MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007972	GGAA	2	8	119	126	50 %	0 %	50 %	0 %	94152722
2	NC_007972	GGCG	2	8	531	538	0 %	0 %	75 %	25 %	94152722
3	NC_007972	GATC	2	8	1949	1956	25 %	25 %	25 %	25 %	291434859
4	NC_007972	AAAG	2	8	2069	2076	75 %	0 %	25 %	0 %	291434859
5	NC_007972	CAGA	2	8	2488	2495	50 %	0 %	25 %	25 %	291434860
6	NC_007972	GCCG	2	8	2895	2902	0 %	0 %	50 %	50 %	291434860
7	NC_007972	CCGC	2	8	3176	3183	0 %	0 %	25 %	75 %	291434860
8	NC_007972	CGGC	2	8	3480	3487	0 %	0 %	50 %	50 %	291434860
9	NC_007972	GCGA	2	8	3531	3538	25 %	0 %	50 %	25 %	291434860
10	NC_007972	CGAA	2	8	3630	3637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007972	CTGC	2	8	3752	3759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007972	GATC	2	8	3910	3917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007972	GACC	2	8	4409	4416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007972	GGCA	2	8	4757	4764	25 %	0 %	50 %	25 %	291434861
15	NC_007972	GCAA	2	8	5237	5244	50 %	0 %	25 %	25 %	291434861
16	NC_007972	CGCC	2	8	6112	6119	0 %	0 %	25 %	75 %	291434862
17	NC_007972	GCGT	2	8	6266	6273	0 %	25 %	50 %	25 %	291434863
18	NC_007972	GCGT	2	8	6446	6453	0 %	25 %	50 %	25 %	291434863
19	NC_007972	TGCC	2	8	6685	6692	0 %	25 %	25 %	50 %	291434863
20	NC_007972	CCGA	2	8	6899	6906	25 %	0 %	25 %	50 %	291434863
21	NC_007972	CGGC	2	8	7143	7150	0 %	0 %	50 %	50 %	291434863
22	NC_007972	GCCA	2	8	7418	7425	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007972	CCGT	2	8	7560	7567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007972	CGTC	2	8	7744	7751	0 %	25 %	25 %	50 %	291434864
25	NC_007972	CCGA	2	8	7839	7846	25 %	0 %	25 %	50 %	291434864
26	NC_007972	GCGG	2	8	8168	8175	0 %	0 %	75 %	25 %	291434864
27	NC_007972	AAGA	2	8	8536	8543	75 %	0 %	25 %	0 %	291434865
28	NC_007972	ATTG	2	8	9164	9171	25 %	50 %	25 %	0 %	291434866
29	NC_007972	GCCA	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	291434867
30	NC_007972	TGCT	2	8	9670	9677	0 %	50 %	25 %	25 %	291434867
31	NC_007972	GGTC	2	8	9882	9889	0 %	25 %	50 %	25 %	291434868
32	NC_007972	CGGA	2	8	9922	9929	25 %	0 %	50 %	25 %	291434868
33	NC_007972	GAGC	2	8	10798	10805	25 %	0 %	50 %	25 %	291434869
34	NC_007972	TGAG	2	8	11014	11021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007972	ATCC	2	8	11082	11089	25 %	25 %	0 %	50 %	291434870
36	NC_007972	GTGA	2	8	11546	11553	25 %	25 %	50 %	0 %	291434870
37	NC_007972	CCGA	2	8	11664	11671	25 %	0 %	25 %	50 %	291434870
38	NC_007972	GAGG	2	8	11730	11737	25 %	0 %	75 %	0 %	291434870
39	NC_007972	CTTT	2	8	13725	13732	0 %	75 %	0 %	25 %	291434871
40	NC_007972	AAGG	2	8	13785	13792	50 %	0 %	50 %	0 %	291434871
41	NC_007972	GCTT	2	8	14004	14011	0 %	50 %	25 %	25 %	291434871
42	NC_007972	TCGT	2	8	14187	14194	0 %	50 %	25 %	25 %	291434871
43	NC_007972	CGTC	2	8	14216	14223	0 %	25 %	25 %	50 %	291434871
44	NC_007972	GTAG	2	8	14462	14469	25 %	25 %	50 %	0 %	291434871
45	NC_007972	TTGG	2	8	14924	14931	0 %	50 %	50 %	0 %	291434871
46	NC_007972	GCCA	3	12	15002	15013	25 %	0 %	25 %	50 %	291434871
47	NC_007972	ACAA	2	8	15232	15239	75 %	0 %	0 %	25 %	291434871
48	NC_007972	CCCT	2	8	16548	16555	0 %	25 %	0 %	75 %	291434872
49	NC_007972	CGGC	2	8	16770	16777	0 %	0 %	50 %	50 %	291434872
50	NC_007972	AACG	2	8	17274	17281	50 %	0 %	25 %	25 %	291434872
