MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 60727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007964	CTG	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
2	NC_007964	ACG	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
3	NC_007964	CGC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
4	NC_007964	CGG	2	6	564	569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115634
5	NC_007964	CAT	2	6	604	609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115634
6	NC_007964	CTG	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
7	NC_007964	CCG	2	6	720	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
8	NC_007964	TCG	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
9	NC_007964	CGA	2	6	817	822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
10	NC_007964	GGT	3	9	901	909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
11	NC_007964	CGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
12	NC_007964	CGG	2	6	973	978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115634
13	NC_007964	GGT	2	6	1273	1278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
14	NC_007964	GTG	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
15	NC_007964	GCC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
16	NC_007964	ACC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115634
17	NC_007964	TGC	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
18	NC_007964	CTG	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
19	NC_007964	CGG	2	6	1804	1809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
20	NC_007964	GGC	2	6	1908	1913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
21	NC_007964	CGG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
22	NC_007964	GCC	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115635
23	NC_007964	GAG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115635
24	NC_007964	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92115635
25	NC_007964	GCG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
26	NC_007964	TCA	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115635
27	NC_007964	CGT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
28	NC_007964	AAC	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115635
29	NC_007964	TCG	2	6	2525	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
30	NC_007964	GGC	2	6	2547	2552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
31	NC_007964	CGA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115635
32	NC_007964	CGG	2	6	2612	2617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
33	NC_007964	GAG	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115635
34	NC_007964	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
35	NC_007964	CGC	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115635
36	NC_007964	GCT	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
37	NC_007964	GCG	2	6	3185	3190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
38	NC_007964	AGG	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115636
39	NC_007964	ATC	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115636
40	NC_007964	CAG	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
41	NC_007964	CGG	2	6	3364	3369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
42	NC_007964	CGG	2	6	3444	3449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
43	NC_007964	CTT	2	6	3452	3457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92115636
44	NC_007964	CGA	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
45	NC_007964	GCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
46	NC_007964	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
47	NC_007964	GGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115636
48	NC_007964	GCC	3	9	3804	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115636
49	NC_007964	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
50	NC_007964	GCT	4	12	3974	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
51	NC_007964	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
52	NC_007964	CCG	2	6	4016	4021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115636
53	NC_007964	CCG	2	6	4469	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
54	NC_007964	GCA	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
55	NC_007964	GTC	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
56	NC_007964	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
57	NC_007964	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
58	NC_007964	TCA	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
59	NC_007964	CGG	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
60	NC_007964	CGG	2	6	4839	4844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
61	NC_007964	GGT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
62	NC_007964	GTC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
63	NC_007964	CGT	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
64	NC_007964	GAT	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115637
65	NC_007964	ACG	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
66	NC_007964	GCG	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
67	NC_007964	TCG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
68	NC_007964	CAA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
69	NC_007964	GGC	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
70	NC_007964	TGG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
71	NC_007964	CAA	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
72	NC_007964	CGG	2	6	5340	5345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
73	NC_007964	CGA	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
74	NC_007964	TCG	2	6	5500	5505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
75	NC_007964	GGT	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
76	NC_007964	TCA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
77	NC_007964	GGT	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
78	NC_007964	GGC	4	12	5634	5645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
79	NC_007964	GTT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92115637
80	NC_007964	TCG	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
81	NC_007964	GTC	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
82	NC_007964	ATC	2	6	5980	5985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
83	NC_007964	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115637
84	NC_007964	GCT	3	9	6027	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
85	NC_007964	TTC	3	9	6040	6048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92115637
86	NC_007964	GCC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
87	NC_007964	CGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
88	NC_007964	TGG	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
89	NC_007964	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
90	NC_007964	ACA	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
91	NC_007964	GGC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
92	NC_007964	CGG	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
