MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	GA	3	6	2420	2425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007971	CG	3	6	3439	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007971	GC	3	6	5001	5006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007971	CA	3	6	5384	5389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007971	CT	3	6	5419	5424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007971	CT	3	6	5658	5663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007971	GA	3	6	7254	7259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007971	CG	3	6	7322	7327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007971	GA	3	6	7516	7521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007971	GC	3	6	10694	10699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007971	CG	3	6	11086	11091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007971	GC	3	6	11225	11230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007971	TC	3	6	11272	11277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007971	CT	3	6	11773	11778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007971	CG	3	6	13990	13995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007971	CG	3	6	14509	14514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007971	CT	3	6	15469	15474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007971	CA	3	6	19527	19532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007971	AC	3	6	20103	20108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007971	GC	3	6	27979	27984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007971	GA	3	6	27995	28000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007971	TG	3	6	33406	33411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007971	AC	3	6	35961	35966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007971	CT	3	6	36422	36427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007971	GA	3	6	36475	36480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007971	GT	3	6	38943	38948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007971	AC	3	6	42822	42827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007971	CA	3	6	43075	43080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007971	GC	3	6	45068	45073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007971	GT	3	6	45783	45788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007971	TG	3	6	47591	47596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007971	CT	3	6	49447	49452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007971	CA	3	6	50897	50902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007971	GT	3	6	54177	54182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007971	GC	3	6	54213	54218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007971	CA	3	6	55388	55393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007971	GC	3	6	56360	56365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007971	GC	3	6	56760	56765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007971	CG	4	8	56776	56783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007971	CG	3	6	56944	56949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007971	CG	4	8	57040	57047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007971	GC	4	8	57204	57211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007971	GC	3	6	57539	57544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007971	GA	3	6	57906	57911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007971	CA	3	6	64816	64821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007971	GC	3	6	72260	72265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007971	CG	3	6	72271	72276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007971	CG	3	6	72560	72565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007971	AG	3	6	72687	72692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007971	GC	3	6	73312	73317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007971	GT	3	6	73977	73982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007971	TC	3	6	75556	75561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007971	TC	3	6	85850	85855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007971	CT	3	6	85985	85990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007971	TC	3	6	88403	88408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007971	CG	3	6	88543	88548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007971	TG	3	6	88561	88566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007971	CG	3	6	88567	88572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007971	TC	3	6	88617	88622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007971	AG	3	6	96012	96017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007971	TG	3	6	96328	96333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007971	CG	3	6	96398	96403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007971	GC	3	6	96404	96409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007971	GC	3	6	96750	96755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007971	CA	4	8	99914	99921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007971	GC	3	6	100664	100669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007971	CG	3	6	101095	101100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007971	GC	3	6	101259	101264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007971	AT	3	6	101278	101283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007971	GC	3	6	101506	101511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007971	CG	3	6	101554	101559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007971	CA	3	6	101660	101665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007971	GC	3	6	101704	101709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007971	GC	3	6	101738	101743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007971	GC	3	6	102954	102959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007971	GC	3	6	103406	103411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007971	CG	3	6	104016	104021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007971	CG	3	6	104238	104243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007971	GC	3	6	104388	104393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007971	GC	3	6	104400	104405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007971	GA	3	6	106956	106961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007971	TC	3	6	107101	107106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007971	GC	3	6	107261	107266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007971	CA	3	6	108373	108378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007971	GC	3	6	109137	109142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007971	GA	3	6	109150	109155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007971	CG	3	6	109192	109197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007971	GC	3	6	109938	109943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007971	TG	3	6	114507	114512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007971	GC	3	6	118043	118048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007971	GC	3	6	125807	125812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007971	GT	3	6	125890	125895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007971	CT	4	8	131044	131051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007971	CG	3	6	135595	135600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007971	CG	3	6	135683	135688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007971	CG	3	6	135846	135851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007971	AC	3	6	138307	138312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007971	GC	3	6	139467	139472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007971	GT	4	8	139704	139711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007971	CA	3	6	140150	140155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007971	AG	3	6	140581	140586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007971	GA	3	6	143842	143847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007971	GA	3	6	144700	144705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007971	TC	3	6	145251	145256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007971	CG	3	6	145699	145704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007971	CG	5	10	146860	146869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007971	CG	4	8	150622	150629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007971	GC	3	6	150910	150915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007971	TC	3	6	150997	151002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007971	GC	3	6	151111	151116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007971	CG	3	6	151409	151414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007971	GC	3	6	151486	151491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007971	TC	3	6	151639	151644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007971	GC	3	6	151651	151656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007971	CG	3	6	160477	160482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007971	CG	3	6	162143	162148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007971	TG	3	6	162155	162160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007971	CG	3	6	162205	162210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007971	CA	3	6	163216	163221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007971	GC	3	6	163838	163843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007971	TG	3	6	170625	170630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007971	CT	3	6	170653	170658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007971	AG	3	6	176557	176562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007971	CG	3	6	177376	177381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007971	GC	3	6	177520	177525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007971	CG	3	6	178024	178029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007971	AG	3	6	189344	189349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007971	GC	3	6	194024	194029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007971	TG	3	6	195323	195328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007971	CT	3	6	197191	197196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007971	CG	3	6	197852	197857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007971	AT	3	6	198766	198771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007971	GC	3	6	198978	198983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007971	TC	3	6	199020	199025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007971	CG	3	6	200061	200066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007971	GT	3	6	201114	201119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007971	CG	3	6	201185	201190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007971	GC	3	6	201278	201283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007971	GC	3	6	201332	201337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007971	GC	3	6	201485	201490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007971	GC	3	6	201641	201646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007971	TC	3	6	201933	201938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007971	GA	3	6	202049	202054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007971	TG	3	6	202068	202073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007971	TA	3	6	202088	202093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007971	CG	3	6	202401	202406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007971	GA	3	6	202489	202494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007971	CG	3	6	202636	202641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007971	GC	3	6	204059	204064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007971	CG	3	6	212665	212670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007971	TA	4	8	212968	212975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007971	GC	3	6	213015	213020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007971	CA	4	8	213727	213734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_007971	CG	3	6	213794	213799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007971	CG	3	6	214049	214054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_007971	CG	3	6	214300	214305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007971	CG	3	6	214384	214389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_007971	CG	3	6	214555	214560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007971	GC	3	6	214827	214832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_007971	CG	3	6	214998	215003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_007971	GA	3	6	223121	223126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007971	TC	3	6	227982	227987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_007971	TC	3	6	228812	228817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_007971	CG	3	6	229503	229508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_007971	CG	3	6	229908	229913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_007971	CG	3	6	230367	230372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_007971	CG	3	6	230449	230454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_007971	GA	3	6	230586	230591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.