MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 2858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007964	TGCGC	2	10	360	369	0 %	20 %	40 %	40 %	92115634
2	NC_007964	GGCGC	2	10	1534	1543	0 %	0 %	60 %	40 %	92115634
3	NC_007964	TCGCT	2	10	5702	5711	0 %	40 %	20 %	40 %	92115637
4	NC_007964	GCCGC	2	10	6846	6855	0 %	0 %	40 %	60 %	92115637
5	NC_007964	GATAG	2	10	9290	9299	40 %	20 %	40 %	0 %	92115640
6	NC_007964	TTCGG	2	10	9641	9650	0 %	40 %	40 %	20 %	92115640
7	NC_007964	ATCGA	2	10	10105	10114	40 %	20 %	20 %	20 %	92115641
8	NC_007964	GCGTC	2	10	12580	12589	0 %	20 %	40 %	40 %	92115644
9	NC_007964	CGTGG	2	10	13317	13326	0 %	20 %	60 %	20 %	92115644
10	NC_007964	CGGCT	2	10	14502	14511	0 %	20 %	40 %	40 %	92115645
11	NC_007964	ACCGC	2	10	20183	20192	20 %	0 %	20 %	60 %	92115651
12	NC_007964	CCGGC	2	10	20635	20644	0 %	0 %	40 %	60 %	92115652
13	NC_007964	TCGCC	2	10	22238	22247	0 %	20 %	20 %	60 %	92115654
14	NC_007964	CGCGC	2	10	22740	22749	0 %	0 %	40 %	60 %	92115654
15	NC_007964	GCTCG	2	10	22871	22880	0 %	20 %	40 %	40 %	92115654
16	NC_007964	CGGCT	2	10	23557	23566	0 %	20 %	40 %	40 %	92115655
17	NC_007964	AAGCG	2	10	25062	25071	40 %	0 %	40 %	20 %	92115657
18	NC_007964	CCGGC	2	10	27000	27009	0 %	0 %	40 %	60 %	92115658
19	NC_007964	CCGAT	2	10	29350	29359	20 %	20 %	20 %	40 %	92115661
20	NC_007964	ACGCC	2	10	29432	29441	20 %	0 %	20 %	60 %	92115661
21	NC_007964	GCCTC	2	10	30883	30892	0 %	20 %	20 %	60 %	92115662
22	NC_007964	GCCGG	2	10	31739	31748	0 %	0 %	60 %	40 %	92115663
23	NC_007964	ATTCG	2	10	35486	35495	20 %	40 %	20 %	20 %	92115666
24	NC_007964	TGGCG	2	10	38522	38531	0 %	20 %	60 %	20 %	92115668
25	NC_007964	CGCGC	2	10	39438	39447	0 %	0 %	40 %	60 %	92115668
26	NC_007964	CCGTC	2	10	40306	40315	0 %	20 %	20 %	60 %	92115669
27	NC_007964	CGGCG	2	10	40377	40386	0 %	0 %	60 %	40 %	92115669
28	NC_007964	TCCGA	2	10	40965	40974	20 %	20 %	20 %	40 %	92115670
29	NC_007964	TGGCA	2	10	41116	41125	20 %	20 %	40 %	20 %	92115670
30	NC_007964	GACCG	2	10	42656	42665	20 %	0 %	40 %	40 %	92115670
31	NC_007964	CAGCG	2	10	44845	44854	20 %	0 %	40 %	40 %	92115672
32	NC_007964	GCTGG	2	10	48189	48198	0 %	20 %	60 %	20 %	92115675
33	NC_007964	GCCGC	2	10	50028	50037	0 %	0 %	40 %	60 %	92115677
34	NC_007964	TCGGC	2	10	52232	52241	0 %	20 %	40 %	40 %	92115679
35	NC_007964	CCGGC	2	10	52245	52254	0 %	0 %	40 %	60 %	92115679
36	NC_007964	CGCAG	2	10	53057	53066	20 %	0 %	40 %	40 %	92115679
37	NC_007964	GTCGA	2	10	54832	54841	20 %	20 %	40 %	20 %	92115681
38	NC_007964	TGCGC	2	10	55793	55802	0 %	20 %	40 %	40 %	92115682
39	NC_007964	CTCGC	2	10	56346	56355	0 %	20 %	20 %	60 %	92115682
40	NC_007964	TTGAT	2	10	56525	56534	20 %	60 %	20 %	0 %	92115682
41	NC_007964	GCCGA	2	10	57293	57302	20 %	0 %	40 %	40 %	92115683
42	NC_007964	CGGCG	2	10	58363	58372	0 %	0 %	60 %	40 %	92115684
43	NC_007964	CGCGG	2	10	61234	61243	0 %	0 %	60 %	40 %	92115685
44	NC_007964	CGACC	2	10	61302	61311	20 %	0 %	20 %	60 %	92115685
45	NC_007964	ATTGC	2	10	62246	62255	20 %	40 %	20 %	20 %	92115686
46	NC_007964	GCGCA	2	10	62724	62733	20 %	0 %	40 %	40 %	92115686
