MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 2243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	TGC	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
2	NC_007971	ATC	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
3	NC_007971	ACT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
4	NC_007971	ACC	3	9	298	306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152465
5	NC_007971	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152465
6	NC_007971	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152465
7	NC_007971	GTC	2	6	526	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
8	NC_007971	AAG	2	6	532	537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152465
9	NC_007971	TTC	2	6	643	648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152465
10	NC_007971	ATC	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
11	NC_007971	GCT	2	6	732	737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152465
12	NC_007971	TGG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152465
13	NC_007971	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152465
14	NC_007971	GGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
15	NC_007971	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152465
16	NC_007971	GCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
17	NC_007971	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
18	NC_007971	GCT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
19	NC_007971	CAG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
20	NC_007971	TCG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
21	NC_007971	GTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152464
22	NC_007971	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
23	NC_007971	GCT	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152464
24	NC_007971	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152464
25	NC_007971	GCC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152464
26	NC_007971	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
27	NC_007971	GAG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152463
28	NC_007971	ATC	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152463
29	NC_007971	CAG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152463
30	NC_007971	GCC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
31	NC_007971	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
32	NC_007971	CTT	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
33	NC_007971	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
34	NC_007971	CGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
35	NC_007971	TGA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152462
36	NC_007971	ATC	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152462
37	NC_007971	TCG	2	6	4390	4395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
38	NC_007971	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152462
39	NC_007971	CGC	3	9	4466	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152462
40	NC_007971	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152462
41	NC_007971	GTT	2	6	4545	4550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152462
42	NC_007971	CTC	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152462
43	NC_007971	GCT	2	6	4790	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152462
44	NC_007971	CGA	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
45	NC_007971	AGA	3	9	6866	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
46	NC_007971	CGG	2	6	6945	6950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152461
47	NC_007971	AGG	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152461
48	NC_007971	AGT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152461
49	NC_007971	GAA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152461
50	NC_007971	GCC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152461
51	NC_007971	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152461
52	NC_007971	CAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152460
53	NC_007971	CTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
54	NC_007971	CCT	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
55	NC_007971	GGC	2	6	7866	7871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
56	NC_007971	CCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
57	NC_007971	TCC	2	6	8272	8277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
58	NC_007971	TCG	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
59	NC_007971	CAG	2	6	8460	8465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
60	NC_007971	GTT	2	6	8688	8693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152460
61	NC_007971	GGC	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
62	NC_007971	CTC	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152460
63	NC_007971	TGA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152460
64	NC_007971	GGC	2	6	8864	8869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152460
65	NC_007971	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152460
66	NC_007971	AAG	2	6	9114	9119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152460
67	NC_007971	CGT	2	6	9217	9222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
68	NC_007971	TCG	2	6	9283	9288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152460
69	NC_007971	CAG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
70	NC_007971	CGA	2	6	9386	9391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
71	NC_007971	CGA	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
72	NC_007971	CCG	2	6	9772	9777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152460
73	NC_007971	ACG	2	6	9948	9953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152460
74	NC_007971	GCA	2	6	11411	11416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152458
75	NC_007971	GAG	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152458
76	NC_007971	TGC	2	6	11545	11550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152458
77	NC_007971	GCT	2	6	12368	12373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
78	NC_007971	GGC	2	6	12378	12383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
79	NC_007971	TCG	2	6	12607	12612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
80	NC_007971	GCG	2	6	12625	12630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
81	NC_007971	GAG	2	6	12676	12681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152457
82	NC_007971	TGC	2	6	12705	12710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
83	NC_007971	GCG	2	6	12859	12864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152457
84	NC_007971	TCT	2	6	12934	12939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152457
85	NC_007971	GCA	3	9	12976	12984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152457
86	NC_007971	CAC	2	6	13055	13060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152457
87	NC_007971	TGG	2	6	13199	13204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152457
88	NC_007971	GAA	2	6	13206	13211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152457
89	NC_007971	ACT	2	6	13219	13224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152457
90	NC_007971	TCG	2	6	13237	13242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152457
91	NC_007971	TGA	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152457
92	NC_007971	GTG	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152457
93	NC_007971	CTT	2	6	13493	13498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152457
94	NC_007971	CCA	2	6	13606	13611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152456
95	NC_007971	GGA	2	6	14070	14075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152455
96	NC_007971	CAA	2	6	14100	14105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152455
97	NC_007971	AGC	2	6	14174	14179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152455
98	NC_007971	TTG	2	6	14249	14254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152455
99	NC_007971	CGG	2	6	14273	14278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152455
100	NC_007971	GCG	2	6	14734	14739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152454
101	NC_007971	TTC	2	6	14748	14753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152454
102	NC_007971	AGC	2	6	14892	14897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152454
103	NC_007971	CGG	2	6	14925	14930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152454
104	NC_007971	AGC	2	6	14968	14973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152454
105	NC_007971	TCG	2	6	15037	15042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152454
106	NC_007971	GAA	2	6	15108	15113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152454
107	NC_007971	AGG	2	6	15136	15141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152454
108	NC_007971	CCA	2	6	15150	15155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152454
109	NC_007971	CTG	2	6	15249	15254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152454
110	NC_007971	GAT	3	9	15318	15326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152454
111	NC_007971	TGC	2	6	15348	15353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152454
112	NC_007971	CTA	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152452
113	NC_007971	CGG	2	6	15895	15900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152452
114	NC_007971	TCA	2	6	15922	15927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152452
115	NC_007971	CTC	2	6	15938	15943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152452
116	NC_007971	TGC	2	6	15968	15973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152452
117	NC_007971	TGG	2	6	16109	16114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152452
118	NC_007971	GTA	2	6	16174	16179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152452
119	NC_007971	TGA	2	6	16446	16451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152451
120	NC_007971	AGC	2	6	16471	16476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152451
121	NC_007971	TGC	2	6	16497	16502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152451
122	NC_007971	CCA	2	6	16593	16598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152451
123	NC_007971	CAA	2	6	16678	16683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152451
124	NC_007971	AAC	2	6	16745	16750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152450
125	NC_007971	TGG	2	6	16781	16786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152450
126	NC_007971	CAC	2	6	16932	16937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152450
127	NC_007971	GAC	2	6	17058	17063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152450
128	NC_007971	CGA	2	6	17289	17294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152450
129	NC_007971	TCG	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152450
130	NC_007971	CTC	2	6	17494	17499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152450
131	NC_007971	CAA	2	6	17643	17648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152450
132	NC_007971	TGG	2	6	17696	17701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152450
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134	NC_007971	GAG	2	6	17782	17787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152450
135	NC_007971	GAC	2	6	17803	17808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152450
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138	NC_007971	CGA	2	6	17976	17981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152450
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251	NC_007971	ATC	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152433
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253	NC_007971	GTT	2	6	30801	30806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152433
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255	NC_007971	GGT	2	6	30899	30904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152433
256	NC_007971	CGA	2	6	30913	30918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152433
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258	NC_007971	TGA	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152433
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260	NC_007971	CGG	2	6	31258	31263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152433
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263	NC_007971	CGG	2	6	31959	31964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152432
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