51	NC_007972	AGGC	2	8	17600	17607	25 %	0 %	50 %	25 %	291434872
52	NC_007972	TCTG	2	8	17706	17713	0 %	50 %	25 %	25 %	291434872
53	NC_007972	CTCG	2	8	18703	18710	0 %	25 %	25 %	50 %	291434874
54	NC_007972	TCGA	2	8	19366	19373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007972	GACA	2	8	19988	19995	50 %	0 %	25 %	25 %	291434876
56	NC_007972	GTGA	2	8	20363	20370	25 %	25 %	50 %	0 %	291434876
57	NC_007972	TGGC	2	8	20429	20436	0 %	25 %	50 %	25 %	291434876
58	NC_007972	TGGA	2	8	20442	20449	25 %	25 %	50 %	0 %	291434876
59	NC_007972	AGCC	2	8	20802	20809	25 %	0 %	25 %	50 %	291434876
60	NC_007972	GCGT	2	8	21452	21459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007972	CAAT	2	8	21719	21726	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007972	GAGC	2	8	21963	21970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007972	TGCA	2	8	22339	22346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007972	CGGC	2	8	22646	22653	0 %	0 %	50 %	50 %	291434878
65	NC_007972	CTGG	2	8	22658	22665	0 %	25 %	50 %	25 %	291434878
66	NC_007972	GCCT	2	8	22704	22711	0 %	25 %	25 %	50 %	291434878
67	NC_007972	GTCG	2	8	22791	22798	0 %	25 %	50 %	25 %	291434878
68	NC_007972	CTGC	2	8	22850	22857	0 %	25 %	25 %	50 %	291434878
69	NC_007972	GCTG	2	8	22936	22943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007972	CACC	2	8	24466	24473	25 %	0 %	0 %	75 %	291434879
71	NC_007972	GCCT	2	8	25091	25098	0 %	25 %	25 %	50 %	291434880
72	NC_007972	GGCG	2	8	25204	25211	0 %	0 %	75 %	25 %	291434880
73	NC_007972	TGGC	2	8	25516	25523	0 %	25 %	50 %	25 %	291434881
74	NC_007972	CATC	2	8	25741	25748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007972	GATT	2	8	26240	26247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007972	GGCA	2	8	26579	26586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007972	GGCG	2	8	27267	27274	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007972	CCAG	2	8	27314	27321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007972	CCGG	2	8	27755	27762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007972	GATG	2	8	28566	28573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007972	GACG	2	8	28916	28923	25 %	0 %	50 %	25 %	291434882
82	NC_007972	ACGC	2	8	29161	29168	25 %	0 %	25 %	50 %	291434883
83	NC_007972	CAGG	2	8	29569	29576	25 %	0 %	50 %	25 %	291434883
84	NC_007972	CCGC	2	8	29760	29767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007972	CGGA	2	8	29845	29852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007972	GCGG	2	8	30228	30235	0 %	0 %	75 %	25 %	291434884
87	NC_007972	CATC	2	8	30254	30261	25 %	25 %	0 %	50 %	291434884
88	NC_007972	CGGC	2	8	30438	30445	0 %	0 %	50 %	50 %	291434885
89	NC_007972	GAAC	2	8	30499	30506	50 %	0 %	25 %	25 %	291434885
90	NC_007972	GGCG	2	8	30704	30711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007972	TTCG	2	8	31026	31033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007972	CGTT	2	8	31077	31084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007972	CGCT	2	8	31137	31144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007972	GGCA	2	8	31943	31950	25 %	0 %	50 %	25 %	291434887
95	NC_007972	CCTC	2	8	32111	32118	0 %	25 %	0 %	75 %	291434888
96	NC_007972	GATG	2	8	32692	32699	25 %	25 %	50 %	0 %	94152590
