MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	CG	3	6	207	212	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
2	NC_007971	GA	3	6	221	226	50 %	0 %	50 %	0 %	94152465
3	NC_007971	CG	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
4	NC_007971	CG	3	6	1089	1094	0 %	0 %	50 %	50 %	94152465
5	NC_007971	AT	3	6	1640	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	94152464
6	NC_007971	GT	3	6	1802	1807	0 %	50 %	50 %	0 %	94152464
7	NC_007971	GC	3	6	3025	3030	0 %	0 %	50 %	50 %	94152463
8	NC_007971	GC	3	6	3717	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
9	NC_007971	CG	3	6	4718	4723	0 %	0 %	50 %	50 %	94152462
10	NC_007971	GA	3	6	7034	7039	50 %	0 %	50 %	0 %	94152461
11	NC_007971	GC	4	8	7134	7141	0 %	0 %	50 %	50 %	94152461
12	NC_007971	GA	3	6	8664	8669	50 %	0 %	50 %	0 %	94152460
13	NC_007971	GA	3	6	9028	9033	50 %	0 %	50 %	0 %	94152460
14	NC_007971	TC	3	6	13762	13767	0 %	50 %	0 %	50 %	94152456
15	NC_007971	CT	3	6	14650	14655	0 %	50 %	0 %	50 %	94152454
16	NC_007971	GC	3	6	14830	14835	0 %	0 %	50 %	50 %	94152454
17	NC_007971	AG	3	6	14977	14982	50 %	0 %	50 %	0 %	94152454
18	NC_007971	GA	4	8	15280	15287	50 %	0 %	50 %	0 %	94152454
19	NC_007971	TC	3	6	16882	16887	0 %	50 %	0 %	50 %	94152450
20	NC_007971	TC	3	6	17817	17822	0 %	50 %	0 %	50 %	94152450
21	NC_007971	GA	3	6	18343	18348	50 %	0 %	50 %	0 %	94152450
22	NC_007971	GC	3	6	21520	21525	0 %	0 %	50 %	50 %	94152445
23	NC_007971	CA	3	6	21683	21688	50 %	0 %	0 %	50 %	94152445
24	NC_007971	GC	3	6	24110	24115	0 %	0 %	50 %	50 %	94152443
25	NC_007971	GA	3	6	24123	24128	50 %	0 %	50 %	0 %	94152443
26	NC_007971	CG	3	6	25907	25912	0 %	0 %	50 %	50 %	291464757
27	NC_007971	TG	3	6	26312	26317	0 %	50 %	50 %	0 %	94152441
28	NC_007971	TC	4	8	26405	26412	0 %	50 %	0 %	50 %	94152440
29	NC_007971	GT	3	6	27282	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	94152439
30	NC_007971	TC	3	6	28606	28611	0 %	50 %	0 %	50 %	94152437
31	NC_007971	CG	3	6	29372	29377	0 %	0 %	50 %	50 %	94152436
32	NC_007971	TC	3	6	29545	29550	0 %	50 %	0 %	50 %	94152436
33	NC_007971	CG	3	6	30465	30470	0 %	0 %	50 %	50 %	94152434
34	NC_007971	GA	4	8	30759	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	94152433
35	NC_007971	GA	3	6	30822	30827	50 %	0 %	50 %	0 %	94152433
36	NC_007971	CG	3	6	30846	30851	0 %	0 %	50 %	50 %	94152433
37	NC_007971	GC	3	6	31274	31279	0 %	0 %	50 %	50 %	94152433
38	NC_007971	CG	3	6	31340	31345	0 %	0 %	50 %	50 %	94152432
39	NC_007971	AC	3	6	31506	31511	50 %	0 %	0 %	50 %	94152432
40	NC_007971	CG	3	6	31928	31933	0 %	0 %	50 %	50 %	94152432
41	NC_007971	GA	3	6	33005	33010	50 %	0 %	50 %	0 %	94152429
42	NC_007971	CG	3	6	33014	33019	0 %	0 %	50 %	50 %	94152429
43	NC_007971	CG	3	6	34318	34323	0 %	0 %	50 %	50 %	94152427
44	NC_007971	GC	3	6	34645	34650	0 %	0 %	50 %	50 %	94152427
45	NC_007971	GA	3	6	36812	36817	50 %	0 %	50 %	0 %	94152425
46	NC_007971	CT	3	6	38813	38818	0 %	50 %	0 %	50 %	94152422
47	NC_007971	GA	3	6	40356	40361	50 %	0 %	50 %	0 %	94152420
48	NC_007971	CG	3	6	40571	40576	0 %	0 %	50 %	50 %	94152420
49	NC_007971	CG	3	6	42769	42774	0 %	0 %	50 %	50 %	94152417
50	NC_007971	CG	3	6	44100	44105	0 %	0 %	50 %	50 %	94152416
51	NC_007971	GA	3	6	44590	44595	50 %	0 %	50 %	0 %	94152416
52	NC_007971	TC	3	6	44799	44804	0 %	50 %	0 %	50 %	94152416
53	NC_007971	CA	3	6	44855	44860	50 %	0 %	0 %	50 %	94152416
54	NC_007971	CG	3	6	46885	46890	0 %	0 %	50 %	50 %	94152413
55	NC_007971	TG	3	6	47025	47030	0 %	50 %	50 %	0 %	94152412
56	NC_007971	CG	3	6	48385	48390	0 %	0 %	50 %	50 %	94152411
57	NC_007971	CG	3	6	48519	48524	0 %	0 %	50 %	50 %	94152411
58	NC_007971	GC	3	6	53949	53954	0 %	0 %	50 %	50 %	94152407
59	NC_007971	GC	3	6	53970	53975	0 %	0 %	50 %	50 %	94152407
60	NC_007971	CG	3	6	54742	54747	0 %	0 %	50 %	50 %	94152405
61	NC_007971	AG	3	6	58905	58910	50 %	0 %	50 %	0 %	94152401