93	NC_007964	CGC	2	6	6381	6386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
94	NC_007964	CGA	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
95	NC_007964	GCG	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
96	NC_007964	CGA	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
97	NC_007964	GCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
98	NC_007964	CGA	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
99	NC_007964	GCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
100	NC_007964	AGG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115637
101	NC_007964	CGA	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
102	NC_007964	CGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
103	NC_007964	GAT	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
104	NC_007964	CGC	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
105	NC_007964	GCG	2	6	7445	7450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
106	NC_007964	ATC	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115638
107	NC_007964	ACG	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
108	NC_007964	CAA	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115638
109	NC_007964	AGG	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115638
110	NC_007964	GCA	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
111	NC_007964	GCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
112	NC_007964	TCG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115638
113	NC_007964	GCA	4	12	7841	7852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
114	NC_007964	GAT	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
115	NC_007964	GCG	2	6	7913	7918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
116	NC_007964	CCG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
117	NC_007964	CCG	2	6	8002	8007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
118	NC_007964	GAT	2	6	8070	8075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
119	NC_007964	CGA	3	9	8123	8131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
120	NC_007964	GCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
121	NC_007964	GGC	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
122	NC_007964	CGG	2	6	8771	8776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115639
123	NC_007964	CCG	2	6	8882	8887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115639
124	NC_007964	GCG	2	6	9174	9179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115640
125	NC_007964	TGC	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115640
126	NC_007964	CGC	2	6	9338	9343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115640
127	NC_007964	GAA	2	6	9441	9446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92115640
128	NC_007964	GAC	2	6	9447	9452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115640
129	NC_007964	GCG	2	6	9575	9580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115640
130	NC_007964	CCA	2	6	9627	9632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115640
131	NC_007964	CGA	2	6	9653	9658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115640
132	NC_007964	GCG	2	6	9710	9715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115640
133	NC_007964	GAT	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115640
134	NC_007964	TCG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115640
135	NC_007964	CGA	2	6	9818	9823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115640
136	NC_007964	TCG	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115640
137	NC_007964	GCG	2	6	9860	9865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115640
138	NC_007964	TCA	2	6	9890	9895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115640
139	NC_007964	GAT	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115641
140	NC_007964	ACC	2	6	10072	10077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115641
141	NC_007964	CCG	2	6	10120	10125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115641
142	NC_007964	CGC	2	6	10603	10608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115642
143	NC_007964	TCT	2	6	10649	10654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92115642
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145	NC_007964	TGA	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115642
146	NC_007964	CCG	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115642
147	NC_007964	CGG	2	6	10919	10924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115642
148	NC_007964	GAG	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115642
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151	NC_007964	CGG	2	6	11259	11264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115642
152	NC_007964	TGG	2	6	11293	11298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115642
153	NC_007964	TCC	2	6	11308	11313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92115642
154	NC_007964	AGA	2	6	11340	11345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92115642
155	NC_007964	GCG	2	6	11501	11506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115643
156	NC_007964	CGG	2	6	11568	11573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115643
157	NC_007964	GGT	2	6	11593	11598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115643
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162	NC_007964	GCG	3	9	11966	11974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115643
163	NC_007964	CCG	2	6	11994	11999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115643
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165	NC_007964	AGC	2	6	12072	12077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115643
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248	NC_007964	ATC	2	6	17261	17266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115648
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256	NC_007964	CGG	2	6	17951	17956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115649
257	NC_007964	CGT	2	6	17987	17992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115649
258	NC_007964	CTG	2	6	18066	18071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115649
259	NC_007964	CGA	2	6	18154	18159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115650
260	NC_007964	AGC	2	6	18273	18278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115650
261	NC_007964	CGC	2	6	18304	18309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115650
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263	NC_007964	CGC	2	6	18391	18396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115650
264	NC_007964	CAT	2	6	18428	18433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115650
265	NC_007964	CGG	2	6	18508	18513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115650
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290	NC_007964	CGG	2	6	19848	19853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115651
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500	NC_007964	TGA	2	6	33239	33244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115664

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