MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 1

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007959	ACGAT	2	10	3690	3699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007959	GCAAG	2	10	11345	11354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007959	AATCG	2	10	16800	16809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007959	GCTCC	2	10	18038	18047	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007959	AGCGC	2	10	23779	23788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007959	CCTGG	2	10	24162	24171	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007959	AGTGC	2	10	28003	28012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007959	CCATC	2	10	31442	31451	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_007959	TCCGA	2	10	31712	31721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007959	TCCGG	2	10	32722	32731	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007959	AGCGA	2	10	32747	32756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007959	ACGCT	2	10	33735	33744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007959	CGTGA	2	10	47107	47116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007959	GCTTC	2	10	47369	47378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007959	GGGAT	2	10	48830	48839	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007959	AAGGG	2	10	51128	51137	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007959	CCCCG	2	10	52060	52069	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_007959	AGGAA	2	10	56169	56178	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007959	AGGCG	2	10	56710	56719	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007959	ACGTG	2	10	58430	58439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007959	AACCC	2	10	60136	60145	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007959	CCAGC	2	10	61414	61423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007959	ATCAT	2	10	63063	63072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007959	GATCG	2	10	63886	63895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007959	AGCGC	2	10	65562	65571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007959	CTCCA	2	10	66175	66184	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_007959	TGTAA	2	10	69696	69705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007959	TCGCG	2	10	74150	74159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007959	CAGAC	2	10	77081	77090	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007959	GCCGC	2	10	77268	77277	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_007959	TGCGA	2	10	81497	81506	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007959	GGCAC	2	10	84001	84010	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007959	GCCGC	2	10	84176	84185	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_007959	TGTCG	2	10	89834	89843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007959	TGGTT	2	10	93088	93097	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007959	ACCGA	2	10	99637	99646	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007959	ACGAC	2	10	99845	99854	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007959	GGCTA	2	10	103734	103743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007959	CCTGC	2	10	107500	107509	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_007959	CCATG	2	10	112605	112614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007959	TGCCG	2	10	114923	114932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007959	GGCCA	2	10	115002	115011	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007959	CGCGC	2	10	115151	115160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_007959	AGGCA	2	10	116898	116907	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007959	GAACC	2	10	119887	119896	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_007959	CCGAG	2	10	120410	120419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007959	TGCGA	2	10	120910	120919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007959	TGTCG	2	10	122856	122865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007959	CATCG	2	10	129797	129806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007959	GAAGC	2	10	130178	130187	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007959	ATCTA	2	10	155962	155971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007959	AGCAG	2	10	161197	161206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007959	GAACC	2	10	164487	164496	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007959	TCGCC	2	10	165869	165878	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_007959	TATCC	2	10	166130	166139	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007959	TTCGA	2	10	170257	170266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007959	GCTCA	2	10	179175	179184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007959	TGCCG	2	10	183745	183754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007959	GATCG	2	10	190489	190498	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007959	ACCTG	2	10	202077	202086	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007959	ATTTG	2	10	203055	203064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007959	CGGCC	2	10	204955	204964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007959	CCGCG	2	10	205277	205286	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_007959	TTTTC	2	10	205690	205699	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007959	CTTTC	2	10	205725	205734	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007959	CCTCG	2	10	206435	206444	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007959	GGGTT	2	10	206608	206617	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007959	GCCAT	2	10	207173	207182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007959	GCACC	2	10	207903	207912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_007959	GGGAT	2	10	209785	209794	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007959	CTTTT	2	10	213820	213829	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007959	AACTA	2	10	216586	216595	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007959	ACGCA	2	10	221472	221481	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007959	GAGCC	2	10	226120	226129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007959	CGGGG	2	10	238096	238105	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007959	GGAGG	2	10	238119	238128	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007959	CCTGT	2	10	238530	238539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007959	GTAGG	2	10	238913	238922	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007959	TGTCG	2	10	242676	242685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007959	TAGCC	2	10	245783	245792	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007959	GCTTG	2	10	247114	247123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007959	CTCGT	2	10	247243	247252	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007959	ACAGA	2	10	248541	248550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007959	ACCCC	2	10	253063	253072	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
85	NC_007959	GGTGG	2	10	253416	253425	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007959	CCGGA	2	10	257153	257162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007959	CGACA	2	10	259983	259992	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_007959	CAAAT	2	10	263169	263178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007959	GCGGG	2	10	269185	269194	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007959	CAAAT	2	10	270097	270106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007959	CGCGG	2	10	279109	279118	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007959	CGCGG	2	10	284933	284942	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007959	CGCGA	2	10	286284	286293	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007959	GGAAA	2	10	287206	287215	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007959	AAGAT	2	10	291713	291722	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007959	GCCGA	2	10	291976	291985	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007959	CGGAG	2	10	293167	293176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.