MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 10666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	GGCA	2	8	117	124	25 %	0 %	50 %	25 %	94308946
2	NC_007973	TGCG	2	8	295	302	0 %	25 %	50 %	25 %	94308946
3	NC_007973	AGCA	2	8	378	385	50 %	0 %	25 %	25 %	94308946
4	NC_007973	TGGC	2	8	459	466	0 %	25 %	50 %	25 %	94308946
5	NC_007973	CCAG	2	8	552	559	25 %	0 %	25 %	50 %	94308946
6	NC_007973	CACC	2	8	651	658	25 %	0 %	0 %	75 %	94308946
7	NC_007973	GCCG	2	8	784	791	0 %	0 %	50 %	50 %	94308946
8	NC_007973	CGCA	2	8	1172	1179	25 %	0 %	25 %	50 %	94308946
9	NC_007973	CGAT	2	8	1503	1510	25 %	25 %	25 %	25 %	94308946
10	NC_007973	TGCG	2	8	1857	1864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007973	AGCC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007973	TCCT	2	8	2349	2356	0 %	50 %	0 %	50 %	94308947
13	NC_007973	CGAC	2	8	2359	2366	25 %	0 %	25 %	50 %	94308947
14	NC_007973	CGAC	2	8	2734	2741	25 %	0 %	25 %	50 %	94308947
15	NC_007973	GCGT	2	8	3073	3080	0 %	25 %	50 %	25 %	94308947
16	NC_007973	TCGA	2	8	3683	3690	25 %	25 %	25 %	25 %	94308948
17	NC_007973	CGAC	2	8	4083	4090	25 %	0 %	25 %	50 %	94308948
18	NC_007973	GCCT	2	8	4641	4648	0 %	25 %	25 %	50 %	94308948
19	NC_007973	TTCG	2	8	7178	7185	0 %	50 %	25 %	25 %	94308949
20	NC_007973	GCAA	2	8	8191	8198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007973	CCGC	2	8	8546	8553	0 %	0 %	25 %	75 %	94308950
22	NC_007973	CGTG	2	8	8886	8893	0 %	25 %	50 %	25 %	94308950
23	NC_007973	CCAT	2	8	9175	9182	25 %	25 %	0 %	50 %	94308950
24	NC_007973	GCCG	2	8	9413	9420	0 %	0 %	50 %	50 %	94308950
25	NC_007973	GCGT	2	8	9788	9795	0 %	25 %	50 %	25 %	94308950
26	NC_007973	CATC	2	8	9845	9852	25 %	25 %	0 %	50 %	94308950
27	NC_007973	GCCG	2	8	10590	10597	0 %	0 %	50 %	50 %	94308951
28	NC_007973	GCCT	2	8	10962	10969	0 %	25 %	25 %	50 %	94308951
29	NC_007973	TCCT	2	8	11192	11199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007973	TGAA	2	8	11261	11268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007973	CGCT	2	8	11387	11394	0 %	25 %	25 %	50 %	94308952
32	NC_007973	TGGG	2	8	11778	11785	0 %	25 %	75 %	0 %	94308952
33	NC_007973	CGGC	2	8	11875	11882	0 %	0 %	50 %	50 %	94308952
34	NC_007973	GGCC	2	8	11942	11949	0 %	0 %	50 %	50 %	94308952
35	NC_007973	CCGA	2	8	12027	12034	25 %	0 %	25 %	50 %	94308952
36	NC_007973	CCAT	2	8	12455	12462	25 %	25 %	0 %	50 %	94308953
37	NC_007973	AGCG	2	8	14981	14988	25 %	0 %	50 %	25 %	94308955
38	NC_007973	ACGT	2	8	16644	16651	25 %	25 %	25 %	25 %	94308957
39	NC_007973	CCCA	2	8	16757	16764	25 %	0 %	0 %	75 %	94308957
40	NC_007973	TCGA	2	8	16982	16989	25 %	25 %	25 %	25 %	94308957
41	NC_007973	GAAG	2	8	18621	18628	50 %	0 %	50 %	0 %	94308959
42	NC_007973	CTTG	2	8	18684	18691	0 %	50 %	25 %	25 %	94308959
43	NC_007973	CCGA	2	8	18709	18716	25 %	0 %	25 %	50 %	94308959
44	NC_007973	GGCC	2	8	19000	19007	0 %	0 %	50 %	50 %	94308960
45	NC_007973	TGCG	2	8	19166	19173	0 %	25 %	50 %	25 %	94308960
46	NC_007973	GTGC	2	8	19539	19546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007973	CGTG	2	8	19936	19943	0 %	25 %	50 %	25 %	94308961
