MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 1144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007963	GGCG	2	8	7223	7230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007963	GCAG	2	8	7297	7304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007963	TCGT	2	8	7365	7372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007963	GTAA	2	8	14070	14077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007963	CGTC	2	8	19826	19833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007963	GAAG	2	8	26223	26230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007963	GGTG	2	8	27265	27272	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007963	ATGA	2	8	29986	29993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007963	CACG	2	8	43893	43900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007963	CATC	2	8	43979	43986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007963	AGAT	2	8	44993	45000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007963	GCTC	2	8	45020	45027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007963	AGCG	2	8	45036	45043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007963	AAGA	2	8	50179	50186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007963	GAAA	2	8	50938	50945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007963	ATTG	2	8	51830	51837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007963	GTCG	2	8	53373	53380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007963	GCAC	2	8	54672	54679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007963	CGCC	2	8	56420	56427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_007963	CGAC	2	8	56525	56532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007963	GGGC	2	8	59692	59699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007963	ATCA	2	8	60305	60312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007963	AGGT	2	8	60581	60588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007963	TTAC	2	8	75641	75648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007963	GAGG	2	8	80352	80359	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007963	GATC	2	8	84498	84505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007963	ACGC	2	8	86886	86893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007963	CGGG	2	8	87930	87937	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007963	CGTT	2	8	88835	88842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007963	CGGG	2	8	96969	96976	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007963	GATT	2	8	98110	98117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007963	ACGC	2	8	98132	98139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007963	GGGC	2	8	101916	101923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007963	CTGC	2	8	111173	111180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007963	GGAC	2	8	112157	112164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007963	GTCG	2	8	113848	113855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007963	TCTT	2	8	113878	113885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007963	GTTA	2	8	131160	131167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007963	TCTA	2	8	131937	131944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007963	ACCC	2	8	146509	146516	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007963	TCGA	2	8	151655	151662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007963	GCCC	2	8	152565	152572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_007963	TCCT	2	8	152589	152596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007963	GGAC	2	8	161997	162004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007963	GCCG	2	8	166016	166023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007963	AGGT	2	8	168445	168452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007963	CTTC	2	8	183771	183778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007963	TTCC	2	8	183860	183867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007963	ATTC	2	8	183949	183956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007963	CTCC	2	8	188996	189003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_007963	CGAG	2	8	191088	191095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007963	ATCA	2	8	193334	193341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007963	CTGA	2	8	196915	196922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007963	TCAT	2	8	197238	197245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007963	CGGC	2	8	197717	197724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007963	TGAA	2	8	198333	198340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007963	ATGT	2	8	201767	201774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007963	TGGG	2	8	212839	212846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007963	TGGC	2	8	218071	218078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007963	TGAA	2	8	219881	219888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007963	TTCG	2	8	219928	219935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007963	GGAT	2	8	220583	220590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007963	GCCC	2	8	222015	222022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_007963	GGCG	2	8	222035	222042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007963	ACCG	2	8	222929	222936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007963	TGAA	2	8	231835	231842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007963	GCAA	2	8	243883	243890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007963	AATA	2	8	245689	245696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007963	GCCA	2	8	249491	249498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007963	TTTC	2	8	249805	249812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007963	CGGC	2	8	252017	252024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007963	ATTT	2	8	252266	252273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007963	CGCC	2	8	253272	253279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_007963	CAAT	2	8	253729	253736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007963	GCCC	2	8	265089	265096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_007963	ATGG	2	8	265195	265202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007963	CTGG	2	8	265385	265392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007963	GCAA	2	8	276443	276450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007963	AGGC	2	8	278034	278041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007963	TTCG	2	8	281459	281466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007963	GCCA	2	8	285123	285130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007963	GCCA	2	8	285164	285171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007963	TGGC	2	8	286100	286107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007963	GACG	2	8	288552	288559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007963	GGAC	2	8	290165	290172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007963	TCCA	2	8	290419	290426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007963	TCGC	2	8	297897	297904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007963	GCAG	2	8	300791	300798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007963	GCCG	2	8	301514	301521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007963	GGCG	2	8	302832	302839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007963	GTGC	2	8	303816	303823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007963	GATG	2	8	305459	305466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007963	CATC	2	8	307567	307574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007963	CCGG	2	8	307575	307582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007963	ACGC	2	8	315803	315810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007963	AAGT	2	8	316684	316691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007963	TCGG	2	8	318909	318916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007963	GTCG	2	8	318921	318928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007963	TAAT	2	8	320917	320924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007963	CGAT	2	8	324651	324658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007963	AATT	2	8	325973	325980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007963	AGGG	2	8	326048	326055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007963	TGCT	2	8	326074	326081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007963	TGTT	2	8	330329	330336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007963	TCCC	2	8	333845	333852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_007963	GCAG	2	8	333931	333938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007963	TCCT	2	8	335771	335778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007963	CCGG	2	8	342217	342224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007963	ATTT	2	8	347213	347220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007963	AGAA	2	8	347226	347233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007963	CGCC	2	8	350076	350083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_007963	GGGC	2	8	351102	351109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007963	CTGC	2	8	352689	352696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007963	TGGC	2	8	355510	355517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007963	ACCG	2	8	356177	356184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007963	ATCA	2	8	356413	356420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007963	ATCA	2	8	356502	356509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007963	CGGG	2	8	359044	359051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007963	AGGG	2	8	383331	383338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007963	TTGA	2	8	388609	388616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007963	AACG	2	8	392197	392204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007963	GTGC	2	8	392318	392325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007963	GGCG	2	8	392334	392341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007963	GTCG	2	8	392374	392381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007963	CGAC	2	8	393299	393306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007963	GCAC	2	8	393383	393390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007963	CGGG	2	8	393507	393514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007963	CGGG	2	8	395117	395124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007963	CCCG	2	8	407648	407655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_007963	AAAT	2	8	407863	407870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007963	CACC	2	8	421436	421443	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_007963	GGAG	2	8	428732	428739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007963	TCGG	2	8	430968	430975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007963	CAGC	2	8	431040	431047	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007963	GGCA	2	8	436566	436573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007963	TCGT	2	8	436608	436615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007963	AGGG	2	8	439961	439968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007963	CCAT	2	8	440046	440053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007963	TCGT	2	8	440169	440176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007963	CGGG	2	8	448407	448414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007963	TGAC	2	8	454535	454542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007963	TGGT	2	8	455159	455166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007963	TACC	2	8	455892	455899	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007963	TCGG	2	8	456046	456053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007963	GCCT	2	8	456757	456764	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007963	GGCC	2	8	457292	457299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007963	AAAG	2	8	458058	458065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007963	GTTG	2	8	458424	458431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007963	GACA	2	8	459323	459330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007963	AGCG	2	8	459998	460005	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007963	TTCT	2	8	462721	462728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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474	NC_007963	TCCG	2	8	1484105	1484112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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476	NC_007963	TTCA	2	8	1487369	1487376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
477	NC_007963	TGCA	2	8	1490581	1490588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_007963	GGCA	2	8	1492948	1492955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_007963	CGAA	2	8	1529389	1529396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_007963	CCGG	2	8	1529456	1529463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_007963	TGCG	2	8	1532560	1532567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_007963	GCAT	2	8	1532574	1532581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_007963	GTCG	2	8	1537574	1537581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_007963	CGTG	2	8	1583433	1583440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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