MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	GGCGA	2	10	7298	7307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007971	GCGAA	2	10	10913	10922	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007971	ATCGA	2	10	11751	11760	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007971	TTCAA	2	10	11852	11861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007971	GCAAA	2	10	14559	14568	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007971	TCTCC	2	10	19967	19976	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007971	GTTTC	2	10	23230	23239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007971	GAGCG	2	10	33550	33559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007971	CTCGA	2	10	33564	33573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007971	AGCCA	2	10	33953	33962	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007971	TTTTG	2	10	34721	34730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007971	GGCGT	2	10	35891	35900	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007971	TTTTC	2	10	45046	45055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007971	CCTGC	2	10	46080	46089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007971	CTTTT	2	10	47605	47614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007971	GCCCA	2	10	48533	48542	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007971	TGGCG	2	10	48858	48867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007971	GTTTT	2	10	55232	55241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007971	ACCCG	2	10	55635	55644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007971	CGCGC	2	10	56026	56035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_007971	GCGCA	2	10	56864	56873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007971	GGGGC	2	10	65553	65562	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007971	CTGGC	2	10	72453	72462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007971	CTTCT	2	10	96668	96677	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007971	GACGC	2	10	100631	100640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007971	CGTTC	2	10	100933	100942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007971	GCTTC	2	10	101933	101942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007971	GCGCT	2	10	104074	104083	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007971	GCGCC	2	10	107774	107783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_007971	TGAGC	2	10	109527	109536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007971	CGGCG	2	10	109656	109665	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007971	CTCGG	2	10	117109	117118	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007971	TGTCA	2	10	122373	122382	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007971	CTTGC	2	10	130846	130855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007971	GGCTG	2	10	133932	133941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007971	TCAAG	2	10	136161	136170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007971	AGGGG	2	10	136174	136183	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007971	TGTGT	2	10	140226	140235	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007971	CGTGC	2	10	143895	143904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007971	CCACT	2	10	144683	144692	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_007971	GAGGC	2	10	150837	150846	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007971	CTGGC	2	10	163876	163885	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007971	CCTTG	2	10	176835	176844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007971	AACGC	2	10	179639	179648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007971	TGGCT	2	10	182100	182109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007971	ACATT	2	10	191289	191298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007971	TTGGA	2	10	194954	194963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007971	GCGCT	2	10	197715	197724	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007971	GGACG	2	10	201461	201470	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007971	GGGCA	2	10	201594	201603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007971	GGGAT	2	10	202272	202281	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007971	CATCA	2	10	229574	229583	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007971	CGGCG	2	10	229819	229828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007971	TGACA	2	10	230077	230086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.