MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 3707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	TAA	2	6	104	109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007974	CGC	2	6	274	279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007974	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007974	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007974	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007974	TGG	3	9	2128	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007974	AAC	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007974	CGA	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007974	CAT	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007974	AAG	3	9	2552	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007974	CAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007974	ACA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007974	ATT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007974	GAC	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007974	CGG	2	6	6414	6419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007974	CTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007974	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007974	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007974	ATG	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007974	CTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007974	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007974	CGT	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007974	ATT	2	6	6760	6765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007974	CCA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007974	GAA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007974	GCG	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007974	CGA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007974	GCC	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007974	CGG	2	6	10014	10019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007974	CCA	2	6	10027	10032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007974	GGT	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007974	CTT	2	6	14101	14106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007974	GAG	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007974	GCG	2	6	15750	15755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007974	TGA	2	6	15770	15775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007974	GGA	2	6	15819	15824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007974	CCT	2	6	15891	15896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007974	GTC	2	6	16043	16048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007974	CGG	3	9	16067	16075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007974	CCA	2	6	16100	16105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007974	GAA	2	6	16112	16117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007974	TGC	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007974	CGT	2	6	16952	16957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007974	CGC	2	6	16967	16972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007974	ATT	2	6	17995	18000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007974	CTT	2	6	18005	18010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007974	TCC	2	6	19453	19458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007974	CGG	3	9	19477	19485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007974	GCT	2	6	19499	19504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007974	AGG	2	6	19513	19518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007974	GCG	2	6	19600	19605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007974	AAG	3	9	19610	19618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007974	GGC	2	6	20541	20546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007974	GGT	2	6	20551	20556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007974	ACC	2	6	20580	20585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007974	GAA	2	6	21287	21292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007974	TCG	2	6	21619	21624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007974	CCG	2	6	21640	21645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007974	AGA	2	6	21742	21747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007974	CAA	2	6	24136	24141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007974	CGC	3	9	24166	24174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007974	AGG	2	6	25710	25715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007974	CCT	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007974	GCG	2	6	30289	30294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007974	TCC	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007974	CAA	2	6	30453	30458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007974	CGG	2	6	30482	30487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007974	GGC	2	6	30499	30504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007974	GCG	2	6	30547	30552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007974	AGG	2	6	30622	30627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007974	GCC	2	6	31402	31407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007974	TGT	2	6	32525	32530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007974	CCG	2	6	32538	32543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_007974	CCG	2	6	32646	32651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007974	GGC	2	6	32703	32708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007974	ATG	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007974	CGG	2	6	36784	36789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007974	GGA	2	6	36871	36876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007974	GCC	2	6	40400	40405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007974	AGG	2	6	41415	41420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007974	GTC	2	6	41429	41434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007974	CAG	2	6	42638	42643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007974	GAA	2	6	42680	42685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007974	CAC	2	6	46717	46722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007974	GCG	2	6	46774	46779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007974	CAC	2	6	46815	46820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007974	AGG	2	6	46868	46873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007974	CAG	2	6	50717	50722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007974	TCA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007974	GGC	2	6	52201	52206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007974	TGC	2	6	58814	58819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007974	GCC	2	6	58833	58838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007974	TGG	2	6	59087	59092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007974	ATT	2	6	59215	59220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007974	TGA	2	6	59271	59276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007974	CGC	2	6	60160	60165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007974	GGA	2	6	60231	60236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007974	AAT	2	6	60280	60285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007974	CGG	2	6	61268	61273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007974	CGG	2	6	61307	61312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007974	CGC	2	6	61329	61334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007974	GGA	2	6	61608	61613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007974	TCA	2	6	61689	61694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007974	CAA	2	6	61695	61700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007974	TGT	2	6	61713	61718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007974	GCC	2	6	61755	61760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007974	CTC	2	6	65520	65525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007974	TCG	2	6	65565	65570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007974	GAG	2	6	65583	65588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007974	GGC	2	6	66457	66462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007974	GCG	2	6	66564	66569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007974	GCA	2	6	66625	66630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007974	CCG	2	6	66711	66716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007974	GCG	2	6	66877	66882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007974	CAA	2	6	66885	66890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007974	GGC	2	6	68721	68726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007974	GAG	2	6	68755	68760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007974	CGA	2	6	71126	71131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007974	CCG	2	6	71159	71164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007974	CTA	2	6	72764	72769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007974	ATC	2	6	72787	72792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007974	GGC	2	6	72802	72807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007974	AGG	2	6	72815	72820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007974	CGT	2	6	73374	73379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007974	TGC	2	6	73413	73418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007974	GCA	2	6	73469	73474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007974	CCG	2	6	73513	73518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007974	GCC	2	6	73560	73565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007974	TCC	2	6	75579	75584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007974	ATC	2	6	76542	76547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007974	GGA	2	6	78366	78371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007974	CTG	2	6	80253	80258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007974	TGA	2	6	80266	80271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007974	TCC	2	6	80692	80697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007974	AAC	2	6	80828	80833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007974	TCC	2	6	82418	82423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007974	AGG	2	6	82508	82513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007974	CGC	2	6	82522	82527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007974	TCG	2	6	83302	83307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_007974	CGA	2	6	85276	85281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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