MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 2

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007960	TTGC	2	8	1186	1193	0 %	50 %	25 %	25 %	92109492
2	NC_007960	CCGC	2	8	1476	1483	0 %	0 %	25 %	75 %	92109492
3	NC_007960	CAGG	2	8	1741	1748	25 %	0 %	50 %	25 %	92109493
4	NC_007960	GGCC	2	8	1932	1939	0 %	0 %	50 %	50 %	92109493
5	NC_007960	GTCG	2	8	2306	2313	0 %	25 %	50 %	25 %	92109494
6	NC_007960	GGTC	2	8	2446	2453	0 %	25 %	50 %	25 %	92109494
7	NC_007960	ATCG	2	8	2834	2841	25 %	25 %	25 %	25 %	92109494
8	NC_007960	CGGG	2	8	3032	3039	0 %	0 %	75 %	25 %	92109494
9	NC_007960	ATGT	2	8	3147	3154	25 %	50 %	25 %	0 %	92109494
10	NC_007960	CGCC	2	8	3439	3446	0 %	0 %	25 %	75 %	92109495
11	NC_007960	GCCG	2	8	3796	3803	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
12	NC_007960	GGTC	2	8	4735	4742	0 %	25 %	50 %	25 %	92109495
13	NC_007960	CAAT	2	8	5741	5748	50 %	25 %	0 %	25 %	92109495
14	NC_007960	GTCG	2	8	6166	6173	0 %	25 %	50 %	25 %	92109495
15	NC_007960	GGCC	2	8	6382	6389	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
16	NC_007960	GCCG	2	8	6604	6611	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
17	NC_007960	CAAG	2	8	7342	7349	50 %	0 %	25 %	25 %	92109496
18	NC_007960	GCAC	2	8	7950	7957	25 %	0 %	25 %	50 %	92109497
19	NC_007960	CATC	2	8	8089	8096	25 %	25 %	0 %	50 %	92109497
20	NC_007960	ATCA	2	8	8700	8707	50 %	25 %	0 %	25 %	92109498
21	NC_007960	AGGT	2	8	9036	9043	25 %	25 %	50 %	0 %	92109499
22	NC_007960	CAGC	2	8	9092	9099	25 %	0 %	25 %	50 %	92109499
23	NC_007960	TGGA	2	8	9176	9183	25 %	25 %	50 %	0 %	92109499
24	NC_007960	GTTT	2	8	9454	9461	0 %	75 %	25 %	0 %	92109499
25	NC_007960	CCAG	2	8	9854	9861	25 %	0 %	25 %	50 %	92109500
26	NC_007960	GCCG	2	8	9918	9925	0 %	0 %	50 %	50 %	92109500
27	NC_007960	TTCA	2	8	10102	10109	25 %	50 %	0 %	25 %	92109500
28	NC_007960	TGGT	2	8	10780	10787	0 %	50 %	50 %	0 %	92109500
29	NC_007960	GATA	2	8	11526	11533	50 %	25 %	25 %	0 %	92109500
30	NC_007960	AGGC	2	8	11564	11571	25 %	0 %	50 %	25 %	92109500
31	NC_007960	ATCG	2	8	12857	12864	25 %	25 %	25 %	25 %	92109501
32	NC_007960	GCAA	2	8	13081	13088	50 %	0 %	25 %	25 %	92109501
33	NC_007960	CTGA	2	8	14073	14080	25 %	25 %	25 %	25 %	92109502
34	NC_007960	GCCT	2	8	14106	14113	0 %	25 %	25 %	50 %	92109502
35	NC_007960	GGGC	2	8	14233	14240	0 %	0 %	75 %	25 %	92109502
36	NC_007960	TGGT	2	8	14682	14689	0 %	50 %	50 %	0 %	92109503
37	NC_007960	ACCA	2	8	14712	14719	50 %	0 %	0 %	50 %	92109503
38	NC_007960	GCAG	2	8	15085	15092	25 %	0 %	50 %	25 %	92109503
39	NC_007960	GCTC	2	8	15412	15419	0 %	25 %	25 %	50 %	92109503
40	NC_007960	CAGC	2	8	15757	15764	25 %	0 %	25 %	50 %	92109503
41	NC_007960	TTTG	2	8	16015	16022	0 %	75 %	25 %	0 %	92109503
42	NC_007960	CCCA	2	8	16105	16112	25 %	0 %	0 %	75 %	92109503
43	NC_007960	GTCG	2	8	16217	16224	0 %	25 %	50 %	25 %	92109503
44	NC_007960	CGGC	2	8	16528	16535	0 %	0 %	50 %	50 %	92109503
45	NC_007960	CGAT	2	8	17150	17157	25 %	25 %	25 %	25 %	92109504
46	NC_007960	CGAA	2	8	17233	17240	50 %	0 %	25 %	25 %	92109504
47	NC_007960	TGGG	2	8	17379	17386	0 %	25 %	75 %	0 %	92109504
