MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 2695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007963	ACCAC	2	10	1474	1483	40 %	0 %	0 %	60 %	92112137
2	NC_007963	CCGGG	2	10	2893	2902	0 %	0 %	60 %	40 %	92112139
3	NC_007963	TCGCT	2	10	3483	3492	0 %	40 %	20 %	40 %	92112139
4	NC_007963	AGGGA	2	10	7149	7158	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007963	TGCGC	2	10	8355	8364	0 %	20 %	40 %	40 %	92112142
6	NC_007963	CGGCG	2	10	9293	9302	0 %	0 %	60 %	40 %	92112142
7	NC_007963	ACAGC	2	10	13758	13767	40 %	0 %	20 %	40 %	92112146
8	NC_007963	CATGG	2	10	14205	14214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007963	CGCGT	2	10	14221	14230	0 %	20 %	40 %	40 %	92112147
10	NC_007963	CTTGC	2	10	16095	16104	0 %	40 %	20 %	40 %	92112149
11	NC_007963	GATCG	2	10	17297	17306	20 %	20 %	40 %	20 %	92112150
12	NC_007963	GCCGA	2	10	18579	18588	20 %	0 %	40 %	40 %	92112150
13	NC_007963	CGCTG	2	10	20284	20293	0 %	20 %	40 %	40 %	92112152
14	NC_007963	TGCGC	2	10	20648	20657	0 %	20 %	40 %	40 %	92112152
15	NC_007963	AGACG	2	10	22485	22494	40 %	0 %	40 %	20 %	92112154
16	NC_007963	GCGCG	2	10	22694	22703	0 %	0 %	60 %	40 %	92112154
17	NC_007963	GGTCG	2	10	22968	22977	0 %	20 %	60 %	20 %	92112154
18	NC_007963	ACGCC	2	10	24448	24457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007963	GCTGC	2	10	27118	27127	0 %	20 %	40 %	40 %	92112157
20	NC_007963	TCGCT	2	10	28386	28395	0 %	40 %	20 %	40 %	92112159
21	NC_007963	GTGCC	2	10	29543	29552	0 %	20 %	40 %	40 %	92112160
22	NC_007963	TGACC	2	10	29609	29618	20 %	20 %	20 %	40 %	92112160
23	NC_007963	GTGGC	2	10	30764	30773	0 %	20 %	60 %	20 %	92112161
24	NC_007963	AGACG	2	10	31811	31820	40 %	0 %	40 %	20 %	92112162
25	NC_007963	GCTGC	2	10	31961	31970	0 %	20 %	40 %	40 %	92112162
26	NC_007963	GTGGC	2	10	31984	31993	0 %	20 %	60 %	20 %	92112162
27	NC_007963	CGTGG	2	10	32361	32370	0 %	20 %	60 %	20 %	92112162
28	NC_007963	ATGGC	2	10	32659	32668	20 %	20 %	40 %	20 %	92112163
29	NC_007963	CATGA	2	10	33633	33642	40 %	20 %	20 %	20 %	92112163
30	NC_007963	GGGAA	2	10	35276	35285	40 %	0 %	60 %	0 %	92112164
31	NC_007963	TGCGT	2	10	36519	36528	0 %	40 %	40 %	20 %	92112166
32	NC_007963	ACGCC	2	10	36868	36877	20 %	0 %	20 %	60 %	92112166
33	NC_007963	CAGTG	2	10	37838	37847	20 %	20 %	40 %	20 %	92112167
34	NC_007963	TGCGG	2	10	38871	38880	0 %	20 %	60 %	20 %	92112168
35	NC_007963	GGCGA	2	10	42378	42387	20 %	0 %	60 %	20 %	92112170
36	NC_007963	CTTCC	2	10	42608	42617	0 %	40 %	0 %	60 %	92112170
37	NC_007963	AAATA	2	10	44759	44768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007963	AAAAT	2	10	44894	44903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007963	CAGCG	2	10	45095	45104	20 %	0 %	40 %	40 %	92112172
40	NC_007963	GCCGG	2	10	46738	46747	0 %	0 %	60 %	40 %	92112174
41	NC_007963	GGCGG	2	10	48437	48446	0 %	0 %	80 %	20 %	92112176
42	NC_007963	AGGCC	2	10	49087	49096	20 %	0 %	40 %	40 %	92112176
43	NC_007963	TTCGA	2	10	49599	49608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007963	TGCGC	2	10	49649	49658	0 %	20 %	40 %	40 %	92112177
45	NC_007963	GGGTG	2	10	51660	51669	0 %	20 %	80 %	0 %	92112179
46	NC_007963	CACGG	2	10	51977	51986	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007963	GCACG	2	10	55911	55920	20 %	0 %	40 %	40 %	92112182
48	NC_007963	GACGG	2	10	56227	56236	20 %	0 %	60 %	20 %	92112182
49	NC_007963	ACGTC	2	10	58736	58745	20 %	20 %	20 %	40 %	92112186
50	NC_007963	GCGTG	2	10	58808	58817	0 %	20 %	60 %	20 %	92112186
