MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	ACCCC	2	10	6585	6594	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_007961	GGTGG	2	10	6759	6768	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007961	CGTCG	2	10	12489	12498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007961	GGCAG	2	10	12589	12598	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007961	TCGTT	2	10	19303	19312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007961	GCGCC	2	10	37144	37153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007961	ACGCC	2	10	43968	43977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_007961	GGAAA	2	10	48344	48353	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007961	GAAGT	2	10	64436	64445	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007961	GACGC	2	10	64751	64760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007961	TGGCT	2	10	66723	66732	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007961	GCGAG	2	10	68247	68256	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007961	CTGCA	2	10	68384	68393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007961	ATGCT	2	10	74087	74096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007961	GCGAT	2	10	77952	77961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007961	AATCG	2	10	78346	78355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007961	ACCTG	2	10	80391	80400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007961	CGCGA	2	10	94826	94835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007961	GGTGA	2	10	97985	97994	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007961	CGCCC	2	10	99110	99119	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_007961	CGATG	2	10	100623	100632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007961	CCGGA	2	10	101783	101792	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007961	CGCTC	2	10	113473	113482	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_007961	AAGGA	2	10	113588	113597	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007961	TTCTC	2	10	114225	114234	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007961	ATGGC	2	10	116485	116494	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.