48	NC_007973	GGCC	2	8	20243	20250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007973	GCAT	2	8	20297	20304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007973	CCCT	2	8	20355	20362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_007973	GCCA	2	8	20387	20394	25 %	0 %	25 %	50 %	94308962
52	NC_007973	TCCC	2	8	20426	20433	0 %	25 %	0 %	75 %	94308962
53	NC_007973	GCTG	2	8	20928	20935	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
54	NC_007973	CGGC	2	8	21013	21020	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
55	NC_007973	GCTG	2	8	21478	21485	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
56	NC_007973	GCTG	2	8	21805	21812	0 %	25 %	50 %	25 %	94308962
57	NC_007973	CGGC	2	8	21846	21853	0 %	0 %	50 %	50 %	94308962
58	NC_007973	CTGG	2	8	22108	22115	0 %	25 %	50 %	25 %	94308963
59	NC_007973	GCTG	2	8	22125	22132	0 %	25 %	50 %	25 %	94308963
60	NC_007973	GCGG	2	8	22865	22872	0 %	0 %	75 %	25 %	94308964
61	NC_007973	TGTC	2	8	22876	22883	0 %	50 %	25 %	25 %	94308964
62	NC_007973	GATC	2	8	22972	22979	25 %	25 %	25 %	25 %	94308964
63	NC_007973	CCCA	2	8	23032	23039	25 %	0 %	0 %	75 %	94308964
64	NC_007973	GCTG	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	94308964
65	NC_007973	CAGG	2	8	23171	23178	25 %	0 %	50 %	25 %	94308964
66	NC_007973	CGCC	2	8	23395	23402	0 %	0 %	25 %	75 %	94308964
67	NC_007973	GCCC	2	8	23590	23597	0 %	0 %	25 %	75 %	94308964
68	NC_007973	ACCG	2	8	23961	23968	25 %	0 %	25 %	50 %	94308965
69	NC_007973	GTCT	2	8	24859	24866	0 %	50 %	25 %	25 %	94308966
70	NC_007973	GCCG	2	8	25297	25304	0 %	0 %	50 %	50 %	94308966
71	NC_007973	GCGG	2	8	25316	25323	0 %	0 %	75 %	25 %	94308966
72	NC_007973	CGTG	2	8	25780	25787	0 %	25 %	50 %	25 %	94308966
73	NC_007973	CAGC	2	8	26323	26330	25 %	0 %	25 %	50 %	94308967
74	NC_007973	CGGG	2	8	26393	26400	0 %	0 %	75 %	25 %	94308967
75	NC_007973	TCGC	2	8	27301	27308	0 %	25 %	25 %	50 %	94308968
76	NC_007973	GGCT	2	8	27467	27474	0 %	25 %	50 %	25 %	94308968
77	NC_007973	CGGC	2	8	27624	27631	0 %	0 %	50 %	50 %	94308968
78	NC_007973	GGGC	2	8	27873	27880	0 %	0 %	75 %	25 %	94308968
79	NC_007973	CGGC	2	8	28137	28144	0 %	0 %	50 %	50 %	94308968
80	NC_007973	TCCC	2	8	28308	28315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_007973	CAGC	2	8	28526	28533	25 %	0 %	25 %	50 %	94308969
82	NC_007973	CAGC	2	8	28571	28578	25 %	0 %	25 %	50 %	94308969
83	NC_007973	TCGA	2	8	29446	29453	25 %	25 %	25 %	25 %	94308969
84	NC_007973	GCCA	2	8	29556	29563	25 %	0 %	25 %	50 %	94308969
85	NC_007973	TGCC	2	8	29858	29865	0 %	25 %	25 %	50 %	94308970
86	NC_007973	CCTG	2	8	29893	29900	0 %	25 %	25 %	50 %	94308970
87	NC_007973	CCTG	2	8	29951	29958	0 %	25 %	25 %	50 %	94308970
88	NC_007973	CGGC	2	8	29996	30003	0 %	0 %	50 %	50 %	94308970
89	NC_007973	ATGA	2	8	30848	30855	50 %	25 %	25 %	0 %	94308971
90	NC_007973	CGGC	2	8	31329	31336	0 %	0 %	50 %	50 %	94308972
91	NC_007973	GGCT	2	8	31975	31982	0 %	25 %	50 %	25 %	94308972
92	NC_007973	CGCT	2	8	32022	32029	0 %	25 %	25 %	50 %	94308972
93	NC_007973	GCGG	2	8	32043	32050	0 %	0 %	75 %	25 %	94308972
94	NC_007973	TCCT	2	8	32087	32094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007973	GCCA	2	8	32652	32659	25 %	0 %	25 %	50 %	94308973