51	NC_007963	GCCGG	2	10	59056	59065	0 %	0 %	60 %	40 %	92112186
52	NC_007963	TGCCG	2	10	60036	60045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007963	AGTTC	2	10	61205	61214	20 %	40 %	20 %	20 %	92112187
54	NC_007963	CCCGG	2	10	63924	63933	0 %	0 %	40 %	60 %	92112188
55	NC_007963	GTCGC	2	10	65603	65612	0 %	20 %	40 %	40 %	92112189
56	NC_007963	CCGTC	2	10	68506	68515	0 %	20 %	20 %	60 %	92112190
57	NC_007963	GACCA	2	10	68963	68972	40 %	0 %	20 %	40 %	92112190
58	NC_007963	GGCCA	2	10	71471	71480	20 %	0 %	40 %	40 %	92112190
59	NC_007963	GGCCA	2	10	71768	71777	20 %	0 %	40 %	40 %	92112190
60	NC_007963	GGCCA	2	10	72362	72371	20 %	0 %	40 %	40 %	92112190
61	NC_007963	CGTCG	2	10	73964	73973	0 %	20 %	40 %	40 %	92112190
62	NC_007963	GTGTC	2	10	74482	74491	0 %	40 %	40 %	20 %	92112190
63	NC_007963	TCGCC	2	10	74989	74998	0 %	20 %	20 %	60 %	92112190
64	NC_007963	CCCGC	2	10	76050	76059	0 %	0 %	20 %	80 %	92112191
65	NC_007963	GCCGC	2	10	77076	77085	0 %	0 %	40 %	60 %	92112192
66	NC_007963	AGGCG	2	10	77885	77894	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007963	CGGCG	2	10	79546	79555	0 %	0 %	60 %	40 %	92112195
68	NC_007963	TGGCG	2	10	80064	80073	0 %	20 %	60 %	20 %	92112195
69	NC_007963	AGCGC	2	10	80868	80877	20 %	0 %	40 %	40 %	92112196
70	NC_007963	GCCTG	2	10	81433	81442	0 %	20 %	40 %	40 %	92112197
71	NC_007963	CATGC	2	10	83518	83527	20 %	20 %	20 %	40 %	92112199
72	NC_007963	GGGGC	2	10	84467	84476	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007963	CGGCT	2	10	86035	86044	0 %	20 %	40 %	40 %	92112201
74	NC_007963	TGGCG	2	10	89239	89248	0 %	20 %	60 %	20 %	92112205
75	NC_007963	CCTGG	2	10	93510	93519	0 %	20 %	40 %	40 %	92112209
76	NC_007963	CGGTG	2	10	94316	94325	0 %	20 %	60 %	20 %	92112210
77	NC_007963	TCGCC	2	10	98869	98878	0 %	20 %	20 %	60 %	92112213
78	NC_007963	GCGTG	2	10	100719	100728	0 %	20 %	60 %	20 %	92112216
79	NC_007963	GCCAG	2	10	101654	101663	20 %	0 %	40 %	40 %	92112217
80	NC_007963	AGGGA	2	10	101762	101771	40 %	0 %	60 %	0 %	92112217
81	NC_007963	CGGTG	2	10	102487	102496	0 %	20 %	60 %	20 %	92112218
82	NC_007963	GCCGC	2	10	106268	106277	0 %	0 %	40 %	60 %	92112220
83	NC_007963	GGCGC	2	10	108561	108570	0 %	0 %	60 %	40 %	92112222
84	NC_007963	TCGTT	2	10	109004	109013	0 %	60 %	20 %	20 %	92112222
85	NC_007963	CGGCC	2	10	115226	115235	0 %	0 %	40 %	60 %	92112226
86	NC_007963	AGGCC	2	10	115292	115301	20 %	0 %	40 %	40 %	92112226
87	NC_007963	CGAGG	2	10	116827	116836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007963	GCGCC	2	10	118300	118309	0 %	0 %	40 %	60 %	92112229
89	NC_007963	GCTGG	2	10	119796	119805	0 %	20 %	60 %	20 %	92112229
90	NC_007963	GTGCT	2	10	120339	120348	0 %	40 %	40 %	20 %	92112230
91	NC_007963	GGCAT	2	10	123833	123842	20 %	20 %	40 %	20 %	92112234
92	NC_007963	AGCCC	2	10	124345	124354	20 %	0 %	20 %	60 %	92112234
93	NC_007963	TCGAC	2	10	125485	125494	20 %	20 %	20 %	40 %	92112235
94	NC_007963	GCCTG	2	10	127781	127790	0 %	20 %	40 %	40 %	92112238
95	NC_007963	CTGGG	2	10	127927	127936	0 %	20 %	60 %	20 %	92112238
96	NC_007963	CGTGC	2	10	131371	131380	0 %	20 %	40 %	40 %	92112242
97	NC_007963	GCGCG	2	10	133001	133010	0 %	0 %	60 %	40 %	92112245
98	NC_007963	GCCAT	2	10	136443	136452	20 %	20 %	20 %	40 %	92112248
99	NC_007963	CTGGA	2	10	140008	140017	20 %	20 %	40 %	20 %	92112251
100	NC_007963	TCGCC	2	10	140096	140105	0 %	20 %	20 %	60 %	92112251
101	NC_007963	GTGAC	2	10	141947	141956	20 %	20 %	40 %	20 %	92112254
102	NC_007963	GGCCA	2	10	144446	144455	20 %	0 %	40 %	40 %	92112256
