008009	CCCTCA	2	12	212769	212780	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008009	AGGGGG	2	12	221919	221930	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008009	CGACCG	2	12	271744	271755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008009	GTTTTG	2	12	293742	293753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008009	GCCAAC	2	12	341730	341741	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008009	ATTTTC	2	12	393169	393180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008009	TTTGCT	2	12	512654	512665	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008009	CGTTAA	2	12	522972	522983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008009	ACCCGC	2	12	603703	603714	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008009	ACCCCC	2	12	616817	616828	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_008009	GCGGTG	2	12	617693	617704	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008009	CCTTGC	2	12	657050	657061	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008009	CGCTTT	2	12	687272	687283	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008009	CCGCAC	2	12	690663	690674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_008009	TTTCGC	2	12	700859	700870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008009	GACAGG	2	12	711903	711914	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008009	TATTTG	2	12	735073	735084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008009	GCAAGC	2	12	811382	811393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008009	TCGTTC	2	12	874560	874571	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008009	AGAAAA	2	12	900001	900012	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008009	TGTGCA	2	12	922077	922088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008009	GCGCGG	2	12	934823	934834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008009	CTTCGA	2	12	945520	945531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008009	TTGCCT	2	12	953197	953208	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008009	CACTAC	2	12	1085016	1085027	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008009	CGTGAT	2	12	1087730	1087741	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008009	CTCTTT	2	12	1161207	1161218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008009	ACGCGT	2	12	1181737	1181748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008009	CCCCCT	2	12	1196335	1196346	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_008009	GTGAAA	2	12	1227158	1227169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008009	CGAAGA	2	12	1255340	1255351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008009	TTTGGT	2	12	1334942	1334953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008009	CTTTCT	2	12	1390348	1390359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008009	GATTTT	2	12	1475209	1475220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008009	ACGCCG	2	12	1492076	1492087	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008009	CGCGTC	2	12	1493795	1493806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008009	GCAAGT	2	12	1621517	1621528	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008009	TTGAAG	2	12	1625868	1625879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008009	TCGAAG	2	12	1717965	1717976	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008009	GAACGC	2	12	1726723	1726734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008009	AATGGG	2	12	1835457	1835468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008009	GCGGTA	2	12	2013776	2013787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008009	CGGGTG	2	12	2014138	2014149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008009	TCGTCC	2	12	2054303	2054314	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008009	GTGAAC	2	12	2065223	2065234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008009	AGAGGG	2	12	2081275	2081286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008009	AAATGA	2	12	2251743	2251754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008009	TTTCAT	2	12	2251756	2251767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008009	AGGGGG	2	12	2276094	2276105	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008009	AGGGAA	2	12	2302045	2302056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008009	CTTCGA	2	12	2302871	2302882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008009	ACGCTT	2	12	2312638	2312649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008009	AATCGC	2	12	2342123	2342134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008009	TGCGGC	2	12	2374311	2374322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008009	GCTTTT	2	12	2392897	2392908	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008009	GTTTAC	2	12	2392965	2392976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008009	AGGCGA	2	12	2393586	2393597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008009	ATGGCA	2	12	2397264	2397275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008009	GAGGGA	2	12	2412192	2412203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008009	GCAATG	2	12	2430435	2430446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008009	TAGAAG	2	12	2458409	2458420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008009	TCCGGA	2	12	2477942	2477953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008009	CTGTTG	2	12	2508873	2508884	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008009	CAGACG	2	12	2653516	2653527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008009	CGGTGA	2	12	2689875	2689886	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008009	GCGGTC	2	12	2691313	2691324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008009	TTGAGG	2	12	2798716	2798727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008009	GCGGTT	2	12	2867848	2867859	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008009	GTTTCG	2	12	2935149	2935160	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008009	GAAACT	2	12	2949751	2949762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008009	CTCCAG	2	12	3050702	3050713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008009	CTTTTT	2	12	3113333	3113344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008009	CCTACG	2	12	3121786	3121797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008009	CCACTT	2	12	3122280	3122291	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008009	CATTTC	2	12	3222338	3222349	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008009	CGACCG	2	12	3274557	3274568	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008009	GCGCTC	2	12	3284436	3284447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008009	ATCAGA	2	12	3289795	3289806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008009	CACCTA	2	12	3291027	3291038	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008009	ACCTAC	2	12	3291076	3291087	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008009	TTGGCG	2	12	3297300	3297311	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008009	CATCAC	2	12	3458537	3458548	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008009	CGCCCC	2	12	3458910	3458921	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_008009	TTTTCA	2	12	3595851	3595862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008009	ACTACC	2	12	3659372	3659383	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008009	AAGCAA	2	12	3695623	3695634	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008009	ACGCCA	2	12	3720852	3720863	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008009	GCTCTT	2	12	3740917	3740928	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008009	GCCGAA	2	12	3769210	3769221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008009	CCACAA	2	12	3810577	3810588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008009	CCACTT	2	12	3823122	3823133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008009	ACCGCG	2	12	3837212	3837223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008009	AATTGC	2	12	3838225	3838236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008009	GCCATC	2	12	3941818	3941829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008009	GTCATC	2	12	4003805	4003816	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008009	GCCTTC	2	12	4007680	4007691	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008009	AAAAAG	2	12	4074494	4074505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008009	CGGGAG	2	12	4112029	4112040	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_008009	CGCCTC	2	12	4146949	4146960	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008009	CCCCTC	2	12	4186971	4186982	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
109	NC_008009	CGTGTG	2	12	4189764	4189775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008009	TTGCTT	2	12	4225872	4225883	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008009	AGGGGG	2	12	4230274	4230285	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008009	GAAGTT	2	12	4247660	4247671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008009	CAAATT	2	12	4343514	4343525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008009	GGATGG	2	12	4426380	4426391	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008009	CAAACG	2	12	4558268	4558279	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008009	GGAGGG	2	12	4590436	4590447	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008009	GCCTCA	2	12	4616346	4616357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008009	AAAGAA	2	12	4637664	4637675	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008009	GTGTGG	2	12	4788897	4788908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008009	TTTCAC	2	12	4826787	4826798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008009	TCAGTT	2	12	4863156	4863167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008009	TAGGTT	2	12	4881413	4881424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008009	CCTCAC	2	12	4895648	4895659	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008009	TAGAAC	2	12	4897703	4897714	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008009	AAGCAA	2	12	4965507	4965518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008009	CCTGAT	2	12	4968012	4968023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008009	TTTCTG	2	12	4982511	4982522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008009	AATTCG	2	12	5004862	5004873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008009	TCCGTC	2	12	5147976	5147987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008009	AAAAGC	2	12	5149309	5149320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008009	GCTTTT	2	12	5166333	5166344	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.