MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 3344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	GGCAG	2	10	25	34	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007973	CGCGG	2	10	641	650	0 %	0 %	60 %	40 %	94308946
3	NC_007973	AGCGC	2	10	3816	3825	20 %	0 %	40 %	40 %	94308948
4	NC_007973	GGCCT	2	10	4556	4565	0 %	20 %	40 %	40 %	94308948
5	NC_007973	GTTCA	2	10	7275	7284	20 %	40 %	20 %	20 %	94308949
6	NC_007973	GCGAA	2	10	11062	11071	40 %	0 %	40 %	20 %	94308951
7	NC_007973	GTCAC	2	10	13039	13048	20 %	20 %	20 %	40 %	94308954
8	NC_007973	TCGTA	2	10	13189	13198	20 %	40 %	20 %	20 %	94308954
9	NC_007973	GAAAG	2	10	13838	13847	60 %	0 %	40 %	0 %	94308954
10	NC_007973	ACGCC	2	10	18092	18101	20 %	0 %	20 %	60 %	94308959
11	NC_007973	GACCA	2	10	19979	19988	40 %	0 %	20 %	40 %	94308961
12	NC_007973	CTGGC	2	10	21167	21176	0 %	20 %	40 %	40 %	94308962
13	NC_007973	GCGCC	2	10	21181	21190	0 %	0 %	40 %	60 %	94308962
14	NC_007973	GAGAC	2	10	23680	23689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007973	CAGGG	2	10	24576	24585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007973	CGTGG	2	10	25052	25061	0 %	20 %	60 %	20 %	94308966
17	NC_007973	TGCGA	2	10	25370	25379	20 %	20 %	40 %	20 %	94308966
18	NC_007973	GATCC	2	10	25520	25529	20 %	20 %	20 %	40 %	94308966
19	NC_007973	CGGCG	2	10	26570	26579	0 %	0 %	60 %	40 %	94308967
20	NC_007973	GCGTG	2	10	27557	27566	0 %	20 %	60 %	20 %	94308968
21	NC_007973	GCAGG	2	10	29609	29618	20 %	0 %	60 %	20 %	94308969
22	NC_007973	TCGTG	2	10	30083	30092	0 %	40 %	40 %	20 %	94308970
23	NC_007973	GCGCG	2	10	31516	31525	0 %	0 %	60 %	40 %	94308972
24	NC_007973	CATCG	2	10	31757	31766	20 %	20 %	20 %	40 %	94308972
25	NC_007973	ACTGG	2	10	32464	32473	20 %	20 %	40 %	20 %	94308973
26	NC_007973	CTGGT	2	10	33114	33123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007973	TGGCT	2	10	35059	35068	0 %	40 %	40 %	20 %	94308976
28	NC_007973	CAGCG	2	10	35792	35801	20 %	0 %	40 %	40 %	335055475
29	NC_007973	TTCGC	2	10	36796	36805	0 %	40 %	20 %	40 %	94308979
30	NC_007973	GGGTG	2	10	38898	38907	0 %	20 %	80 %	0 %	94308981
31	NC_007973	AATGG	2	10	39452	39461	40 %	20 %	40 %	0 %	335055476
32	NC_007973	GCCGT	2	10	39636	39645	0 %	20 %	40 %	40 %	94308983
33	NC_007973	GCAAG	2	10	40246	40255	40 %	0 %	40 %	20 %	94308983
34	NC_007973	CGCTG	2	10	41782	41791	0 %	20 %	40 %	40 %	94308984
35	NC_007973	GGCGT	2	10	41957	41966	0 %	20 %	60 %	20 %	94308984
36	NC_007973	TGCCC	2	10	44307	44316	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007973	TCTGG	2	10	45206	45215	0 %	40 %	40 %	20 %	94308986
38	NC_007973	GGCGT	2	10	45891	45900	0 %	20 %	60 %	20 %	94308986
39	NC_007973	CGCTG	2	10	46148	46157	0 %	20 %	40 %	40 %	94308986
40	NC_007973	GGCGC	2	10	46839	46848	0 %	0 %	60 %	40 %	94308986
41	NC_007973	GGCGG	2	10	49682	49691	0 %	0 %	80 %	20 %	94308989
42	NC_007973	CGATG	2	10	50936	50945	20 %	20 %	40 %	20 %	94308989
43	NC_007973	CGTGG	2	10	51080	51089	0 %	20 %	60 %	20 %	94308989
44	NC_007973	CCCCG	2	10	51727	51736	0 %	0 %	20 %	80 %	94308990
45	NC_007973	AGCGG	2	10	51898	51907	20 %	0 %	60 %	20 %	94308990
46	NC_007973	CAATG	2	10	52333	52342	40 %	20 %	20 %	20 %	94308990
47	NC_007973	TGGCC	2	10	52620	52629	0 %	20 %	40 %	40 %	94308991
48	NC_007973	GGCTC	2	10	53909	53918	0 %	20 %	40 %	40 %	94308991