103	NC_007963	ATCGA	2	10	145680	145689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007963	CAAGG	2	10	147542	147551	40 %	0 %	40 %	20 %	92112260
105	NC_007963	TAAGG	2	10	150812	150821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007963	CGGCC	2	10	151627	151636	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_007963	GCGAT	2	10	151849	151858	20 %	20 %	40 %	20 %	92112264
108	NC_007963	TGGCC	2	10	153373	153382	0 %	20 %	40 %	40 %	92112266
109	NC_007963	CGGGC	2	10	154200	154209	0 %	0 %	60 %	40 %	92112267
110	NC_007963	CGGCT	2	10	155539	155548	0 %	20 %	40 %	40 %	92112269
111	NC_007963	TGGCC	2	10	156972	156981	0 %	20 %	40 %	40 %	92112270
112	NC_007963	CGCCT	2	10	157564	157573	0 %	20 %	20 %	60 %	92112271
113	NC_007963	CGGGA	2	10	157937	157946	20 %	0 %	60 %	20 %	92112271
114	NC_007963	GTGAC	2	10	158053	158062	20 %	20 %	40 %	20 %	92112271
115	NC_007963	TTGCT	2	10	158580	158589	0 %	60 %	20 %	20 %	92112272
116	NC_007963	TGCTG	2	10	159728	159737	0 %	40 %	40 %	20 %	92112272
117	NC_007963	CACGG	2	10	160586	160595	20 %	0 %	40 %	40 %	92112274
118	NC_007963	GGCGC	2	10	161948	161957	0 %	0 %	60 %	40 %	92112275
119	NC_007963	CGTGC	2	10	162052	162061	0 %	20 %	40 %	40 %	92112276
120	NC_007963	AAGGG	2	10	163447	163456	40 %	0 %	60 %	0 %	92112277
121	NC_007963	TGCGC	2	10	165415	165424	0 %	20 %	40 %	40 %	92112278
122	NC_007963	GCGCT	2	10	166440	166449	0 %	20 %	40 %	40 %	92112279
123	NC_007963	ACGAC	2	10	167011	167020	40 %	0 %	20 %	40 %	92112279
124	NC_007963	CGATA	2	10	168768	168777	40 %	20 %	20 %	20 %	92112282
125	NC_007963	CCGTG	2	10	174814	174823	0 %	20 %	40 %	40 %	92112287
126	NC_007963	GGCGC	2	10	176473	176482	0 %	0 %	60 %	40 %	92112290
127	NC_007963	CGCAT	2	10	180246	180255	20 %	20 %	20 %	40 %	92112293
128	NC_007963	TTCGG	2	10	183803	183812	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007963	GCCGT	2	10	184111	184120	0 %	20 %	40 %	40 %	92112295
130	NC_007963	GCGTG	2	10	184365	184374	0 %	20 %	60 %	20 %	92112295
131	NC_007963	GCCGC	2	10	184806	184815	0 %	0 %	40 %	60 %	92112296
132	NC_007963	CTGCG	2	10	185258	185267	0 %	20 %	40 %	40 %	92112296
133	NC_007963	GCTGG	2	10	187911	187920	0 %	20 %	60 %	20 %	92112299
134	NC_007963	AGCCT	2	10	188272	188281	20 %	20 %	20 %	40 %	92112299
135	NC_007963	TGCGC	2	10	191605	191614	0 %	20 %	40 %	40 %	92112301
136	NC_007963	TCGGG	2	10	192151	192160	0 %	20 %	60 %	20 %	92112302
137	NC_007963	TGCGC	2	10	193589	193598	0 %	20 %	40 %	40 %	92112304
138	NC_007963	GCTGG	2	10	193640	193649	0 %	20 %	60 %	20 %	92112304
139	NC_007963	TGATC	2	10	196037	196046	20 %	40 %	20 %	20 %	92112305
140	NC_007963	GTGCC	2	10	196145	196154	0 %	20 %	40 %	40 %	92112305
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261	NC_007963	GAAAT	2	10	376210	376219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_007963	GGGGC	2	10	376452	376461	0 %	0 %	80 %	20 %	92112471
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272	NC_007963	GCCGA	2	10	388210	388219	20 %	0 %	40 %	40 %	92112480
273	NC_007963	CACGG	2	10	394272	394281	20 %	0 %	40 %	40 %	92112485
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387	NC_007963	GCGGT	2	10	569530	569539	0 %	20 %	60 %	20 %	92112644
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395	NC_007963	CTATG	2	10	580226	580235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_007963	ACAGC	2	10	586861	586870	40 %	0 %	20 %	40 %	92112662
402	NC_007963	CGGCG	2	10	587902	587911	0 %	0 %	60 %	40 %	92112662
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