96	NC_007973	TGCG	2	8	33192	33199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007973	CCAC	2	8	33585	33592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_007973	GAAC	2	8	33728	33735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007973	CCAG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007973	CAAG	2	8	33984	33991	50 %	0 %	25 %	25 %	335055474
101	NC_007973	GCAA	2	8	34367	34374	50 %	0 %	25 %	25 %	94308976
102	NC_007973	GGAA	2	8	34490	34497	50 %	0 %	50 %	0 %	94308976
103	NC_007973	CAAC	2	8	34595	34602	50 %	0 %	0 %	50 %	94308976
104	NC_007973	GGCT	2	8	34711	34718	0 %	25 %	50 %	25 %	94308976
105	NC_007973	ACCG	2	8	34861	34868	25 %	0 %	25 %	50 %	94308976
106	NC_007973	TCGC	2	8	34997	35004	0 %	25 %	25 %	50 %	94308976
107	NC_007973	CAAG	2	8	35617	35624	50 %	0 %	25 %	25 %	335055475
108	NC_007973	CGGC	2	8	36062	36069	0 %	0 %	50 %	50 %	94308978
109	NC_007973	GCCG	2	8	36630	36637	0 %	0 %	50 %	50 %	94308979
110	NC_007973	TTCG	2	8	37028	37035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007973	CGTC	2	8	37505	37512	0 %	25 %	25 %	50 %	94308980
112	NC_007973	CGGC	2	8	37966	37973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007973	CTGG	2	8	38201	38208	0 %	25 %	50 %	25 %	94308981
114	NC_007973	TCAG	2	8	39263	39270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007973	CCGG	2	8	39524	39531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007973	GTGC	2	8	39716	39723	0 %	25 %	50 %	25 %	94308983
117	NC_007973	TCGA	2	8	40589	40596	25 %	25 %	25 %	25 %	94308983
118	NC_007973	GCAG	2	8	40615	40622	25 %	0 %	50 %	25 %	94308983
119	NC_007973	ACGC	2	8	40870	40877	25 %	0 %	25 %	50 %	94308983
120	NC_007973	GCAC	2	8	41019	41026	25 %	0 %	25 %	50 %	94308983
121	NC_007973	CGGC	2	8	41220	41227	0 %	0 %	50 %	50 %	94308983
122	NC_007973	TGCG	2	8	41642	41649	0 %	25 %	50 %	25 %	94308984
123	NC_007973	CGAA	2	8	42159	42166	50 %	0 %	25 %	25 %	94308984
124	NC_007973	CCAA	2	8	43238	43245	50 %	0 %	0 %	50 %	94308984
125	NC_007973	CCGC	2	8	43498	43505	0 %	0 %	25 %	75 %	94308984
126	NC_007973	CGGT	2	8	43833	43840	0 %	25 %	50 %	25 %	94308985
127	NC_007973	GACG	2	8	43969	43976	25 %	0 %	50 %	25 %	94308985
128	NC_007973	CGCC	2	8	44477	44484	0 %	0 %	25 %	75 %	94308986
129	NC_007973	CGGC	2	8	44569	44576	0 %	0 %	50 %	50 %	94308986
130	NC_007973	GTGG	2	8	44934	44941	0 %	25 %	75 %	0 %	94308986
131	NC_007973	ATCG	2	8	45197	45204	25 %	25 %	25 %	25 %	94308986
132	NC_007973	CGGC	2	8	45608	45615	0 %	0 %	50 %	50 %	94308986
133	NC_007973	ACGG	2	8	46243	46250	25 %	0 %	50 %	25 %	94308986
134	NC_007973	GGCG	2	8	46459	46466	0 %	0 %	75 %	25 %	94308986
135	NC_007973	TCGA	2	8	46572	46579	25 %	25 %	25 %	25 %	94308986
136	NC_007973	TGGC	2	8	46811	46818	0 %	25 %	50 %	25 %	94308986
137	NC_007973	TCGG	2	8	46870	46877	0 %	25 %	50 %	25 %	94308986
138	NC_007973	GGCA	2	8	46988	46995	25 %	0 %	50 %	25 %	94308986
139	NC_007973	CGTG	2	8	47373	47380	0 %	25 %	50 %	25 %	94308987
140	NC_007973	GCCT	2	8	47486	47493	0 %	25 %	25 %	50 %	94308987
141	NC_007973	GCAC	2	8	47563	47570	25 %	0 %	25 %	50 %	94308987
142	NC_007973	AGCC	2	8	48137	48144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_007973	TGGC	2	8	48985	48992	0 %	25 %	50 %	25 %	94308989
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