MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007984	ATTAA	2	10	1791	1800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007984	TAATA	2	10	6504	6513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007984	TTTTA	2	10	19789	19798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007984	GGTAA	2	10	25448	25457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007984	TATAG	2	10	28203	28212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007984	AATAT	3	15	32794	32808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007984	CTATT	2	10	36969	36978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007984	TTATT	2	10	37188	37197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007984	TAATA	2	10	38054	38063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007984	AAATT	2	10	42810	42819	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007984	ACTAT	2	10	42951	42960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007984	TCTTA	2	10	43127	43136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007984	CCAGT	2	10	43923	43932	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007984	ATCGC	2	10	44577	44586	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007984	TCATA	2	10	45083	45092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007984	AAATA	2	10	48639	48648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007984	TCTTT	2	10	50259	50268	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007984	AATTA	2	10	62227	62236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007984	TTAAT	2	10	62284	62293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007984	TTCTT	2	10	63025	63034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007984	AGAAA	2	10	67038	67047	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007984	AAATA	2	10	67144	67153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007984	CAACA	2	10	67347	67356	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007984	TAGGT	2	10	67567	67576	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007984	AGAAA	2	10	72131	72140	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007984	AGTTA	2	10	72205	72214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007984	GTTTA	2	10	85199	85208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007984	GCATA	2	10	87285	87294	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007984	AAAAT	2	10	95933	95942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007984	AGTTA	2	10	102047	102056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007984	GTGCT	2	10	102218	102227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007984	ATATT	2	10	102333	102342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007984	AATCT	2	10	104299	104308	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007984	CATAA	2	10	104954	104963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007984	ATGAA	2	10	105902	105911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007984	ATAAA	2	10	106159	106168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007984	TAAAT	2	10	108649	108658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007984	ATCTA	2	10	108950	108959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007984	TAAAT	2	10	110373	110382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007984	TAGGT	2	10	116377	116386	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007984	ATAGT	2	10	119132	119141	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007984	TATCA	2	10	119370	119379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007984	TACTA	2	10	119891	119900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007984	TTTTC	2	10	119959	119968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007984	TTTAT	2	10	120889	120898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007984	TTAAG	2	10	121207	121216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007984	AGTGA	2	10	126306	126315	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007984	TAGAA	2	10	128740	128749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007984	ATATA	2	10	128864	128873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007984	TTATA	2	10	133980	133989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007984	GAATA	2	10	136951	136960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007984	CTTAG	2	10	137054	137063	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007984	CAAAA	2	10	137168	137177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007984	GAAAC	2	10	142042	142051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007984	TATAA	2	10	147931	147940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007984	ATATA	2	10	148465	148474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007984	TATTT	2	10	161313	161322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007984	TAAAT	2	10	162166	162175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007984	TATAT	2	10	170949	170958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007984	ATACC	2	10	175530	175539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007984	CTTAT	2	10	179034	179043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007984	TACTC	2	10	182848	182857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_007984	TAAAT	2	10	189184	189193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007984	TTATT	2	10	192359	192368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007984	AATCC	2	10	192409	192418	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007984	TAATT	2	10	196261	196270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007984	GTTTC	2	10	200080	200089	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007984	ATAGT	2	10	212296	212305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007984	TATAT	2	10	212339	212348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007984	TGTTA	2	10	212394	212403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007984	CACCT	2	10	214455	214464	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_007984	ATATA	2	10	214941	214950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007984	TTCTA	2	10	225240	225249	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007984	AATTT	2	10	229864	229873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007984	AATAG	2	10	234275	234284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007984	AACAA	2	10	234314	234323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007984	TAATC	2	10	234467	234476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007984	AGTAT	2	10	238928	238937	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007984	ATGTA	2	10	241239	241248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007984	AGGAA	2	10	241795	241804	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007984	ATACG	2	10	242057	242066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007984	TATAT	2	10	242952	242961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007984	AATGA	2	10	249727	249736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007984	AGTTT	2	10	256275	256284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007984	ATTTA	2	10	265235	265244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007984	TTTTA	2	10	273130	273139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007984	GATAA	2	10	291093	291102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007984	ATGTT	2	10	293974	293983	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007984	AAAAT	2	10	303122	303131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007984	AATAT	2	10	303150	303159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007984	TATAT	2	10	326132	326141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007984	AAAAT	2	10	326680	326689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007984	AATTA	2	10	328235	328244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007984	CTTAT	2	10	329072	329081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007984	TTAGA	2	10	332363	332372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007984	ATTAT	2	10	332387	332396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007984	TAATC	2	10	332446	332455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007984	CAATT	2	10	332517	332526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007984	TTAAA	2	10	334145	334154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007984	AGATT	2	10	334297	334306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007984	TAATA	2	10	338298	338307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007984	TAATA	2	10	338457	338466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007984	TAATT	2	10	338565	338574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007984	TAGAT	2	10	341579	341588	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007984	ATAAA	2	10	341636	341645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007984	TATAC	2	10	343865	343874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007984	GATAA	2	10	346113	346122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007984	CATAA	2	10	346129	346138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007984	TTAAA	2	10	347505	347514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007984	TTAAT	2	10	350714	350723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007984	AGTAA	2	10	362332	362341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007984	GATAT	2	10	368344	368353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007984	TCAGT	2	10	374246	374255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007984	TTAAC	2	10	377845	377854	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007984	AAATT	2	10	398999	399008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007984	TAATT	2	10	402092	402101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007984	TAGAC	2	10	403774	403783	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007984	ATATG	2	10	436622	436631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007984	ATTAG	2	10	437066	437075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007984	TTATA	2	10	438443	438452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007984	ATCAG	2	10	445023	445032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007984	TATCA	2	10	450874	450883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007984	ATATG	2	10	451353	451362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007984	ATGAT	2	10	456153	456162	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007984	TGATA	2	10	459215	459224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007984	TTAGT	2	10	465736	465745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007984	TAATT	2	10	465932	465941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007984	ATGAG	2	10	465950	465959	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007984	CATGC	2	10	470198	470207	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007984	AATTC	2	10	474989	474998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007984	CTAAT	2	10	480744	480753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_007984	TAGAT	2	10	480755	480764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007984	AGTTA	2	10	484270	484279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007984	TATAT	2	10	487507	487516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007984	TTAAT	2	10	503881	503890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007984	ATTAT	2	10	506110	506119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007984	TACTA	2	10	511359	511368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007984	GGTAT	2	10	517632	517641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007984	CTATA	2	10	522206	522215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007984	TACTA	2	10	522482	522491	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007984	ATTTT	2	10	522756	522765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007984	TATTT	2	10	531446	531455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007984	AGTTA	2	10	533104	533113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007984	TAAAC	2	10	546636	546645	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007984	AATGA	2	10	546744	546753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007984	TATAT	2	10	546799	546808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007984	ATTTA	2	10	549936	549945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007984	ATTAC	2	10	570843	570852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007984	TAGTA	2	10	579538	579547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007984	AGGTA	2	10	599505	599514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007984	TGTGT	2	10	605396	605405	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_007984	TAATA	2	10	625008	625017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_007984	AAAAT	2	10	681835	681844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007984	CTAAA	2	10	684503	684512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_007984	CTATA	2	10	686099	686108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.