MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 2

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007960	GATC	2	8	16	23	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007960	GTCC	2	8	872	879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007960	ATGC	2	8	1566	1573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007960	GTCC	2	8	7479	7486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007960	GCGA	2	8	13643	13650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007960	GACG	2	8	13720	13727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007960	CTTC	2	8	16818	16825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007960	AACT	2	8	24670	24677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007960	TCGC	2	8	25239	25246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007960	TTAA	2	8	25278	25285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007960	GCAC	2	8	25403	25410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007960	CGGG	2	8	25578	25585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007960	GACC	2	8	30168	30175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007960	CGGT	2	8	30191	30198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007960	AGCG	2	8	30361	30368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007960	CGAC	2	8	32037	32044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007960	ACCA	2	8	38673	38680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007960	TTCA	2	8	38689	38696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007960	TGAA	2	8	39728	39735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007960	CATC	2	8	39774	39781	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007960	TTCG	2	8	40279	40286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007960	GCCG	2	8	40927	40934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007960	GATC	2	8	41121	41128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007960	GTCA	2	8	41897	41904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007960	GTTT	2	8	41931	41938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007960	CTGG	2	8	42546	42553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007960	TCCT	2	8	46444	46451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007960	ACGG	2	8	46458	46465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007960	AGCC	2	8	49499	49506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007960	GACG	2	8	50204	50211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007960	GACG	2	8	50514	50521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007960	TGCC	2	8	50698	50705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007960	ATCG	2	8	56298	56305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007960	AGCG	2	8	56696	56703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007960	CACG	2	8	56843	56850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007960	GGGC	2	8	58988	58995	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007960	CGAT	2	8	59018	59025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007960	ATCA	2	8	62664	62671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007960	AACC	2	8	62678	62685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007960	AGCC	2	8	65529	65536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007960	CAGG	2	8	71787	71794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007960	GAAT	2	8	81985	81992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007960	CTGT	2	8	82013	82020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007960	GGCT	2	8	95409	95416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007960	TCGG	2	8	100441	100448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007960	CAGG	2	8	107174	107181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007960	TCGT	2	8	107409	107416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007960	CGGG	2	8	112814	112821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007960	TGCG	2	8	113617	113624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007960	CGGT	2	8	114868	114875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007960	TCGC	2	8	117427	117434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007960	ACCG	2	8	123552	123559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007960	CCGC	2	8	123652	123659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_007960	AGCG	2	8	127823	127830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007960	CGGG	2	8	132893	132900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007960	TAAC	2	8	133122	133129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007960	CGCC	2	8	140974	140981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_007960	CGGG	2	8	141932	141939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007960	CAAA	2	8	148029	148036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007960	GAAA	2	8	148197	148204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007960	CAGC	2	8	152579	152586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007960	AGGA	2	8	160402	160409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007960	CCGG	2	8	167867	167874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007960	CGAG	2	8	168397	168404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007960	GACG	2	8	169253	169260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007960	GCGG	2	8	173177	173184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007960	GCGG	2	8	173195	173202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007960	TGGT	2	8	175991	175998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007960	TTCT	2	8	176011	176018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007960	GCGG	2	8	182536	182543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007960	TTGC	2	8	182590	182597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007960	AGGG	3	12	185338	185349	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007960	TCGG	2	8	186923	186930	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007960	TTTC	2	8	187034	187041	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007960	CAGA	2	8	187162	187169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007960	GACC	2	8	187194	187201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.