MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007984	ATGTAC	2	12	3200	3211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676501
2	NC_007984	TCTATG	2	12	4267	4278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676501
3	NC_007984	ATAATT	2	12	5823	5834	50 %	50 %	0 %	0 %	94676501
4	NC_007984	GTTTAT	2	12	6190	6201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676768
5	NC_007984	AAACGT	2	12	6294	6305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676768
6	NC_007984	AACTAC	2	12	7237	7248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676948
7	NC_007984	ATCAAA	2	12	16038	16049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676730
8	NC_007984	TACTTT	2	12	20363	20374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94677044
9	NC_007984	AGCATT	2	12	23435	23446	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676804
10	NC_007984	AATCGG	2	12	31277	31288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94677001
11	NC_007984	ATTAAT	2	12	36757	36768	50 %	50 %	0 %	0 %	94676573
12	NC_007984	GTAATG	2	12	43462	43473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676546
13	NC_007984	GCTGAT	2	12	45944	45955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94676505
14	NC_007984	ATTGGT	2	12	46469	46480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676505
15	NC_007984	AAGCAG	2	12	47237	47248	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	94676764
16	NC_007984	TAGTGC	2	12	54294	54305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94676797
17	NC_007984	AACATA	2	12	55992	56003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676692
18	NC_007984	AATTTA	2	12	59835	59846	50 %	50 %	0 %	0 %	94676949
19	NC_007984	TTTTAT	2	12	61027	61038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	94676519
20	NC_007984	GGTGGG	2	12	61217	61228	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	94676519
21	NC_007984	AGTGAT	2	12	63711	63722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676873
22	NC_007984	AAAAAC	2	12	64387	64398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	94676873
23	NC_007984	TACCAT	2	12	65560	65571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94676796
24	NC_007984	TCGTAT	2	12	72768	72779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676875
25	NC_007984	ATGGTA	2	12	74406	74417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676567
26	NC_007984	TAATCT	2	12	77581	77592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676849
27	NC_007984	CTTTTA	2	12	78966	78977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676849
28	NC_007984	TAAACC	2	12	79852	79863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676814
29	NC_007984	GCAGTA	2	12	81258	81269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94676983
30	NC_007984	TAACGA	2	12	86932	86943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676684
31	NC_007984	TGCTAA	2	12	91696	91707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676584
32	NC_007984	ATTAAT	2	12	92971	92982	50 %	50 %	0 %	0 %	94676654
33	NC_007984	TCTGGT	2	12	94689	94700	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94676763
34	NC_007984	TTTAAT	2	12	100855	100866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676713
35	NC_007984	AACGTC	2	12	105303	105314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94677048
36	NC_007984	TATACC	2	12	106216	106227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94676823
37	NC_007984	TTAAGG	2	12	110751	110762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676590
38	NC_007984	TAACCA	2	12	115101	115112	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676630
39	NC_007984	AGAATT	2	12	116089	116100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94676630
40	NC_007984	ATCTAT	2	12	116938	116949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94677010
41	NC_007984	GGTTAT	2	12	125662	125673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676499
42	NC_007984	GATAAA	2	12	127226	127237	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676906
43	NC_007984	GAATAA	2	12	130053	130064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676805
44	NC_007984	CAGCTT	2	12	130250	130261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94676805
45	NC_007984	ATGAAA	2	12	134725	134736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	94676564
46	NC_007984	ACAAAA	2	12	135227	135238	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	94676564
47	NC_007984	TGGTAA	2	12	135976	135987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676646
48	NC_007984	CAAGTA	2	12	138667	138678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676850
49	NC_007984	AGCAGG	2	12	139750	139761	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	94677005
50	NC_007984	AGAACA	2	12	141424	141435	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94677005
51	NC_007984	ATATTT	2	12	142970	142981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676988
52	NC_007984	ATCGTA	2	12	143090	143101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676975
53	NC_007984	CATCCT	2	12	144908	144919	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94676498
54	NC_007984	CATCAG	2	12	145058	145069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676498
55	NC_007984	TTACGA	2	12	145243	145254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676498
56	NC_007984	CGAGCA	2	12	145414	145425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94676498
57	NC_007984	TTTCTA	2	12	147672	147683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676682
58	NC_007984	TAAACA	2	12	149715	149726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	94676570
59	NC_007984	ATATAA	2	12	149997	150008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94676570
60	NC_007984	ATTACT	2	12	152583	152594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676723
