MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 1215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	TGCG	2	8	1857	1864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007973	AGCC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007973	GCAA	2	8	8191	8198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007973	TCCT	2	8	11192	11199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007973	TGAA	2	8	11261	11268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007973	GTGC	2	8	19539	19546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007973	GGCC	2	8	20243	20250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007973	GCAT	2	8	20297	20304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007973	CCCT	2	8	20355	20362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007973	TCCC	2	8	28308	28315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_007973	TCCT	2	8	32087	32094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007973	TGCG	2	8	33192	33199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007973	CCAC	2	8	33585	33592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_007973	GAAC	2	8	33728	33735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007973	CCAG	2	8	33891	33898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007973	TTCG	2	8	37028	37035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007973	CGGC	2	8	37966	37973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007973	TCAG	2	8	39263	39270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007973	CCGG	2	8	39524	39531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007973	AGCC	2	8	48137	48144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007973	CGTG	2	8	55182	55189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007973	CGCA	2	8	58375	58382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007973	GCCG	2	8	58440	58447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007973	CGTA	2	8	70142	70149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007973	CTCA	2	8	72919	72926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007973	GAAA	2	8	83635	83642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007973	GGTG	2	8	91126	91133	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007973	AAAC	2	8	92565	92572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007973	GGGC	2	8	97740	97747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007973	TCCA	2	8	97930	97937	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007973	GCCG	2	8	100722	100729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007973	CCGG	2	8	105199	105206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007973	AACG	2	8	108828	108835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007973	GGTT	2	8	118223	118230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007973	GCGG	2	8	120140	120147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007973	TGCG	2	8	130338	130345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007973	AGGC	2	8	130384	130391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007973	CCGT	2	8	133035	133042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007973	GGGA	2	8	133134	133141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007973	ATAG	2	8	135994	136001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007973	GTCC	2	8	137170	137177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007973	GCCG	2	8	140443	140450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007973	CATG	2	8	147405	147412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007973	TGCC	2	8	147489	147496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007973	GGCA	2	8	149340	149347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007973	GGCT	2	8	151509	151516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007973	AGCC	2	8	164230	164237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007973	ACGC	2	8	167693	167700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007973	TGCG	2	8	169562	169569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007973	TCGA	2	8	169574	169581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007973	CAGA	2	8	173278	173285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007973	CCGC	2	8	177522	177529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_007973	GCCG	2	8	179109	179116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007973	CCAA	2	8	179158	179165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007973	GCTC	2	8	185477	185484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007973	GGCC	2	8	187608	187615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007973	GCCG	2	8	202749	202756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007973	GTAA	2	8	208444	208451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007973	ACAT	2	8	211752	211759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007973	ATTC	2	8	211790	211797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007973	TGGT	2	8	211892	211899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007973	CGGC	2	8	212639	212646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007973	CGCC	2	8	220827	220834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_007973	GGCG	2	8	220836	220843	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007973	CAGC	2	8	221001	221008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007973	TGGG	2	8	224332	224339	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007973	GAAG	3	12	224879	224890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007973	GCTG	2	8	225847	225854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007973	AACC	2	8	226756	226763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007973	AGAC	2	8	234045	234052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007973	TGCT	2	8	237000	237007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007973	GCGG	2	8	239988	239995	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007973	GCAG	2	8	250227	250234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007973	GGAT	2	8	250237	250244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007973	ACAG	2	8	250943	250950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007973	TCAA	2	8	252284	252291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007973	TGCC	2	8	253029	253036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007973	GGCG	2	8	255156	255163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007973	GGTG	2	8	255268	255275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007973	GTCA	2	8	256458	256465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007973	GGGC	2	8	258796	258803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007973	GGAT	2	8	258861	258868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007973	CTGC	2	8	261227	261234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007973	CAAA	2	8	265927	265934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007973	GGGT	2	8	269852	269859	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007973	GGCT	2	8	270238	270245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007973	AGGC	2	8	270388	270395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007973	CTGA	2	8	270616	270623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007973	ATCC	2	8	272577	272584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007973	CCGG	2	8	281335	281342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007973	GCGG	2	8	283375	283382	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007973	GACC	2	8	292988	292995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007973	CGCC	2	8	294664	294671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_007973	AGGA	2	8	302620	302627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007973	TCTT	2	8	303733	303740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007973	GAAC	2	8	307285	307292	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007973	TACG	2	8	309348	309355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007973	CCGG	2	8	309487	309494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007973	GGCC	2	8	316177	316184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007973	CTAT	2	8	318174	318181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007973	CAGG	2	8	318596	318603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007973	TTTC	2	8	326661	326668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007973	TCCG	2	8	334599	334606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007973	TTAG	2	8	334648	334655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007973	GCAG	2	8	335625	335632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007973	CGGA	2	8	337122	337129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007973	GATG	2	8	337474	337481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007973	CAGC	2	8	340279	340286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007973	TGCA	2	8	340876	340883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007973	AAGG	2	8	341981	341988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007973	GATG	2	8	342030	342037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007973	CGCA	2	8	345861	345868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007973	ACTG	2	8	346165	346172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007973	CCGT	2	8	353940	353947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007973	GCCG	2	8	354007	354014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007973	GGGC	2	8	355720	355727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007973	AGAC	2	8	355842	355849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007973	TGGA	2	8	356899	356906	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007973	AATT	3	12	371397	371408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007973	TGAG	2	8	371427	371434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007973	GCAG	2	8	379648	379655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007973	TCCA	2	8	387853	387860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007973	CAAT	2	8	392857	392864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007973	TGCC	2	8	393409	393416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007973	CGGC	2	8	395376	395383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007973	ATTG	2	8	395857	395864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007973	TCGG	2	8	396629	396636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007973	CGGT	2	8	401919	401926	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007973	CCGT	2	8	409517	409524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007973	TGCC	2	8	409653	409660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007973	CTTC	2	8	417074	417081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007973	AAGC	2	8	417885	417892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007973	GACG	2	8	430350	430357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007973	GCCG	2	8	435923	435930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007973	TTTG	2	8	436058	436065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007973	AAGC	2	8	438205	438212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007973	CCAG	2	8	438275	438282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007973	ACGA	2	8	450631	450638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007973	ATCG	2	8	450694	450701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007973	GACC	2	8	460754	460761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007973	GAGT	2	8	482152	482159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007973	CGGC	2	8	482209	482216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007973	GGCC	2	8	486944	486951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007973	CGTT	2	8	487693	487700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007973	GCCT	2	8	490667	490674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007973	GGCC	2	8	495410	495417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007973	GCCG	2	8	495421	495428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007973	ATCC	2	8	495551	495558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007973	TGCG	2	8	497439	497446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007973	CGGG	2	8	499578	499585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007973	AGGA	2	8	500785	500792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_007973	GGCC	2	8	1790650	1790657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
488	NC_007973	GGTG	2	8	1791925	1791932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_007973	TGCA	2	8	1794229	1794236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_007973	TCCG	2	8	1803321	1803328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_007973	AGCT	2	8	1804021	1804028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_007973	CGGG	2	8	1804515	1804522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_007973	GACA	2	8	1806996	1807003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_007973	TGGT	2	8	1809615	1809622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_007973	GTGC	2	8	1809656	1809663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_007973	GACG	2	8	1817082	1817089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_007973	TGGC	2	8	1817302	1817309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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