48	NC_007960	GTGA	2	8	19091	19098	25 %	25 %	50 %	0 %	92109506
49	NC_007960	TCAC	2	8	19301	19308	25 %	25 %	0 %	50 %	92109506
50	NC_007960	TACA	2	8	19699	19706	50 %	25 %	0 %	25 %	92109506
51	NC_007960	CACG	2	8	19941	19948	25 %	0 %	25 %	50 %	92109506
52	NC_007960	CTCG	2	8	20830	20837	0 %	25 %	25 %	50 %	92109506
53	NC_007960	CGTC	2	8	20900	20907	0 %	25 %	25 %	50 %	92109506
54	NC_007960	ATGC	2	8	20977	20984	25 %	25 %	25 %	25 %	92109506
55	NC_007960	AGGT	2	8	21245	21252	25 %	25 %	50 %	0 %	92109506
56	NC_007960	CCGG	2	8	21508	21515	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
57	NC_007960	GTCC	2	8	21646	21653	0 %	25 %	25 %	50 %	92109506
58	NC_007960	AGGA	2	8	21920	21927	50 %	0 %	50 %	0 %	92109506
59	NC_007960	ATGC	2	8	22062	22069	25 %	25 %	25 %	25 %	92109506
60	NC_007960	CGCC	2	8	24109	24116	0 %	0 %	25 %	75 %	92109508
61	NC_007960	GTCT	2	8	25802	25809	0 %	50 %	25 %	25 %	92109510
62	NC_007960	TCGT	2	8	26680	26687	0 %	50 %	25 %	25 %	92109511
63	NC_007960	GGCT	2	8	26763	26770	0 %	25 %	50 %	25 %	92109511
64	NC_007960	ACTG	2	8	27017	27024	25 %	25 %	25 %	25 %	92109512
65	NC_007960	TCGC	2	8	27034	27041	0 %	25 %	25 %	50 %	92109512
66	NC_007960	GCGG	2	8	27309	27316	0 %	0 %	75 %	25 %	92109512
67	NC_007960	AGGA	2	8	27878	27885	50 %	0 %	50 %	0 %	92109513
68	NC_007960	GAAC	2	8	28130	28137	50 %	0 %	25 %	25 %	92109513
69	NC_007960	GGCC	2	8	28482	28489	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
70	NC_007960	GATG	2	8	28884	28891	25 %	25 %	50 %	0 %	92109513
71	NC_007960	GGCC	2	8	29154	29161	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
72	NC_007960	GAGC	2	8	29522	29529	25 %	0 %	50 %	25 %	92109513
73	NC_007960	CGGC	2	8	29877	29884	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
74	NC_007960	CGTC	2	8	30585	30592	0 %	25 %	25 %	50 %	92109514
75	NC_007960	CGGC	2	8	31085	31092	0 %	0 %	50 %	50 %	92109514
76	NC_007960	CGGG	2	8	31206	31213	0 %	0 %	75 %	25 %	92109514
77	NC_007960	GATC	2	8	31372	31379	25 %	25 %	25 %	25 %	92109515
78	NC_007960	GCCG	2	8	32164	32171	0 %	0 %	50 %	50 %	92109516
79	NC_007960	GCTT	2	8	32424	32431	0 %	50 %	25 %	25 %	92109516
80	NC_007960	GCTG	2	8	32887	32894	0 %	25 %	50 %	25 %	92109516
81	NC_007960	GACC	2	8	33174	33181	25 %	0 %	25 %	50 %	92109516
82	NC_007960	GATT	2	8	33365	33372	25 %	50 %	25 %	0 %	92109516
83	NC_007960	GACG	2	8	33501	33508	25 %	0 %	50 %	25 %	92109516
84	NC_007960	GCCC	2	8	33960	33967	0 %	0 %	25 %	75 %	92109516
85	NC_007960	TGCT	2	8	34283	34290	0 %	50 %	25 %	25 %	92109516
86	NC_007960	TCCG	2	8	35696	35703	0 %	25 %	25 %	50 %	92109519
87	NC_007960	ATCG	2	8	36754	36761	25 %	25 %	25 %	25 %	92109520
88	NC_007960	GCCA	2	8	36970	36977	25 %	0 %	25 %	50 %	92109520
89	NC_007960	GGCG	2	8	37218	37225	0 %	0 %	75 %	25 %	92109520
90	NC_007960	GGAA	2	8	37462	37469	50 %	0 %	50 %	0 %	92109521
91	NC_007960	CGTG	2	8	37493	37500	0 %	25 %	50 %	25 %	92109521
92	NC_007960	ACGG	2	8	38079	38086	25 %	0 %	50 %	25 %	92109521
93	NC_007960	GGGT	2	8	38088	38095	0 %	25 %	75 %	0 %	92109521
94	NC_007960	TGGG	2	8	38416	38423	0 %	25 %	75 %	0 %	92109521
95	NC_007960	TTGG	2	8	39078	39085	0 %	50 %	50 %	0 %	92109522