47	NC_007964	GATCA	2	10	63776	63785	40 %	20 %	20 %	20 %	92115688
48	NC_007964	CCGCT	2	10	69321	69330	0 %	20 %	20 %	60 %	92115690
49	NC_007964	GCCCC	2	10	70854	70863	0 %	0 %	20 %	80 %	92115690
50	NC_007964	GCGCC	2	10	71415	71424	0 %	0 %	40 %	60 %	92115691
51	NC_007964	CGCGG	2	10	72279	72288	0 %	0 %	60 %	40 %	92115692
52	NC_007964	TCGGC	2	10	73077	73086	0 %	20 %	40 %	40 %	92115693
53	NC_007964	TCGCC	2	10	73551	73560	0 %	20 %	20 %	60 %	92115693
54	NC_007964	GCCGA	2	10	74294	74303	20 %	0 %	40 %	40 %	92115694
55	NC_007964	ATCGG	2	10	74825	74834	20 %	20 %	40 %	20 %	92115694
56	NC_007964	AATCC	2	10	75269	75278	40 %	20 %	0 %	40 %	92115695
57	NC_007964	GCGCC	2	10	75882	75891	0 %	0 %	40 %	60 %	92115695
58	NC_007964	GCGTC	2	10	76862	76871	0 %	20 %	40 %	40 %	92115696
59	NC_007964	CCGGC	2	10	77348	77357	0 %	0 %	40 %	60 %	92115697
60	NC_007964	TCGCT	2	10	77785	77794	0 %	40 %	20 %	40 %	92115698
61	NC_007964	GCCGC	2	10	78593	78602	0 %	0 %	40 %	60 %	92115699
62	NC_007964	CCAGG	2	10	79939	79948	20 %	0 %	40 %	40 %	92115700
63	NC_007964	CGCGC	2	10	81064	81073	0 %	0 %	40 %	60 %	92115702
64	NC_007964	CCATG	2	10	81859	81868	20 %	20 %	20 %	40 %	92115703
65	NC_007964	GAGCA	2	10	82787	82796	40 %	0 %	40 %	20 %	92115703
66	NC_007964	CGTCT	2	10	83740	83749	0 %	40 %	20 %	40 %	92115704
67	NC_007964	TTCGC	2	10	84234	84243	0 %	40 %	20 %	40 %	92115705
68	NC_007964	CGAGG	2	10	87501	87510	20 %	0 %	60 %	20 %	92115706
69	NC_007964	ATGCG	2	10	89722	89731	20 %	20 %	40 %	20 %	92115710
70	NC_007964	AGATG	2	10	91026	91035	40 %	20 %	40 %	0 %	92115711
71	NC_007964	GCCAG	2	10	98873	98882	20 %	0 %	40 %	40 %	92115716
72	NC_007964	CGCAC	2	10	100371	100380	20 %	0 %	20 %	60 %	92115719
73	NC_007964	GCCAC	2	10	104262	104271	20 %	0 %	20 %	60 %	92115722
74	NC_007964	GCTGG	2	10	104740	104749	0 %	20 %	60 %	20 %	92115722
75	NC_007964	CGAAC	2	10	104881	104890	40 %	0 %	20 %	40 %	92115722
76	NC_007964	CCGCG	2	10	105114	105123	0 %	0 %	40 %	60 %	92115722
77	NC_007964	GCCGG	2	10	109682	109691	0 %	0 %	60 %	40 %	92115726
78	NC_007964	GCCGA	2	10	111036	111045	20 %	0 %	40 %	40 %	92115728
79	NC_007964	CGAGG	2	10	115073	115082	20 %	0 %	60 %	20 %	92115730
80	NC_007964	GCCCT	2	10	115557	115566	0 %	20 %	20 %	60 %	92115731
81	NC_007964	CCGCG	2	10	115724	115733	0 %	0 %	40 %	60 %	92115731
82	NC_007964	GCCCG	2	10	115844	115853	0 %	0 %	40 %	60 %	92115732
83	NC_007964	TGCGC	2	10	118159	118168	0 %	20 %	40 %	40 %	92115734
84	NC_007964	ATCGC	2	10	118907	118916	20 %	20 %	20 %	40 %	92115735
85	NC_007964	CGGCA	2	10	120717	120726	20 %	0 %	40 %	40 %	92115737
86	NC_007964	CCCGC	2	10	121916	121925	0 %	0 %	20 %	80 %	92115737
87	NC_007964	CGCCT	2	10	122064	122073	0 %	20 %	20 %	60 %	92115737
88	NC_007964	CGAAC	2	10	122822	122831	40 %	0 %	20 %	40 %	92115738
89	NC_007964	CCGCG	2	10	125532	125541	0 %	0 %	40 %	60 %	92115739
90	NC_007964	GCGCT	2	10	125587	125596	0 %	20 %	40 %	40 %	92115739
91	NC_007964	ACGAG	2	10	127542	127551	40 %	0 %	40 %	20 %	92115740
92	NC_007964	GCATT	2	10	128522	128531	20 %	40 %	20 %	20 %	92115741
