MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	CGA	2	6	81	86	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007961	TTG	2	6	5872	5877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007961	TCG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007961	ATG	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007961	TTG	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007961	GCC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007961	TTG	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007961	AAC	2	6	6387	6392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007961	GAG	2	6	6411	6416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007961	CCG	2	6	6417	6422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007961	CTT	2	6	6438	6443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007961	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007961	CCG	2	6	6718	6723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007961	GAT	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007961	GCA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007961	GCG	2	6	7066	7071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007961	TCG	2	6	7264	7269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007961	CGG	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007961	GCT	3	9	8171	8179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007961	GAG	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007961	GCG	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007961	GGC	2	6	8291	8296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007961	GGC	2	6	8357	8362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007961	CTG	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007961	TGG	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007961	GCC	2	6	8924	8929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007961	GAC	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007961	CCG	2	6	9963	9968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007961	TCC	2	6	10488	10493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007961	CTT	2	6	11417	11422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007961	AAC	2	6	11433	11438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007961	TTG	2	6	11499	11504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007961	CCT	2	6	11527	11532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007961	CGA	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007961	ATG	2	6	11636	11641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007961	ACT	2	6	12442	12447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007961	CGA	2	6	12531	12536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007961	GCG	2	6	12558	12563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007961	TCT	3	9	12707	12715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007961	TTG	2	6	12739	12744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007961	CGT	2	6	12784	12789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007961	TGT	2	6	12824	12829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007961	ATC	2	6	12842	12847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007961	CTT	2	6	12870	12875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007961	CGG	2	6	12883	12888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007961	ATG	2	6	12896	12901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007961	TGC	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007961	TGA	2	6	14216	14221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007961	TGC	2	6	14819	14824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007961	TCT	2	6	15623	15628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007961	GCC	2	6	15717	15722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007961	GCG	2	6	15776	15781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007961	CGC	2	6	15827	15832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007961	CGG	2	6	15874	15879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007961	CGG	2	6	23889	23894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007961	TCC	2	6	26169	26174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007961	GCG	2	6	26211	26216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007961	GTT	2	6	26376	26381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007961	ATC	2	6	26427	26432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007961	CGT	2	6	26457	26462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007961	CGG	2	6	28866	28871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007961	CAG	2	6	30436	30441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007961	CGG	2	6	32961	32966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007961	GGC	2	6	32991	32996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007961	GTA	2	6	33145	33150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007961	CGA	2	6	35799	35804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007961	CGG	2	6	37017	37022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007961	GCG	2	6	37113	37118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007961	GAC	2	6	38851	38856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007961	CGG	2	6	38909	38914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007961	AAT	2	6	39013	39018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007961	GCG	2	6	39052	39057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007961	CGT	2	6	39096	39101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007961	GCC	2	6	39154	39159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007961	GCC	2	6	39221	39226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007961	GGC	2	6	39243	39248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007961	GCC	2	6	39259	39264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007961	TCG	2	6	39280	39285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007961	TGC	2	6	39370	39375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007961	CGC	2	6	39439	39444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007961	GAG	2	6	39554	39559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007961	GAG	2	6	39569	39574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007961	GTC	2	6	39587	39592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007961	CAT	2	6	39599	39604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007961	CGC	3	9	39673	39681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007961	GCC	2	6	39753	39758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007961	GCT	2	6	39781	39786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007961	CCG	2	6	39816	39821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007961	TAT	2	6	40030	40035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007961	AGG	2	6	40040	40045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007961	ATT	2	6	40847	40852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007961	TGG	2	6	40854	40859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007961	GCC	2	6	40870	40875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007961	CGC	2	6	40899	40904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007961	GAA	2	6	41021	41026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007961	CCA	2	6	43080	43085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007961	GCC	2	6	43098	43103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007961	GTG	2	6	43116	43121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007961	CGC	2	6	43182	43187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007961	TCG	2	6	43209	43214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007961	GCT	2	6	43333	43338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007961	GAG	2	6	43382	43387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007961	CGG	2	6	43498	43503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007961	GCA	2	6	43511	43516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007961	CGG	2	6	43670	43675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007961	GTG	2	6	43901	43906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007961	GCG	2	6	43919	43924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007961	GAT	2	6	43988	43993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007961	CTG	2	6	44215	44220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007961	CGA	2	6	44236	44241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007961	ATC	2	6	44247	44252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007961	GAT	2	6	44447	44452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007961	GTC	2	6	44462	44467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007961	TCA	2	6	44473	44478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007961	GCT	2	6	44514	44519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007961	TGC	2	6	44571	44576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007961	GCG	2	6	44595	44600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007961	GCC	2	6	44622	44627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007961	GTG	2	6	44713	44718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007961	AAC	2	6	44723	44728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007961	CGA	2	6	44782	44787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007961	GAC	2	6	44795	44800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007961	CGA	2	6	44913	44918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007961	TCG	2	6	44940	44945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007961	CCG	2	6	45108	45113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007961	GTC	2	6	45221	45226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007961	CGC	2	6	45256	45261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007961	GCT	2	6	45304	45309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007961	CCG	2	6	45326	45331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007961	GTC	2	6	45385	45390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007961	GAG	2	6	45431	45436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007961	GAC	2	6	45613	45618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007961	GCG	3	9	45757	45765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007961	TCG	2	6	46631	46636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007961	ACG	2	6	46647	46652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007961	CTC	2	6	48010	48015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007961	CCG	2	6	48162	48167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007961	TCC	2	6	48205	48210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007961	AAG	2	6	48279	48284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007961	TAT	2	6	48364	48369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_007961	GAA	2	6	115675	115680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_007961	TGG	2	6	116368	116373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.