96	NC_007960	CCGG	2	8	39353	39360	0 %	0 %	50 %	50 %	92109522
97	NC_007960	CACG	2	8	39611	39618	25 %	0 %	25 %	50 %	92109522
98	NC_007960	GAAG	2	8	39653	39660	50 %	0 %	50 %	0 %	92109522
99	NC_007960	GCAG	2	8	40525	40532	25 %	0 %	50 %	25 %	92109523
100	NC_007960	TTGA	2	8	42610	42617	25 %	50 %	25 %	0 %	92109524
101	NC_007960	GCAT	2	8	42687	42694	25 %	25 %	25 %	25 %	92109524
102	NC_007960	TGGT	2	8	42935	42942	0 %	50 %	50 %	0 %	92109524
103	NC_007960	AGTC	2	8	44361	44368	25 %	25 %	25 %	25 %	92109526
104	NC_007960	TGAT	2	8	44638	44645	25 %	50 %	25 %	0 %	92109526
105	NC_007960	CGGC	2	8	44926	44933	0 %	0 %	50 %	50 %	92109526
106	NC_007960	AGCG	2	8	45277	45284	25 %	0 %	50 %	25 %	92109526
107	NC_007960	GTCG	2	8	45341	45348	0 %	25 %	50 %	25 %	92109526
108	NC_007960	GCGA	2	8	45444	45451	25 %	0 %	50 %	25 %	92109526
109	NC_007960	TCGA	2	8	45463	45470	25 %	25 %	25 %	25 %	92109526
110	NC_007960	CGCC	2	8	45853	45860	0 %	0 %	25 %	75 %	92109527
111	NC_007960	ATGC	2	8	47395	47402	25 %	25 %	25 %	25 %	92109528
112	NC_007960	GGCG	2	8	47940	47947	0 %	0 %	75 %	25 %	92109528
113	NC_007960	AGGT	2	8	49840	49847	25 %	25 %	50 %	0 %	92109531
114	NC_007960	GCGT	2	8	50706	50713	0 %	25 %	50 %	25 %	92109532
115	NC_007960	TGGC	2	8	50841	50848	0 %	25 %	50 %	25 %	92109532
116	NC_007960	CGCC	2	8	51665	51672	0 %	0 %	25 %	75 %	92109533
117	NC_007960	GGCG	2	8	52808	52815	0 %	0 %	75 %	25 %	92109533
118	NC_007960	CAAC	2	8	52838	52845	50 %	0 %	0 %	50 %	92109533
119	NC_007960	CGGT	2	8	52893	52900	0 %	25 %	50 %	25 %	92109533
120	NC_007960	CCGC	2	8	52950	52957	0 %	0 %	25 %	75 %	92109533
121	NC_007960	TCCT	2	8	53058	53065	0 %	50 %	0 %	50 %	92109533
122	NC_007960	CTCG	2	8	53139	53146	0 %	25 %	25 %	50 %	92109533
123	NC_007960	GACC	2	8	53970	53977	25 %	0 %	25 %	50 %	92109533
124	NC_007960	GGCG	2	8	54428	54435	0 %	0 %	75 %	25 %	92109533
125	NC_007960	CGTG	2	8	54574	54581	0 %	25 %	50 %	25 %	92109534
126	NC_007960	ATCA	2	8	54653	54660	50 %	25 %	0 %	25 %	92109534
127	NC_007960	GGCA	2	8	55082	55089	25 %	0 %	50 %	25 %	92109534
128	NC_007960	GGCT	2	8	55147	55154	0 %	25 %	50 %	25 %	92109534
129	NC_007960	CAAT	2	8	56564	56571	50 %	25 %	0 %	25 %	92109535
130	NC_007960	CGAC	2	8	57397	57404	25 %	0 %	25 %	50 %	92109536
131	NC_007960	CCAA	2	8	57510	57517	50 %	0 %	0 %	50 %	92109536
132	NC_007960	CAAT	2	8	57624	57631	50 %	25 %	0 %	25 %	92109537
133	NC_007960	CGAC	2	8	58447	58454	25 %	0 %	25 %	50 %	92109538
134	NC_007960	TCCG	2	8	58546	58553	0 %	25 %	25 %	50 %	92109538
135	NC_007960	ATTC	2	8	58657	58664	25 %	50 %	0 %	25 %	92109538
136	NC_007960	CGCT	2	8	60188	60195	0 %	25 %	25 %	50 %	92109539
137	NC_007960	CCAT	2	8	60787	60794	25 %	25 %	0 %	50 %	92109540
138	NC_007960	AACT	2	8	61173	61180	50 %	25 %	0 %	25 %	92109541
139	NC_007960	CGGG	2	8	61261	61268	0 %	0 %	75 %	25 %	92109541
140	NC_007960	ATTG	2	8	61314	61321	25 %	50 %	25 %	0 %	92109541
141	NC_007960	CGAG	2	8	61799	61806	25 %	0 %	50 %	25 %	92109542
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143	NC_007960	GGTC	2	8	63239	63246	0 %	25 %	50 %	25 %	92109544
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.