MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007971	C	7	7	1294	1300	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
2	NC_007971	C	8	8	1398	1405	0 %	0 %	0 %	100 %	94152464
3	NC_007971	T	7	7	2276	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007971	G	6	6	2408	2413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007971	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	94152462
6	NC_007971	C	6	6	7174	7179	0 %	0 %	0 %	100 %	94152461
7	NC_007971	T	8	8	7271	7278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007971	T	7	7	12216	12222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007971	T	7	7	12246	12252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007971	A	10	10	12312	12321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007971	T	6	6	14479	14484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007971	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007971	A	7	7	22743	22749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007971	C	6	6	24704	24709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_007971	C	6	6	29020	29025	0 %	0 %	0 %	100 %	94152437
16	NC_007971	C	6	6	29597	29602	0 %	0 %	0 %	100 %	94152436
17	NC_007971	T	6	6	35871	35876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007971	A	6	6	38538	38543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007971	T	7	7	38908	38914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007971	T	6	6	41345	41350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007971	A	6	6	41451	41456	100 %	0 %	0 %	0 %	94152418
22	NC_007971	G	6	6	41610	41615	0 %	0 %	100 %	0 %	94152418
23	NC_007971	T	6	6	41979	41984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007971	G	6	6	42048	42053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007971	G	6	6	42087	42092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007971	T	6	6	46121	46126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007971	T	7	7	47611	47617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007971	G	8	8	50608	50615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007971	C	7	7	52114	52120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_007971	G	6	6	53845	53850	0 %	0 %	100 %	0 %	94152407
31	NC_007971	A	6	6	54290	54295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007971	C	6	6	55335	55340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_007971	A	7	7	60303	60309	100 %	0 %	0 %	0 %	94152400
34	NC_007971	G	6	6	61714	61719	0 %	0 %	100 %	0 %	94152399
35	NC_007971	T	7	7	65490	65496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007971	C	6	6	69052	69057	0 %	0 %	0 %	100 %	94152391
37	NC_007971	T	6	6	72185	72190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007971	C	6	6	73854	73859	0 %	0 %	0 %	100 %	94152387
39	NC_007971	G	6	6	74065	74070	0 %	0 %	100 %	0 %	94152386
40	NC_007971	G	6	6	74713	74718	0 %	0 %	100 %	0 %	94152386
41	NC_007971	C	6	6	75153	75158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_007971	T	7	7	76028	76034	0 %	100 %	0 %	0 %	94152384
43	NC_007971	A	7	7	85426	85432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007971	A	7	7	85954	85960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007971	T	7	7	88135	88141	0 %	100 %	0 %	0 %	94152374
46	NC_007971	T	7	7	90288	90294	0 %	100 %	0 %	0 %	94152372
47	NC_007971	A	6	6	95211	95216	100 %	0 %	0 %	0 %	94152368
48	NC_007971	G	6	6	96050	96055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007971	A	6	6	96595	96600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007971	C	7	7	97125	97131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_007971	C	6	6	108652	108657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_007971	C	6	6	110558	110563	0 %	0 %	0 %	100 %	94152351
53	NC_007971	A	6	6	112079	112084	100 %	0 %	0 %	0 %	94152350
54	NC_007971	G	6	6	120888	120893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007971	A	6	6	121480	121485	100 %	0 %	0 %	0 %	94152583
56	NC_007971	G	6	6	131136	131141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007971	C	7	7	136327	136333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_007971	G	6	6	146358	146363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007971	C	6	6	147667	147672	0 %	0 %	0 %	100 %	94152552
60	NC_007971	G	6	6	156517	156522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007971	T	8	8	159610	159617	0 %	100 %	0 %	0 %	94152542
62	NC_007971	C	6	6	165901	165906	0 %	0 %	0 %	100 %	94152538
63	NC_007971	G	6	6	167364	167369	0 %	0 %	100 %	0 %	94152537
64	NC_007971	A	6	6	175285	175290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007971	T	7	7	176588	176594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007971	A	6	6	178009	178014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007971	A	8	8	178368	178375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007971	A	7	7	179523	179529	100 %	0 %	0 %	0 %	94152525
69	NC_007971	G	7	7	180483	180489	0 %	0 %	100 %	0 %	94152523
70	NC_007971	T	6	6	181978	181983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007971	G	8	8	184099	184106	0 %	0 %	100 %	0 %	94152521
72	NC_007971	C	7	7	184995	185001	0 %	0 %	0 %	100 %	94152520
73	NC_007971	A	6	6	190520	190525	100 %	0 %	0 %	0 %	94152514
74	NC_007971	G	6	6	191899	191904	0 %	0 %	100 %	0 %	94152513
75	NC_007971	T	6	6	193304	193309	0 %	100 %	0 %	0 %	94152512
76	NC_007971	A	6	6	193850	193855	100 %	0 %	0 %	0 %	94152511
77	NC_007971	G	6	6	195449	195454	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007971	T	8	8	197316	197323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007971	G	6	6	201908	201913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007971	G	8	8	204070	204077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007971	A	6	6	205406	205411	100 %	0 %	0 %	0 %	94152497
82	NC_007971	C	7	7	207666	207672	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_007971	G	6	6	207681	207686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007971	G	6	6	209571	209576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007971	A	6	6	210626	210631	100 %	0 %	0 %	0 %	94152493
86	NC_007971	C	6	6	211358	211363	0 %	0 %	0 %	100 %	94152491
87	NC_007971	C	6	6	212118	212123	0 %	0 %	0 %	100 %	94152491
88	NC_007971	G	6	6	212976	212981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007971	A	7	7	213652	213658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007971	G	6	6	216942	216947	0 %	0 %	100 %	0 %	94152488
91	NC_007971	T	6	6	218741	218746	0 %	100 %	0 %	0 %	94152485
92	NC_007971	C	6	6	219100	219105	0 %	0 %	0 %	100 %	94152485
93	NC_007971	C	7	7	219129	219135	0 %	0 %	0 %	100 %	94152485
94	NC_007971	C	6	6	220530	220535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_007971	A	6	6	223541	223546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007971	A	7	7	225464	225470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007971	T	8	8	225631	225638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007971	T	7	7	227714	227720	0 %	100 %	0 %	0 %	94152475
99	NC_007971	G	6	6	228197	228202	0 %	0 %	100 %	0 %	94152474
100	NC_007971	T	6	6	230888	230893	0 %	100 %	0 %	0 %	94152470
101	NC_007971	T	6	6	233607	233612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.