MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007972	TC	3	6	63	68	0 %	50 %	0 %	50 %	94152722
2	NC_007972	TG	3	6	161	166	0 %	50 %	50 %	0 %	94152722
3	NC_007972	CG	3	6	998	1003	0 %	0 %	50 %	50 %	94152722
4	NC_007972	GC	3	6	1163	1168	0 %	0 %	50 %	50 %	94152722
5	NC_007972	GA	3	6	1196	1201	50 %	0 %	50 %	0 %	291434859
6	NC_007972	GC	3	6	1263	1268	0 %	0 %	50 %	50 %	291434859
7	NC_007972	CT	3	6	1780	1785	0 %	50 %	0 %	50 %	291434859
8	NC_007972	GC	3	6	2553	2558	0 %	0 %	50 %	50 %	291434860
9	NC_007972	TC	3	6	2932	2937	0 %	50 %	0 %	50 %	291434860
10	NC_007972	TC	3	6	3096	3101	0 %	50 %	0 %	50 %	291434860
11	NC_007972	AG	3	6	3470	3475	50 %	0 %	50 %	0 %	291434860
12	NC_007972	TA	3	6	4720	4725	50 %	50 %	0 %	0 %	291434861
13	NC_007972	CG	3	6	5182	5187	0 %	0 %	50 %	50 %	291434861
14	NC_007972	GC	3	6	6201	6206	0 %	0 %	50 %	50 %	291434863
15	NC_007972	GC	3	6	6739	6744	0 %	0 %	50 %	50 %	291434863
16	NC_007972	CG	3	6	6893	6898	0 %	0 %	50 %	50 %	291434863
17	NC_007972	GC	3	6	6907	6912	0 %	0 %	50 %	50 %	291434863
18	NC_007972	AG	3	6	7011	7016	50 %	0 %	50 %	0 %	291434863
19	NC_007972	CG	3	6	7644	7649	0 %	0 %	50 %	50 %	291434864
20	NC_007972	GC	3	6	8235	8240	0 %	0 %	50 %	50 %	291434864
21	NC_007972	AT	5	10	8819	8828	50 %	50 %	0 %	0 %	291434866
22	NC_007972	CG	3	6	9897	9902	0 %	0 %	50 %	50 %	291434868
23	NC_007972	CG	3	6	10003	10008	0 %	0 %	50 %	50 %	291434868
24	NC_007972	CG	4	8	10213	10220	0 %	0 %	50 %	50 %	291434869
25	NC_007972	GC	3	6	10583	10588	0 %	0 %	50 %	50 %	291434869
26	NC_007972	CA	3	6	10865	10870	50 %	0 %	0 %	50 %	291434869
27	NC_007972	CG	3	6	11756	11761	0 %	0 %	50 %	50 %	291434870
28	NC_007972	GA	3	6	12256	12261	50 %	0 %	50 %	0 %	291434870
29	NC_007972	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	291434872
30	NC_007972	GA	3	6	17736	17741	50 %	0 %	50 %	0 %	291434872
31	NC_007972	GC	3	6	18881	18886	0 %	0 %	50 %	50 %	291434874
32	NC_007972	CG	3	6	19559	19564	0 %	0 %	50 %	50 %	291434875
33	NC_007972	GC	3	6	19997	20002	0 %	0 %	50 %	50 %	291434876
34	NC_007972	GC	3	6	20295	20300	0 %	0 %	50 %	50 %	291434876
35	NC_007972	GC	3	6	20497	20502	0 %	0 %	50 %	50 %	291434876
36	NC_007972	CG	3	6	21091	21096	0 %	0 %	50 %	50 %	291434877
37	NC_007972	CG	3	6	22543	22548	0 %	0 %	50 %	50 %	291434878
38	NC_007972	GC	3	6	23076	23081	0 %	0 %	50 %	50 %	291434879
39	NC_007972	CG	3	6	24230	24235	0 %	0 %	50 %	50 %	291434879
40	NC_007972	TC	3	6	24242	24247	0 %	50 %	0 %	50 %	291434879
41	NC_007972	GC	3	6	24267	24272	0 %	0 %	50 %	50 %	291434879
42	NC_007972	GC	4	8	24332	24339	0 %	0 %	50 %	50 %	291434879
43	NC_007972	TG	3	6	25161	25166	0 %	50 %	50 %	0 %	291434880
44	NC_007972	AT	3	6	28925	28930	50 %	50 %	0 %	0 %	291434882
45	NC_007972	GC	3	6	29279	29284	0 %	0 %	50 %	50 %	291434883
46	NC_007972	GC	3	6	29420	29425	0 %	0 %	50 %	50 %	291434883
47	NC_007972	GC	3	6	29463	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	291434883
48	NC_007972	GC	3	6	30271	30276	0 %	0 %	50 %	50 %	291434884
49	NC_007972	CA	3	6	30301	30306	50 %	0 %	0 %	50 %	291434884
50	NC_007972	GC	3	6	30423	30428	0 %	0 %	50 %	50 %	291434885
51	NC_007972	CG	3	6	30478	30483	0 %	0 %	50 %	50 %	291434885
52	NC_007972	GC	3	6	30576	30581	0 %	0 %	50 %	50 %	291434885
53	NC_007972	GC	3	6	31346	31351	0 %	0 %	50 %	50 %	291434886
54	NC_007972	GC	3	6	32803	32808	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
55	NC_007972	TG	3	6	32862	32867	0 %	50 %	50 %	0 %	94152590
56	NC_007972	GC	3	6	33072	33077	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
57	NC_007972	GC	3	6	33339	33344	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
58	NC_007972	GC	3	6	33497	33502	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
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60	NC_007972	GC	3	6	36057	36062	0 %	0 %	50 %	50 %	94152594
61	NC_007972	GC	3	6	37800	37805	0 %	0 %	50 %	50 %	94152595
62	NC_007972	GC	3	6	39531	39536	0 %	0 %	50 %	50 %	94152596
63	NC_007972	GC	4	8	39670	39677	0 %	0 %	50 %	50 %	94152596
64	NC_007972	CG	3	6	39688	39693	0 %	0 %	50 %	50 %	94152596
65	NC_007972	GC	3	6	39951	39956	0 %	0 %	50 %	50 %	94152597
66	NC_007972	GC	3	6	40080	40085	0 %	0 %	50 %	50 %	94152597
67	NC_007972	GC	3	6	40564	40569	0 %	0 %	50 %	50 %	94152597
68	NC_007972	TC	3	6	40788	40793	0 %	50 %	0 %	50 %	94152597
