MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007972	T	6	6	2194	2199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007972	T	6	6	2402	2407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007972	A	6	6	2984	2989	100 %	0 %	0 %	0 %	291434860
4	NC_007972	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	291434860
5	NC_007972	C	6	6	6973	6978	0 %	0 %	0 %	100 %	291434863
6	NC_007972	T	6	6	8598	8603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007972	T	6	6	10114	10119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007972	A	6	6	13402	13407	100 %	0 %	0 %	0 %	291434871
9	NC_007972	A	6	6	13938	13943	100 %	0 %	0 %	0 %	291434871
10	NC_007972	C	6	6	14318	14323	0 %	0 %	0 %	100 %	291434871
11	NC_007972	A	7	7	16211	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	291434871
12	NC_007972	T	6	6	17214	17219	0 %	100 %	0 %	0 %	291434872
13	NC_007972	A	6	6	19271	19276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007972	G	6	6	19623	19628	0 %	0 %	100 %	0 %	291434875
15	NC_007972	T	6	6	22434	22439	0 %	100 %	0 %	0 %	291434878
16	NC_007972	C	6	6	23026	23031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_007972	G	6	6	28386	28391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007972	G	6	6	46244	46249	0 %	0 %	100 %	0 %	94152602
19	NC_007972	G	6	6	47095	47100	0 %	0 %	100 %	0 %	94152603
20	NC_007972	A	6	6	51725	51730	100 %	0 %	0 %	0 %	94152610
21	NC_007972	A	6	6	58225	58230	100 %	0 %	0 %	0 %	94152617
22	NC_007972	G	6	6	59944	59949	0 %	0 %	100 %	0 %	94152617
23	NC_007972	G	6	6	64988	64993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007972	A	9	9	65979	65987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007972	G	6	6	66100	66105	0 %	0 %	100 %	0 %	94152623
26	NC_007972	A	7	7	74640	74646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007972	C	6	6	76807	76812	0 %	0 %	0 %	100 %	94152632
28	NC_007972	A	6	6	76895	76900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007972	A	6	6	77500	77505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007972	A	6	6	81520	81525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007972	A	7	7	83276	83282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007972	A	6	6	84608	84613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007972	A	7	7	87978	87984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007972	A	6	6	91023	91028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007972	A	7	7	91413	91419	100 %	0 %	0 %	0 %	94152649
36	NC_007972	A	9	9	91655	91663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007972	T	7	7	92778	92784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007972	G	6	6	93376	93381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007972	T	7	7	98633	98639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007972	T	6	6	98937	98942	0 %	100 %	0 %	0 %	94152659
41	NC_007972	C	6	6	99232	99237	0 %	0 %	0 %	100 %	94152659
42	NC_007972	A	6	6	102527	102532	100 %	0 %	0 %	0 %	94152661
43	NC_007972	G	6	6	102734	102739	0 %	0 %	100 %	0 %	94152661
44	NC_007972	C	6	6	109691	109696	0 %	0 %	0 %	100 %	94152664
45	NC_007972	T	6	6	110803	110808	0 %	100 %	0 %	0 %	94152665
46	NC_007972	A	6	6	116254	116259	100 %	0 %	0 %	0 %	291434890
47	NC_007972	A	6	6	117589	117594	100 %	0 %	0 %	0 %	94152670
48	NC_007972	A	6	6	124256	124261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007972	A	6	6	126118	126123	100 %	0 %	0 %	0 %	94152678
50	NC_007972	C	6	6	126860	126865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_007972	C	6	6	130435	130440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_007972	A	8	8	130732	130739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007972	A	10	10	132843	132852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007972	C	6	6	137175	137180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_007972	T	6	6	140687	140692	0 %	100 %	0 %	0 %	94152691
56	NC_007972	T	6	6	141062	141067	0 %	100 %	0 %	0 %	94152692
57	NC_007972	C	6	6	141283	141288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_007972	T	6	6	141582	141587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007972	A	6	6	141674	141679	100 %	0 %	0 %	0 %	94152694
60	NC_007972	T	6	6	142547	142552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007972	A	6	6	156148	156153	100 %	0 %	0 %	0 %	94152707
62	NC_007972	A	6	6	156676	156681	100 %	0 %	0 %	0 %	94152708
63	NC_007972	C	6	6	157488	157493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_007972	C	6	6	158643	158648	0 %	0 %	0 %	100 %	94152709
65	NC_007972	T	6	6	158800	158805	0 %	100 %	0 %	0 %	94152709
66	NC_007972	G	7	7	161041	161047	0 %	0 %	100 %	0 %	94152712
67	NC_007972	T	6	6	163359	163364	0 %	100 %	0 %	0 %	94152714
68	NC_007972	C	6	6	164490	164495	0 %	0 %	0 %	100 %	94152715
69	NC_007972	G	6	6	168921	168926	0 %	0 %	100 %	0 %	94152720
70	NC_007972	A	6	6	169707	169712	100 %	0 %	0 %	0 %	94152721

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.