61	NC_007984	TCTCCA	2	12	153588	153599	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	94676723
62	NC_007984	GTATCA	2	12	153777	153788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676723
63	NC_007984	TTAACA	2	12	155596	155607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676666
64	NC_007984	AATAGG	2	12	157796	157807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94676940
65	NC_007984	TGCTGT	2	12	159279	159290	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94676613
66	NC_007984	TTTATT	2	12	164331	164342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	94676520
67	NC_007984	AATTAC	2	12	166988	166999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676928
68	NC_007984	ATCTAG	2	12	179757	179768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676929
69	NC_007984	CTGCTC	2	12	181634	181645	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	94676853
70	NC_007984	TACAGA	2	12	187909	187920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676508
71	NC_007984	TAGTTT	2	12	188239	188250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676732
72	NC_007984	AATAGC	2	12	191033	191044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	94676888
73	NC_007984	TAGTAT	2	12	191424	191435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676981
74	NC_007984	GCTATA	2	12	191825	191836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676981
75	NC_007984	TAATCA	2	12	193667	193678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676920
76	NC_007984	ATCTAA	2	12	194768	194779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676759
77	NC_007984	CTCTTG	2	12	196866	196877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	94676665
78	NC_007984	TTTAGC	2	12	205071	205082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676731
79	NC_007984	TGATTA	2	12	208857	208868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676876
80	NC_007984	TTAATT	2	12	210338	210349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94676597
81	NC_007984	CCTGCA	2	12	211006	211017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	94676755
82	NC_007984	CTTTAT	2	12	222828	222839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676984
83	NC_007984	GTTACA	2	12	224478	224489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676894
84	NC_007984	TTCCTG	2	12	232817	232828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	94676694
85	NC_007984	CGATGA	2	12	237224	237235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94676521
86	NC_007984	TATTGG	2	12	245658	245669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	94676748
87	NC_007984	TCTAAA	2	12	248794	248805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	94676685
88	NC_007984	TTTAGT	2	12	249925	249936	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94676956
89	NC_007984	CATTAT	2	12	254214	254225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676472
90	NC_007984	TTTCAT	2	12	256684	256695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	162139369
91	NC_007984	TAATTC	2	12	260672	260683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676670
92	NC_007984	CTACTG	2	12	260905	260916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94676670
93	NC_007984	ACAGAA	2	12	262430	262441	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	94676886
94	NC_007984	ATTAGG	2	12	263324	263335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676886
95	NC_007984	TGATAA	2	12	266647	266658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94676509
96	NC_007984	TATTGA	2	12	269084	269095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676952
97	NC_007984	GTATTA	2	12	269443	269454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676952
98	NC_007984	ACTAGC	2	12	269646	269657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676777
99	NC_007984	GTTAAT	2	12	271294	271305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676844
100	NC_007984	GAGCGT	2	12	271603	271614	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94676844
101	NC_007984	ATATTC	2	12	279082	279093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676556
102	NC_007984	AGCTAT	2	12	279487	279498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676789
103	NC_007984	CAGCTA	2	12	280290	280301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94676789
104	NC_007984	ATCTTT	2	12	282544	282555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94676626
105	NC_007984	CTTTAC	2	12	282705	282716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	94676626
106	NC_007984	TACTAT	2	12	287710	287721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	94676504
107	NC_007984	GCTATA	2	12	288550	288561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94676679
108	NC_007984	TAGTAT	2	12	289227	289238	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94676679
109	NC_007984	TAGAGT	2	12	291621	291632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94676522
110	NC_007984	CAACAT	2	12	295038	295049	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94676629
111	NC_007984	AGTATT	2	12	297045	297056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94677020
112	NC_007984	TACCTA	2	12	297744	297755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94676947
113	NC_007984	TTGATC	2	12	300489	300500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94676659
114	NC_007984	TTGTTT	2	12	301298	301309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	94676566
115	NC_007984	AGATTA	2	12	301920	301931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	94676566
116	NC_007984	AAAACC	2	12	301994	302005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94676566
117	NC_007984	CGTTCA	2	12	302859	302870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94676566
118	NC_007984	CAAAAC	2	12	304157	304168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94676934
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.