69	NC_007972	CG	3	6	42049	42054	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
70	NC_007972	GC	3	6	42108	42113	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
71	NC_007972	CG	4	8	42273	42280	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
72	NC_007972	GC	3	6	42323	42328	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
73	NC_007972	GC	3	6	42408	42413	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
74	NC_007972	GC	3	6	42504	42509	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
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76	NC_007972	GC	3	6	42616	42621	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
77	NC_007972	GC	3	6	42644	42649	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
78	NC_007972	GC	3	6	42672	42677	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
79	NC_007972	GC	3	6	42696	42701	0 %	0 %	50 %	50 %	94152599
80	NC_007972	CG	3	6	43235	43240	0 %	0 %	50 %	50 %	94152600
81	NC_007972	CG	3	6	43525	43530	0 %	0 %	50 %	50 %	94152600
82	NC_007972	GC	3	6	44067	44072	0 %	0 %	50 %	50 %	94152600
83	NC_007972	GC	3	6	44096	44101	0 %	0 %	50 %	50 %	94152600
84	NC_007972	GC	3	6	46778	46783	0 %	0 %	50 %	50 %	94152603
85	NC_007972	GC	3	6	46892	46897	0 %	0 %	50 %	50 %	94152603
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87	NC_007972	TG	4	8	51423	51430	0 %	50 %	50 %	0 %	94152610
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89	NC_007972	CG	3	6	53432	53437	0 %	0 %	50 %	50 %	94152612
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91	NC_007972	CG	3	6	55185	55190	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
92	NC_007972	GC	3	6	55229	55234	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
93	NC_007972	GC	3	6	55675	55680	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
94	NC_007972	GC	3	6	55864	55869	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
95	NC_007972	GC	3	6	55873	55878	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
96	NC_007972	GC	3	6	55881	55886	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
97	NC_007972	CG	3	6	56393	56398	0 %	0 %	50 %	50 %	94152616
98	NC_007972	GC	3	6	56504	56509	0 %	0 %	50 %	50 %	94152616
99	NC_007972	GC	3	6	56760	56765	0 %	0 %	50 %	50 %	94152616
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103	NC_007972	GC	3	6	58242	58247	0 %	0 %	50 %	50 %	94152617
104	NC_007972	GA	3	6	59262	59267	50 %	0 %	50 %	0 %	94152617
105	NC_007972	GC	3	6	59553	59558	0 %	0 %	50 %	50 %	94152617
106	NC_007972	CT	3	6	60157	60162	0 %	50 %	0 %	50 %	94152617
107	NC_007972	GT	3	6	60732	60737	0 %	50 %	50 %	0 %	94152618
108	NC_007972	GT	3	6	61242	61247	0 %	50 %	50 %	0 %	94152618
109	NC_007972	GA	3	6	61260	61265	50 %	0 %	50 %	0 %	94152618
110	NC_007972	GC	3	6	61613	61618	0 %	0 %	50 %	50 %	94152619
111	NC_007972	GT	3	6	61750	61755	0 %	50 %	50 %	0 %	94152619
112	NC_007972	TC	3	6	62345	62350	0 %	50 %	0 %	50 %	94152619
113	NC_007972	GA	3	6	62646	62651	50 %	0 %	50 %	0 %	94152619
114	NC_007972	CT	3	6	62726	62731	0 %	50 %	0 %	50 %	94152619
115	NC_007972	CG	3	6	62907	62912	0 %	0 %	50 %	50 %	94152619
116	NC_007972	CA	3	6	63616	63621	50 %	0 %	0 %	50 %	94152619
117	NC_007972	GT	3	6	64180	64185	0 %	50 %	50 %	0 %	94152619
118	NC_007972	CG	3	6	64365	64370	0 %	0 %	50 %	50 %	94152619
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121	NC_007972	CG	3	6	66075	66080	0 %	0 %	50 %	50 %	94152623
122	NC_007972	GA	3	6	66439	66444	50 %	0 %	50 %	0 %	94152623
123	NC_007972	CG	3	6	66524	66529	0 %	0 %	50 %	50 %	94152623
124	NC_007972	TG	3	6	68118	68123	0 %	50 %	50 %	0 %	94152624
125	NC_007972	GC	3	6	68608	68613	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
126	NC_007972	CG	3	6	68705	68710	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
127	NC_007972	GC	3	6	69258	69263	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
128	NC_007972	CG	4	8	69326	69333	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
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130	NC_007972	CG	3	6	69846	69851	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
131	NC_007972	CG	3	6	70026	70031	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
132	NC_007972	CG	4	8	70560	70567	0 %	0 %	50 %	50 %	94152625
133	NC_007972	GC	3	6	70923	70928	0 %	0 %	50 %	50 %	94152626
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.