MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007984	TTATAT	2	12	10602	10613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007984	TTTAAT	2	12	10768	10779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007984	TTATAT	2	12	21963	21974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007984	AGAAAA	2	12	81699	81710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007984	TAATAT	2	12	110598	110609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007984	TATTTT	2	12	118839	118850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007984	CTATTA	2	12	119113	119124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007984	TTAATT	2	12	120255	120266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007984	AAGTAA	2	12	121177	121188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007984	TAATTA	2	12	162177	162188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007984	ATACTA	2	12	170670	170681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007984	TGAGAT	2	12	182136	182147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007984	AATTAA	2	12	203284	203295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007984	TTTATT	2	12	225328	225339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007984	GAATTT	2	12	238791	238802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007984	TTCTGT	2	12	243115	243126	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007984	TTAATA	2	12	258632	258643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007984	TATTTT	2	12	286938	286949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007984	TATTCA	2	12	303054	303065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007984	ATTAAT	2	12	308417	308428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007984	ATATTT	2	12	328443	328454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007984	ATAGAT	2	12	437139	437150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007984	AAGTTA	2	12	447587	447598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007984	CAAAGT	2	12	464731	464742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007984	TTAGTC	2	12	473547	473558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007984	AAATAT	2	12	475046	475057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007984	GTCTAG	2	12	496669	496680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007984	AATTAA	2	12	524294	524305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007984	ACTTCA	2	12	525546	525557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007984	TATATT	2	12	530336	530347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007984	TACTAA	2	12	533703	533714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007984	CTATAA	2	12	544649	544660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007984	CTAAAA	2	12	558219	558230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007984	TTAATC	2	12	564093	564104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007984	AGTAAA	2	12	594784	594795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007984	ACCTAG	2	12	632015	632026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007984	AAAAAT	2	12	641917	641928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007984	AATAGC	2	12	654357	654368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.