MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 4956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007973	AGA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007973	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007973	CGA	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007973	TAC	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007973	GGC	2	6	2047	2052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007973	ACG	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007973	CCA	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007973	GCA	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007973	CGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007973	GCC	2	6	6165	6170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007973	TGC	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007973	GCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007973	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007973	ACG	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007973	GCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007973	TGC	2	6	6425	6430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007973	CAA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007973	GTC	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007973	GCG	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007973	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007973	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007973	ATT	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007973	AGG	2	6	8107	8112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007973	CGA	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007973	GCA	2	6	8289	8294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007973	TGC	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007973	TTC	2	6	11200	11205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007973	GTC	2	6	11254	11259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007973	ATG	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007973	GGC	2	6	17352	17357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007973	AGG	2	6	17767	17772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007973	GCC	2	6	17778	17783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_007973	CGC	2	6	17831	17836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007973	TCC	2	6	17854	17859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007973	CAA	2	6	19703	19708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007973	CTC	2	6	22039	22044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007973	ACA	2	6	22813	22818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007973	GCG	2	6	22827	22832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007973	TCG	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007973	TTC	2	6	24733	24738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007973	GGC	2	6	26943	26948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007973	TCT	2	6	29659	29664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007973	GGC	3	9	31274	31282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007973	GTC	2	6	32219	32224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007973	CGA	2	6	32255	32260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007973	CAA	2	6	33077	33082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007973	AGA	2	6	33085	33090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007973	TTG	2	6	33165	33170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007973	GCA	2	6	33177	33182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007973	GCG	2	6	33239	33244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007973	TTG	2	6	33249	33254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007973	GCA	2	6	33378	33383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007973	TCG	2	6	33418	33423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007973	GAC	2	6	33425	33430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007973	GGC	2	6	33431	33436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007973	GTT	2	6	33437	33442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007973	TGT	2	6	33448	33453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007973	ACC	2	6	33476	33481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007973	CAG	2	6	33526	33531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007973	TGC	2	6	33543	33548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007973	TTG	2	6	33549	33554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007973	GTT	2	6	33752	33757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007973	GTA	2	6	33779	33784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007973	GAA	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007973	CGA	2	6	35223	35228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007973	GTT	2	6	35286	35291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007973	GTT	2	6	35367	35372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007973	GCC	2	6	35448	35453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007973	TTC	2	6	35491	35496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007973	CGC	2	6	35573	35578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007973	CTG	2	6	35816	35821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007973	AGA	2	6	35860	35865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007973	TGC	2	6	37042	37047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007973	CGT	2	6	37931	37936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007973	TCG	2	6	39074	39079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007973	CCT	2	6	39122	39127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007973	CAG	2	6	39158	39163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007973	TCT	2	6	39171	39176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007973	TGG	2	6	44261	44266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007973	AAT	2	6	48027	48032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007973	GAA	2	6	48036	48041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007973	CTT	2	6	52527	52532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007973	GTT	2	6	54011	54016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007973	TCG	2	6	54062	54067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007973	GAT	2	6	57174	57179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007973	GTG	2	6	57189	57194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007973	GCG	2	6	57530	57535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007973	CGG	3	9	57629	57637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007973	TCG	2	6	57686	57691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007973	ATC	2	6	58040	58045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007973	TCC	2	6	58071	58076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007973	GGC	2	6	58127	58132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007973	TGG	2	6	58192	58197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007973	GCG	2	6	58210	58215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007973	GGC	2	6	58434	58439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007973	ACA	2	6	58465	58470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007973	GTG	2	6	59550	59555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007973	CAC	2	6	61212	61217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007973	GCC	2	6	61218	61223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007973	CTC	2	6	65510	65515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007973	TCG	2	6	67548	67553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007973	GCG	2	6	68163	68168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007973	GCC	2	6	68184	68189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007973	CGA	2	6	68193	68198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007973	CAG	2	6	70162	70167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007973	GGT	2	6	70180	70185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007973	TCT	2	6	70204	70209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007973	TCG	2	6	70305	70310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007973	ACG	2	6	72101	72106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007973	AAC	2	6	72113	72118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007973	ACG	2	6	72911	72916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007973	GCC	2	6	80367	80372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007973	GGC	2	6	80404	80409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007973	ACG	2	6	83092	83097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007973	TCT	2	6	83104	83109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007973	ATT	2	6	84604	84609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007973	GTT	2	6	84670	84675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007973	GTC	2	6	86869	86874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007973	GAC	2	6	86890	86895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007973	GAA	2	6	87740	87745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007973	GCC	2	6	87753	87758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007973	GTT	2	6	87925	87930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007973	GGC	2	6	88017	88022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007973	GGC	2	6	90060	90065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007973	TGG	2	6	90075	90080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007973	AGT	2	6	92033	92038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007973	GCA	2	6	92089	92094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007973	GCA	2	6	92198	92203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007973	AGG	2	6	92231	92236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007973	GCG	3	9	92533	92541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007973	TCT	2	6	92596	92601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007973	CCG	2	6	93142	93147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007973	CCG	2	6	93207	93212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007973	AGC	2	6	97233	97238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007973	GCA	2	6	97899	97904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007973	CGT	2	6	98631	98636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007973	CAT	2	6	98755	98760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007973	TGC	2	6	99188	99193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_007973	GCG	2	6	100661	100666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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