93	NC_007964	CGGCG	2	10	133308	133317	0 %	0 %	60 %	40 %	92115746
94	NC_007964	GCCGG	2	10	137026	137035	0 %	0 %	60 %	40 %	92115750
95	NC_007964	CACCG	2	10	138740	138749	20 %	0 %	20 %	60 %	92115752
96	NC_007964	CGCGG	2	10	139980	139989	0 %	0 %	60 %	40 %	92115753
97	NC_007964	GACGG	2	10	141159	141168	20 %	0 %	60 %	20 %	92115755
98	NC_007964	CGGGC	2	10	141569	141578	0 %	0 %	60 %	40 %	92115755
99	NC_007964	GCGCG	2	10	141702	141711	0 %	0 %	60 %	40 %	92115756
100	NC_007964	CGCGC	2	10	142911	142920	0 %	0 %	40 %	60 %	92115757
101	NC_007964	CCGCG	2	10	143001	143010	0 %	0 %	40 %	60 %	92115757
102	NC_007964	CAGCG	2	10	143349	143358	20 %	0 %	40 %	40 %	92115758
103	NC_007964	GCCAA	2	10	143762	143771	40 %	0 %	20 %	40 %	92115758
104	NC_007964	GCGCA	2	10	144166	144175	20 %	0 %	40 %	40 %	92115759
105	NC_007964	TCGAT	2	10	148251	148260	20 %	40 %	20 %	20 %	92115762
106	NC_007964	GCTAC	2	10	149457	149466	20 %	20 %	20 %	40 %	92115763
107	NC_007964	AATGC	2	10	150109	150118	40 %	20 %	20 %	20 %	92115764
108	NC_007964	ATCGC	2	10	153288	153297	20 %	20 %	20 %	40 %	92115767
109	NC_007964	CGATC	2	10	154961	154970	20 %	20 %	20 %	40 %	92115768
110	NC_007964	ACGGC	2	10	155938	155947	20 %	0 %	40 %	40 %	92115769
111	NC_007964	CAGAT	2	10	157970	157979	40 %	20 %	20 %	20 %	92115771
112	NC_007964	CGATC	2	10	158100	158109	20 %	20 %	20 %	40 %	92115771
113	NC_007964	GCTGG	2	10	160005	160014	0 %	20 %	60 %	20 %	92115772
114	NC_007964	CTGCC	2	10	161076	161085	0 %	20 %	20 %	60 %	92115774
115	NC_007964	ATGTT	2	10	161334	161343	20 %	60 %	20 %	0 %	92115774
116	NC_007964	TCCGC	2	10	163845	163854	0 %	20 %	20 %	60 %	92115776
117	NC_007964	ACGAA	2	10	164864	164873	60 %	0 %	20 %	20 %	92115777
118	NC_007964	TCGCG	2	10	165828	165837	0 %	20 %	40 %	40 %	92115779
119	NC_007964	GGCCG	2	10	166425	166434	0 %	0 %	60 %	40 %	92115779
120	NC_007964	CGGCG	2	10	167710	167719	0 %	0 %	60 %	40 %	92115780
121	NC_007964	TCGCT	2	10	167735	167744	0 %	40 %	20 %	40 %	92115780
122	NC_007964	TTCCG	2	10	168113	168122	0 %	40 %	20 %	40 %	92115780
123	NC_007964	AGATC	2	10	168889	168898	40 %	20 %	20 %	20 %	92115781
124	NC_007964	CGTGC	2	10	169566	169575	0 %	20 %	40 %	40 %	92115782
125	NC_007964	GCTTC	2	10	176915	176924	0 %	40 %	20 %	40 %	92115788
126	NC_007964	CGCAT	2	10	177571	177580	20 %	20 %	20 %	40 %	92115788
127	NC_007964	GCAAC	2	10	177712	177721	40 %	0 %	20 %	40 %	92115788
128	NC_007964	CCGCA	2	10	181312	181321	20 %	0 %	20 %	60 %	92115792
129	NC_007964	TGACC	2	10	184306	184315	20 %	20 %	20 %	40 %	92115795
130	NC_007964	CGATG	2	10	186077	186086	20 %	20 %	40 %	20 %	92115797
131	NC_007964	TCATC	2	10	190202	190211	20 %	40 %	0 %	40 %	92115801
132	NC_007964	GGCGC	2	10	190220	190229	0 %	0 %	60 %	40 %	92115801
133	NC_007964	TGCGC	2	10	194928	194937	0 %	20 %	40 %	40 %	92115805
134	NC_007964	CAGCG	2	10	196015	196024	20 %	0 %	40 %	40 %	92115806
135	NC_007964	CGCGG	2	10	197418	197427	0 %	0 %	60 %	40 %	92115808
136	NC_007964	TTCGA	2	10	198001	198010	20 %	40 %	20 %	20 %	92115809
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