49	NC_007973	CCAGC	2	10	54506	54515	20 %	0 %	20 %	60 %	94308992
50	NC_007973	GCACG	2	10	55800	55809	20 %	0 %	40 %	40 %	94308994
51	NC_007973	GCGCG	2	10	56126	56135	0 %	0 %	60 %	40 %	94308994
52	NC_007973	GCGCG	2	10	56279	56288	0 %	0 %	60 %	40 %	94308994
53	NC_007973	GCCAT	2	10	56476	56485	20 %	20 %	20 %	40 %	94308994
54	NC_007973	TGGCC	2	10	56963	56972	0 %	20 %	40 %	40 %	94308994
55	NC_007973	CGGCG	2	10	57287	57296	0 %	0 %	60 %	40 %	94308995
56	NC_007973	GGCCG	2	10	58422	58431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007973	CGTGC	2	10	58828	58837	0 %	20 %	40 %	40 %	94308996
58	NC_007973	TCGGC	2	10	59154	59163	0 %	20 %	40 %	40 %	94308996
59	NC_007973	GTCGC	2	10	59557	59566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007973	GCCGG	2	10	63759	63768	0 %	0 %	60 %	40 %	94309000
61	NC_007973	TGCCG	2	10	63855	63864	0 %	20 %	40 %	40 %	94309000
62	NC_007973	CGACC	2	10	64311	64320	20 %	0 %	20 %	60 %	94309000
63	NC_007973	CGTCG	2	10	65308	65317	0 %	20 %	40 %	40 %	94309001
64	NC_007973	CGGCG	2	10	65467	65476	0 %	0 %	60 %	40 %	94309001
65	NC_007973	GGCGT	2	10	65721	65730	0 %	20 %	60 %	20 %	94309002
66	NC_007973	GCTCC	2	10	67563	67572	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007973	TTCAC	2	10	67660	67669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007973	CGGCG	2	10	67950	67959	0 %	0 %	60 %	40 %	94309004
69	NC_007973	ACGGT	2	10	67998	68007	20 %	20 %	40 %	20 %	94309004
70	NC_007973	GGTGC	2	10	68149	68158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007973	GCCCG	2	10	69018	69027	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_007973	CGGCG	2	10	71208	71217	0 %	0 %	60 %	40 %	94309008
73	NC_007973	GCCGC	2	10	71237	71246	0 %	0 %	40 %	60 %	94309008
74	NC_007973	CCGGC	2	10	71523	71532	0 %	0 %	40 %	60 %	94309008
75	NC_007973	GCCGA	2	10	71747	71756	20 %	0 %	40 %	40 %	94309008
76	NC_007973	TGGCA	2	10	72017	72026	20 %	20 %	40 %	20 %	94309008
77	NC_007973	CGATG	2	10	72427	72436	20 %	20 %	40 %	20 %	94309009
78	NC_007973	TGGCC	2	10	72571	72580	0 %	20 %	40 %	40 %	94309009
79	NC_007973	CGGCA	2	10	73124	73133	20 %	0 %	40 %	40 %	94309010
80	NC_007973	TACGC	2	10	74850	74859	20 %	20 %	20 %	40 %	94309012
81	NC_007973	GGCGC	2	10	75414	75423	0 %	0 %	60 %	40 %	94309013
82	NC_007973	AGCAG	2	10	76526	76535	40 %	0 %	40 %	20 %	94309013
83	NC_007973	GGCGC	2	10	80168	80177	0 %	0 %	60 %	40 %	94309017
84	NC_007973	TGATG	2	10	80332	80341	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007973	CCGCG	2	10	80425	80434	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007973	GCCGC	2	10	80639	80648	0 %	0 %	40 %	60 %	94309018
87	NC_007973	GAAGC	2	10	83026	83035	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007973	CGTGG	2	10	83487	83496	0 %	20 %	60 %	20 %	94309021
89	NC_007973	TGCGG	2	10	86504	86513	0 %	20 %	60 %	20 %	94309024
90	NC_007973	CGCTT	2	10	88064	88073	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007973	CCGCG	2	10	88785	88794	0 %	0 %	40 %	60 %	94309026
92	NC_007973	TGGCC	2	10	89458	89467	0 %	20 %	40 %	40 %	94309027
93	NC_007973	TCGGG	2	10	91205	91214	0 %	20 %	60 %	20 %	94309029
94	NC_007973	GCATG	2	10	91613	91622	20 %	20 %	40 %	20 %	94309029
95	NC_007973	GTCGA	2	10	91632	91641	20 %	20 %	40 %	20 %	94309029