62	NC_007971	GC	3	6	59206	59211	0 %	0 %	50 %	50 %	94152400
63	NC_007971	TG	3	6	59310	59315	0 %	50 %	50 %	0 %	94152400
64	NC_007971	CG	3	6	59846	59851	0 %	0 %	50 %	50 %	94152400
65	NC_007971	CA	3	6	60353	60358	50 %	0 %	0 %	50 %	94152400
66	NC_007971	CG	3	6	61277	61282	0 %	0 %	50 %	50 %	94152399
67	NC_007971	CA	3	6	61690	61695	50 %	0 %	0 %	50 %	94152399
68	NC_007971	GT	3	6	61769	61774	0 %	50 %	50 %	0 %	94152399
69	NC_007971	CG	4	8	61821	61828	0 %	0 %	50 %	50 %	94152399
70	NC_007971	AG	4	8	62919	62926	50 %	0 %	50 %	0 %	94152397
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72	NC_007971	GC	3	6	65209	65214	0 %	0 %	50 %	50 %	94152395
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74	NC_007971	CG	3	6	68377	68382	0 %	0 %	50 %	50 %	94152391
75	NC_007971	GC	3	6	70069	70074	0 %	0 %	50 %	50 %	94152390
76	NC_007971	GC	4	8	70215	70222	0 %	0 %	50 %	50 %	94152390
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81	NC_007971	CG	3	6	71054	71059	0 %	0 %	50 %	50 %	94152390
82	NC_007971	CG	3	6	71233	71238	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
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84	NC_007971	GC	3	6	71323	71328	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
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91	NC_007971	GC	3	6	71707	71712	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
92	NC_007971	GC	4	8	71857	71864	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
93	NC_007971	CG	3	6	71918	71923	0 %	0 %	50 %	50 %	94152389
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98	NC_007971	CG	3	6	76641	76646	0 %	0 %	50 %	50 %	94152384
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102	NC_007971	CG	3	6	79547	79552	0 %	0 %	50 %	50 %	94152382
103	NC_007971	GC	3	6	79647	79652	0 %	0 %	50 %	50 %	94152382
104	NC_007971	TG	3	6	79700	79705	0 %	50 %	50 %	0 %	94152382
105	NC_007971	GC	3	6	80589	80594	0 %	0 %	50 %	50 %	94152382
106	NC_007971	CG	3	6	80919	80924	0 %	0 %	50 %	50 %	94152382
107	NC_007971	CG	3	6	84212	84217	0 %	0 %	50 %	50 %	94152379
108	NC_007971	TG	3	6	87595	87600	0 %	50 %	50 %	0 %	94152375
109	NC_007971	CA	3	6	88048	88053	50 %	0 %	0 %	50 %	94152375
110	NC_007971	GC	3	6	88165	88170	0 %	0 %	50 %	50 %	94152374
111	NC_007971	GC	3	6	88815	88820	0 %	0 %	50 %	50 %	94152373
112	NC_007971	GC	3	6	89968	89973	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
113	NC_007971	AC	3	6	90356	90361	50 %	0 %	0 %	50 %	94152372
114	NC_007971	GC	3	6	90413	90418	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
115	NC_007971	GC	3	6	90471	90476	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
116	NC_007971	GC	3	6	91031	91036	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
117	NC_007971	GC	4	8	91075	91082	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
118	NC_007971	GC	3	6	91560	91565	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
119	NC_007971	GC	4	8	91570	91577	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
120	NC_007971	GC	3	6	91641	91646	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
121	NC_007971	GC	3	6	91734	91739	0 %	0 %	50 %	50 %	94152372
122	NC_007971	GC	4	8	92263	92270	0 %	0 %	50 %	50 %	94152371
123	NC_007971	CG	3	6	93192	93197	0 %	0 %	50 %	50 %	94152370
124	NC_007971	CG	3	6	93604	93609	0 %	0 %	50 %	50 %	94152370
125	NC_007971	TG	3	6	93628	93633	0 %	50 %	50 %	0 %	94152370
126	NC_007971	GT	3	6	94126	94131	0 %	50 %	50 %	0 %	94152369
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128	NC_007971	CG	3	6	95690	95695	0 %	0 %	50 %	50 %	94152368
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131	NC_007971	CG	3	6	105417	105422	0 %	0 %	50 %	50 %	94152356
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144	NC_007971	CT	4	8	115175	115182	0 %	50 %	0 %	50 %	94152347
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.