97	NC_007972	CCGT	2	8	33100	33107	0 %	25 %	25 %	50 %	94152590
98	NC_007972	GCGA	2	8	33234	33241	25 %	0 %	50 %	25 %	94152590
99	NC_007972	AGCC	2	8	33437	33444	25 %	0 %	25 %	50 %	94152590
100	NC_007972	CGGC	2	8	33640	33647	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
101	NC_007972	CGGC	2	8	33688	33695	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
102	NC_007972	GCCG	2	8	33752	33759	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
103	NC_007972	GGCT	2	8	34167	34174	0 %	25 %	50 %	25 %	94152591
104	NC_007972	GCGG	2	8	34303	34310	0 %	0 %	75 %	25 %	94152591
105	NC_007972	CCGA	2	8	34472	34479	25 %	0 %	25 %	50 %	94152591
106	NC_007972	CCGG	2	8	34751	34758	0 %	0 %	50 %	50 %	94152593
107	NC_007972	ATGG	2	8	34759	34766	25 %	25 %	50 %	0 %	94152593
108	NC_007972	GGGT	2	8	35076	35083	0 %	25 %	75 %	0 %	94152593
109	NC_007972	GCTG	2	8	35093	35100	0 %	25 %	50 %	25 %	94152593
110	NC_007972	GTCA	2	8	35502	35509	25 %	25 %	25 %	25 %	94152593
111	NC_007972	TTAT	2	8	35792	35799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007972	CTGC	2	8	36887	36894	0 %	25 %	25 %	50 %	94152595
113	NC_007972	TGGC	2	8	37040	37047	0 %	25 %	50 %	25 %	94152595
114	NC_007972	ATCG	2	8	37775	37782	25 %	25 %	25 %	25 %	94152595
115	NC_007972	ACGA	2	8	39428	39435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007972	CGGC	2	8	40451	40458	0 %	0 %	50 %	50 %	94152597
117	NC_007972	GTCC	2	8	41448	41455	0 %	25 %	25 %	50 %	94152598
118	NC_007972	CCGC	2	8	42200	42207	0 %	0 %	25 %	75 %	94152599
119	NC_007972	AGCG	2	8	42604	42611	25 %	0 %	50 %	25 %	94152599
120	NC_007972	GCCA	2	8	42664	42671	25 %	0 %	25 %	50 %	94152599
121	NC_007972	CGCC	2	8	42719	42726	0 %	0 %	25 %	75 %	94152599
122	NC_007972	GCCG	2	8	42762	42769	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
123	NC_007972	TCGC	2	8	42951	42958	0 %	25 %	25 %	50 %	94152600
124	NC_007972	CTCG	2	8	43086	43093	0 %	25 %	25 %	50 %	94152600
125	NC_007972	AGCC	2	8	43544	43551	25 %	0 %	25 %	50 %	94152600
126	NC_007972	GCCG	2	8	44168	44175	0 %	0 %	50 %	50 %	94152600
127	NC_007972	GCGA	2	8	44451	44458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007972	AGAT	2	8	44528	44535	50 %	25 %	25 %	0 %	94152601
129	NC_007972	CAGG	2	8	45418	45425	25 %	0 %	50 %	25 %	94152601
130	NC_007972	CATG	2	8	45826	45833	25 %	25 %	25 %	25 %	94152602
131	NC_007972	AGTC	2	8	47785	47792	25 %	25 %	25 %	25 %	94152604
132	NC_007972	CCAG	2	8	48052	48059	25 %	0 %	25 %	50 %	94152604
133	NC_007972	CTCC	2	8	48102	48109	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007972	CAGT	2	8	48456	48463	25 %	25 %	25 %	25 %	94152605
135	NC_007972	CGTG	2	8	48778	48785	0 %	25 %	50 %	25 %	94152606
136	NC_007972	TACA	2	8	48857	48864	50 %	25 %	0 %	25 %	94152606
137	NC_007972	CGAT	2	8	48918	48925	25 %	25 %	25 %	25 %	94152606
138	NC_007972	CATA	2	8	49427	49434	50 %	25 %	0 %	25 %	94152608
139	NC_007972	AGTA	2	8	49520	49527	50 %	25 %	25 %	0 %	94152608
140	NC_007972	CAGG	2	8	50238	50245	25 %	0 %	50 %	25 %	94152609
141	NC_007972	AGAT	2	8	50636	50643	50 %	25 %	25 %	0 %	94152609
142	NC_007972	CCTT	2	8	50930	50937	0 %	50 %	0 %	50 %	94152609
143	NC_007972	GGCG	2	8	51351	51358	0 %	0 %	75 %	25 %	94152610
144	NC_007972	CCAT	2	8	51837	51844	25 %	25 %	0 %	50 %	94152610
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