MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 3126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	TGC	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
2	NC_007971	ATC	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
3	NC_007971	ACT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
4	NC_007971	ACC	3	9	298	306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152465
5	NC_007971	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152465
6	NC_007971	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152465
7	NC_007971	GTC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
8	NC_007971	AAG	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152465
9	NC_007971	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152465
10	NC_007971	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
11	NC_007971	GCT	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
12	NC_007971	TGG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152465
13	NC_007971	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
14	NC_007971	GGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
15	NC_007971	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
16	NC_007971	GCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
17	NC_007971	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
18	NC_007971	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
19	NC_007971	CAG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
20	NC_007971	TCG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
21	NC_007971	GTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152464
22	NC_007971	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
23	NC_007971	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
24	NC_007971	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
25	NC_007971	GCC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
26	NC_007971	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007971	GCG	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007971	CGG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007971	CTC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007971	GCG	2	6	2786	2791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007971	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
32	NC_007971	GAG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152463
33	NC_007971	ATC	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152463
34	NC_007971	CAG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
35	NC_007971	CGA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007971	GGC	2	6	3451	3456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007971	GAG	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007971	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
39	NC_007971	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
40	NC_007971	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
41	NC_007971	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
42	NC_007971	CGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
43	NC_007971	TGA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152462
44	NC_007971	ATC	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152462
45	NC_007971	TCG	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
46	NC_007971	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152462
47	NC_007971	CGC	3	9	4466	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
48	NC_007971	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
49	NC_007971	GTT	2	6	4545	4550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152462
50	NC_007971	CTC	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152462
51	NC_007971	GCT	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
52	NC_007971	CCA	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007971	CCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007971	TGC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007971	ATT	2	6	5197	5202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007971	GCT	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007971	ACC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007971	GCG	2	6	5845	5850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007971	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007971	ACA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007971	CCA	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007971	CAC	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007971	CGC	2	6	6523	6528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007971	GGC	2	6	6654	6659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007971	TGT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007971	CGA	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
67	NC_007971	AGA	3	9	6866	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
68	NC_007971	CGG	2	6	6945	6950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152461
69	NC_007971	AGG	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152461
70	NC_007971	AGT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152461
71	NC_007971	GAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
72	NC_007971	GCC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152461
73	NC_007971	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
74	NC_007971	GGA	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007971	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007971	CGC	2	6	7413	7418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007971	TGC	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007971	TCT	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007971	GGC	2	6	7556	7561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007971	GAG	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007971	AGA	2	6	7579	7584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007971	GTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007971	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152460
84	NC_007971	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
85	NC_007971	CCT	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
86	NC_007971	GGC	2	6	7866	7871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
87	NC_007971	CCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
88	NC_007971	TCC	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
89	NC_007971	TCG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
90	NC_007971	CAG	2	6	8460	8465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
91	NC_007971	GTT	2	6	8688	8693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152460
92	NC_007971	GGC	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
93	NC_007971	CTC	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
94	NC_007971	TGA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152460
95	NC_007971	GGC	2	6	8864	8869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
96	NC_007971	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152460
97	NC_007971	AAG	2	6	9114	9119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152460
98	NC_007971	CGT	2	6	9217	9222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
99	NC_007971	TCG	2	6	9283	9288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
100	NC_007971	CAG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
101	NC_007971	CGA	2	6	9386	9391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
102	NC_007971	CGA	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
103	NC_007971	CCG	2	6	9772	9777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
104	NC_007971	ACG	2	6	9948	9953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
105	NC_007971	TAA	2	6	9985	9990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007971	CCA	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007971	TCT	2	6	10077	10082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007971	ATG	2	6	10173	10178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007971	GCA	2	6	10214	10219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007971	CGG	3	9	10260	10268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007971	CTG	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007971	CGG	2	6	10293	10298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007971	GTT	2	6	10373	10378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007971	TGC	2	6	10398	10403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007971	TTG	2	6	10620	10625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007971	AGG	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007971	TCC	2	6	10716	10721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007971	GTC	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007971	GAG	2	6	10975	10980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007971	CGA	2	6	10996	11001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007971	AGC	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007971	CAG	2	6	11152	11157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007971	AGA	2	6	11196	11201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007971	CAA	2	6	11283	11288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007971	GCA	2	6	11411	11416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152458
126	NC_007971	GAG	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152458
127	NC_007971	TGC	2	6	11545	11550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152458
128	NC_007971	GCC	2	6	11762	11767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007971	AGC	2	6	11905	11910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007971	CTG	4	12	11913	11924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007971	GAA	3	9	12096	12104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007971	TCT	2	6	12153	12158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007971	TTG	2	6	12258	12263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007971	CTG	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007971	GCT	2	6	12368	12373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
136	NC_007971	GGC	2	6	12378	12383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
137	NC_007971	TCG	2	6	12607	12612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
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141	NC_007971	GCG	2	6	12859	12864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
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232	NC_007971	TAT	2	6	19123	19128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_007971	ATC	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152433
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389	NC_007971	TGA	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152433
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