96	NC_007973	CCTGG	2	10	95289	95298	0 %	20 %	40 %	40 %	94309033
97	NC_007973	CGCTT	2	10	101654	101663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007973	CACAT	2	10	101957	101966	40 %	20 %	0 %	40 %	94309040
99	NC_007973	CGCGG	2	10	102380	102389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007973	CGTGC	2	10	102757	102766	0 %	20 %	40 %	40 %	94309041
101	NC_007973	ACCAC	2	10	103430	103439	40 %	0 %	0 %	60 %	94309041
102	NC_007973	GCCGC	2	10	106782	106791	0 %	0 %	40 %	60 %	94309044
103	NC_007973	CGCAT	2	10	106857	106866	20 %	20 %	20 %	40 %	94309045
104	NC_007973	GACCG	2	10	109529	109538	20 %	0 %	40 %	40 %	94309048
105	NC_007973	ACGGC	2	10	109737	109746	20 %	0 %	40 %	40 %	94309048
106	NC_007973	CCCGC	2	10	112250	112259	0 %	0 %	20 %	80 %	94309049
107	NC_007973	GGGCC	2	10	113726	113735	0 %	0 %	60 %	40 %	94309051
108	NC_007973	GCGCC	2	10	113816	113825	0 %	0 %	40 %	60 %	94309051
109	NC_007973	GCCGC	2	10	113921	113930	0 %	0 %	40 %	60 %	94309051
110	NC_007973	CCGGC	2	10	117770	117779	0 %	0 %	40 %	60 %	94309056
111	NC_007973	TGAGC	2	10	118080	118089	20 %	20 %	40 %	20 %	94309056
112	NC_007973	CTGGT	2	10	118285	118294	0 %	40 %	40 %	20 %	94309057
113	NC_007973	CGGCC	2	10	119391	119400	0 %	0 %	40 %	60 %	94309058
114	NC_007973	CGCGC	2	10	120836	120845	0 %	0 %	40 %	60 %	94309059
115	NC_007973	ACGCC	2	10	121800	121809	20 %	0 %	20 %	60 %	94309060
116	NC_007973	TGGCG	2	10	122428	122437	0 %	20 %	60 %	20 %	94309060
117	NC_007973	CATCC	2	10	124860	124869	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_007973	CGCAG	2	10	126746	126755	20 %	0 %	40 %	40 %	94309066
119	NC_007973	GTGGC	2	10	127785	127794	0 %	20 %	60 %	20 %	94309067
120	NC_007973	GCCAG	2	10	130498	130507	20 %	0 %	40 %	40 %	94309069
121	NC_007973	GAAAA	2	10	132122	132131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007973	GCTGT	2	10	134498	134507	0 %	40 %	40 %	20 %	94309073
123	NC_007973	CGATG	2	10	135562	135571	20 %	20 %	40 %	20 %	94309074
124	NC_007973	TCGGC	2	10	136610	136619	0 %	20 %	40 %	40 %	94309075
125	NC_007973	GACCA	2	10	136741	136750	40 %	0 %	20 %	40 %	94309075
126	NC_007973	GCCGC	2	10	136806	136815	0 %	0 %	40 %	60 %	94309075
127	NC_007973	GCCGT	2	10	142155	142164	0 %	20 %	40 %	40 %	94309081
128	NC_007973	AGGGC	2	10	142246	142255	20 %	0 %	60 %	20 %	94309081
129	NC_007973	GGGCG	2	10	142376	142385	0 %	0 %	80 %	20 %	94309081
130	NC_007973	ATGAA	2	10	142831	142840	60 %	20 %	20 %	0 %	94309082
131	NC_007973	CGGCG	2	10	146337	146346	0 %	0 %	60 %	40 %	94309086
132	NC_007973	GGGAA	2	10	147334	147343	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007973	CGAAC	2	10	148753	148762	40 %	0 %	20 %	40 %	94309089
134	NC_007973	GTGGG	2	10	151175	151184	0 %	20 %	80 %	0 %	94309091
135	NC_007973	GCGGA	2	10	154542	154551	20 %	0 %	60 %	20 %	94309094
136	NC_007973	TGGCG	2	10	155337	155346	0 %	20 %	60 %	20 %	94309096
137	NC_007973	CGCGA	2	10	156206	156215	20 %	0 %	40 %	40 %	94309096
138	NC_007973	GCTTG	2	10	156739	156748	0 %	40 %	40 %	20 %	94309097
139	NC_007973	GCCGG	2	10	157523	157532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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265	NC_007973	CAGCT	2	10	300204	300213	20 %	20 %	20 %	40 %	94309228
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