MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 64785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	AGA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007973	CGC	2	6	153	158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
3	NC_007973	CGA	2	6	202	207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
4	NC_007973	GGC	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
5	NC_007973	GCG	2	6	590	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
6	NC_007973	GCA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
7	NC_007973	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
8	NC_007973	GCA	3	9	796	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
9	NC_007973	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308946
10	NC_007973	CGG	2	6	952	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
11	NC_007973	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308946
12	NC_007973	CGA	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
13	NC_007973	CTG	3	9	1130	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308946
14	NC_007973	GAT	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308946
15	NC_007973	TTC	2	6	1154	1159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
16	NC_007973	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
17	NC_007973	TTC	2	6	1187	1192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
18	NC_007973	ATC	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308946
19	NC_007973	CGA	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308946
20	NC_007973	GCC	2	6	1324	1329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
21	NC_007973	TGA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308946
22	NC_007973	GCC	3	9	1367	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308946
23	NC_007973	CTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308946
24	NC_007973	CTG	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308946
25	NC_007973	AGA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
26	NC_007973	ACA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308946
27	NC_007973	AAG	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
28	NC_007973	AGA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308946
29	NC_007973	GTT	2	6	1720	1725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94308946
30	NC_007973	CGG	2	6	1726	1731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308946
31	NC_007973	CAC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308946
32	NC_007973	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007973	CGA	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007973	TAC	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007973	GGC	2	6	2047	2052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007973	ACG	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007973	CTG	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
38	NC_007973	GCC	2	6	2290	2295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
39	NC_007973	CTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
40	NC_007973	ACC	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308947
41	NC_007973	GCT	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
42	NC_007973	GAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
43	NC_007973	GCC	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
44	NC_007973	AGA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
45	NC_007973	CTG	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
46	NC_007973	GCA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308947
47	NC_007973	TAC	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308947
48	NC_007973	TGC	2	6	2695	2700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
49	NC_007973	TGG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308947
50	NC_007973	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308947
51	NC_007973	GCG	2	6	2761	2766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308947
52	NC_007973	ATC	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308947
53	NC_007973	CTG	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
54	NC_007973	GAT	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308947
55	NC_007973	GCC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308947
56	NC_007973	TGG	2	6	2941	2946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308947
57	NC_007973	CCA	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308947
58	NC_007973	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94308947
59	NC_007973	GAC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308947
60	NC_007973	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308947
61	NC_007973	CCA	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007973	GCA	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007973	CGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007973	CAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
65	NC_007973	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
66	NC_007973	CAC	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308948
67	NC_007973	CCG	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
68	NC_007973	CGA	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
69	NC_007973	CGG	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
70	NC_007973	GGC	2	6	3893	3898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
71	NC_007973	CGA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
72	NC_007973	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308948
73	NC_007973	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308948
74	NC_007973	TCG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
75	NC_007973	AAC	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308948
76	NC_007973	CGG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
77	NC_007973	TCA	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
78	NC_007973	GAA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308948
79	NC_007973	AAG	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308948
80	NC_007973	CGA	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
81	NC_007973	TCC	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94308948
82	NC_007973	TCG	2	6	4659	4664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
83	NC_007973	CTG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
84	NC_007973	ACG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
85	NC_007973	ATC	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
86	NC_007973	TCG	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
87	NC_007973	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
88	NC_007973	TCG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
89	NC_007973	GGC	2	6	4889	4894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308948
90	NC_007973	AGG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94308948
91	NC_007973	ACC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308948
92	NC_007973	CAT	4	12	5080	5091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
93	NC_007973	CTG	3	9	5129	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
94	NC_007973	TTC	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308948
95	NC_007973	CAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
96	NC_007973	GCC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
97	NC_007973	GAC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
98	NC_007973	GCC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
99	NC_007973	GCC	2	6	5385	5390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
100	NC_007973	TCG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
101	NC_007973	CGC	3	9	5458	5466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
102	NC_007973	GCT	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308948
103	NC_007973	ACG	3	9	5544	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
104	NC_007973	CCG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
105	NC_007973	CGA	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
106	NC_007973	TGA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308948
107	NC_007973	CAT	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308948
108	NC_007973	CGC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
109	NC_007973	CCA	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308948
110	NC_007973	AGC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
111	NC_007973	GCC	2	6	5910	5915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
112	NC_007973	CGC	2	6	5944	5949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308948
113	NC_007973	CGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308948
114	NC_007973	TGG	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308948
115	NC_007973	GCC	2	6	6165	6170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007973	TGC	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007973	GCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007973	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007973	ACG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007973	GCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007973	TGC	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007973	CAA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007973	GTC	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007973	GCG	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007973	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007973	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007973	ATT	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007973	GTG	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308949
129	NC_007973	CAA	2	6	7160	7165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308949
130	NC_007973	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308949
131	NC_007973	AAG	2	6	7242	7247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308949
132	NC_007973	GTC	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308949
133	NC_007973	GGA	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94308949
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262	NC_007973	TCG	2	6	15165	15170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308956
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