MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 37559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
2	NC_007974	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314736
3	NC_007974	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
4	NC_007974	GCC	2	6	1188	1193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314736
5	NC_007974	TGA	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314736
6	NC_007974	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
7	NC_007974	AAG	3	9	1378	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94314736
8	NC_007974	CAG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
9	NC_007974	GTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314736
10	NC_007974	CGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
11	NC_007974	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
12	NC_007974	GTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
13	NC_007974	CTT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
14	NC_007974	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314736
15	NC_007974	TTC	2	6	1983	1988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
16	NC_007974	CAC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314737
17	NC_007974	GCA	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
18	NC_007974	ATC	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
19	NC_007974	GGC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314738
20	NC_007974	TGG	2	6	2877	2882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314738
21	NC_007974	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
22	NC_007974	ATC	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
23	NC_007974	CGC	2	6	3117	3122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
24	NC_007974	GCC	2	6	3143	3148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
25	NC_007974	GCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
26	NC_007974	TGA	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
27	NC_007974	ATG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
28	NC_007974	GGC	2	6	3528	3533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
29	NC_007974	CGC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
30	NC_007974	TGA	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314739
31	NC_007974	CGC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
32	NC_007974	CGG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
33	NC_007974	AGC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
34	NC_007974	AGG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314739
35	NC_007974	CAA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314739
36	NC_007974	CAT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314739
37	NC_007974	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
38	NC_007974	GCC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
39	NC_007974	CTG	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314739
40	NC_007974	AGC	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
41	NC_007974	CGA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
42	NC_007974	GCC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
43	NC_007974	GTG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314740
44	NC_007974	GGA	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314740
45	NC_007974	CAT	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314740
46	NC_007974	CGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
47	NC_007974	CGC	2	6	5141	5146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
48	NC_007974	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
49	NC_007974	ATG	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
50	NC_007974	TGC	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
51	NC_007974	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314740
52	NC_007974	GAT	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
53	NC_007974	CCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314740
54	NC_007974	GTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
55	NC_007974	TGC	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
56	NC_007974	TCG	5	15	5958	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
57	NC_007974	ACG	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
58	NC_007974	GGC	2	6	6065	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314740
59	NC_007974	GCG	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
60	NC_007974	GCC	2	6	7339	7344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
61	NC_007974	ATC	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
62	NC_007974	TGG	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
63	NC_007974	CGC	2	6	7399	7404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
64	NC_007974	CGC	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
65	NC_007974	GCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
66	NC_007974	GCC	2	6	7523	7528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
67	NC_007974	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314741
68	NC_007974	CGA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
69	NC_007974	ATC	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
70	NC_007974	CCT	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94314741
71	NC_007974	CGA	2	6	7699	7704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
72	NC_007974	GCA	2	6	7744	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
73	NC_007974	CGC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
74	NC_007974	TGG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
75	NC_007974	GCC	2	6	7889	7894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
76	NC_007974	GGC	2	6	7972	7977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
77	NC_007974	GCG	2	6	8024	8029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
78	NC_007974	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314741
79	NC_007974	CGC	2	6	8238	8243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
80	NC_007974	GCA	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
81	NC_007974	GGC	2	6	8347	8352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
82	NC_007974	GGA	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314741
83	NC_007974	CTG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
84	NC_007974	CTG	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
85	NC_007974	CGC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
86	NC_007974	GGC	2	6	8611	8616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
87	NC_007974	CAG	2	6	8645	8650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
88	NC_007974	CTG	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
89	NC_007974	GCC	2	6	8726	8731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
90	NC_007974	TGG	2	6	8811	8816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
91	NC_007974	CGC	2	6	9126	9131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
92	NC_007974	GCT	2	6	9175	9180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
93	NC_007974	GCG	2	6	9183	9188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
94	NC_007974	GAG	2	6	9224	9229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314741
95	NC_007974	GCC	2	6	9317	9322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
96	NC_007974	CTG	2	6	9533	9538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
97	NC_007974	GAC	2	6	9823	9828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
98	NC_007974	GAT	2	6	10090	10095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314742
99	NC_007974	AGT	2	6	10128	10133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314742
100	NC_007974	GCA	2	6	10245	10250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314742
101	NC_007974	TCT	2	6	10350	10355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314742
102	NC_007974	CGC	2	6	10356	10361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314742
103	NC_007974	CAC	2	6	10378	10383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314742
104	NC_007974	CTC	2	6	10426	10431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94314742
105	NC_007974	CGC	2	6	10554	10559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314742
106	NC_007974	CGG	2	6	10564	10569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314742
107	NC_007974	CAG	2	6	10672	10677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314742
108	NC_007974	TGC	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314742
109	NC_007974	GAA	2	6	10786	10791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94314742
110	NC_007974	TGT	2	6	10959	10964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314742
111	NC_007974	GAC	2	6	11065	11070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314743
112	NC_007974	TGC	2	6	11091	11096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314743
113	NC_007974	GAT	2	6	11104	11109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314743
114	NC_007974	CCA	2	6	11118	11123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314743
115	NC_007974	GCA	2	6	11280	11285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314743
116	NC_007974	CCG	2	6	11300	11305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314743
117	NC_007974	CTG	2	6	11581	11586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314743
118	NC_007974	GGC	2	6	11653	11658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314743
119	NC_007974	CAG	2	6	11704	11709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314743
120	NC_007974	GCC	2	6	11758	11763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314743
121	NC_007974	TTG	2	6	11774	11779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314743
122	NC_007974	CCA	3	9	11781	11789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314743
123	NC_007974	CCA	2	6	11835	11840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314743
124	NC_007974	GCC	2	6	12023	12028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314744
125	NC_007974	CAC	2	6	12032	12037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314744
126	NC_007974	CGG	2	6	12094	12099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314744
127	NC_007974	CGG	2	6	12103	12108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314744
128	NC_007974	GCC	2	6	12113	12118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314744
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130	NC_007974	TGG	2	6	12202	12207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314744
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