MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 1

Total Repeats: 317

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007959	CGAG	2	8	1655	1662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007959	GGCT	2	8	2106	2113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007959	AATC	2	8	2120	2127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007959	GTCA	2	8	2241	2248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007959	GGGA	2	8	6105	6112	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007959	ATCC	2	8	9201	9208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007959	ACCG	2	8	9295	9302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007959	CAGT	2	8	10661	10668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007959	CACG	2	8	10939	10946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007959	AATG	2	8	11393	11400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007959	TCGA	2	8	11500	11507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007959	GTGG	2	8	11745	11752	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007959	CCGA	2	8	12440	12447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007959	ACTG	2	8	16913	16920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007959	CCGG	2	8	17385	17392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007959	GTCG	2	8	18095	18102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007959	CCAC	2	8	18106	18113	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_007959	GACT	2	8	18597	18604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007959	TTCG	2	8	18632	18639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007959	ACAA	2	8	22127	22134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007959	GAAT	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007959	GCCT	2	8	24130	24137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007959	CGAG	2	8	24385	24392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007959	CGTC	2	8	25424	25431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007959	GCCT	2	8	25501	25508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007959	GTTT	2	8	25767	25774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007959	CGAT	2	8	25899	25906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007959	GACG	2	8	27028	27035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007959	AGGG	2	8	27969	27976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007959	GATT	2	8	28847	28854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007959	CTAT	2	8	28919	28926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007959	CGGA	2	8	30374	30381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007959	CTCG	2	8	30427	30434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007959	CCGC	2	8	30814	30821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_007959	GGCG	2	8	31068	31075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007959	CGCC	2	8	31515	31522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_007959	GATG	2	8	31549	31556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007959	AACG	2	8	31960	31967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007959	TTCG	2	8	32038	32045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007959	CGCC	2	8	32327	32334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_007959	CAAC	2	8	33112	33119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007959	GAGG	2	8	33312	33319	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007959	TAGA	2	8	33509	33516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007959	CATG	2	8	33526	33533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007959	GCCG	2	8	33934	33941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007959	CTGG	2	8	36426	36433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007959	CGGT	2	8	36446	36453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007959	GTTG	2	8	36584	36591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007959	ATGC	2	8	37584	37591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007959	GGCT	2	8	38343	38350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007959	CAAA	2	8	38568	38575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007959	TCTA	2	8	44116	44123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007959	CGTT	2	8	46541	46548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007959	GACT	2	8	46557	46564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007959	TTGT	2	8	46663	46670	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007959	CGAT	2	8	47046	47053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007959	GGTT	2	8	47424	47431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007959	GGCC	2	8	47596	47603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007959	GGCG	2	8	47621	47628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007959	CATC	2	8	48387	48394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007959	ACGC	2	8	48649	48656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007959	CCAA	2	8	48708	48715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007959	TGGG	2	8	52854	52861	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007959	GGCC	2	8	56408	56415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007959	TCGG	2	8	56727	56734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007959	GAAG	2	8	57168	57175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007959	GGCG	2	8	57918	57925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007959	TCGC	2	8	58019	58026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007959	TCAA	2	8	58195	58202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007959	CGTG	2	8	58595	58602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007959	GGCC	2	8	59330	59337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007959	CCGG	2	8	59402	59409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007959	TACG	2	8	59499	59506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007959	CGGG	2	8	59749	59756	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007959	ACGA	2	8	60237	60244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007959	CTTT	2	8	60674	60681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007959	GTCG	2	8	62429	62436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007959	CGTT	2	8	62894	62901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007959	CGCT	2	8	63759	63766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007959	CGCT	2	8	63862	63869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007959	CCAG	2	8	64036	64043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007959	TGTT	2	8	65292	65299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007959	GTAT	2	8	65328	65335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007959	TGAG	2	8	69937	69944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007959	GACA	2	8	71522	71529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007959	TCCG	2	8	71544	71551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007959	CGCC	2	8	74949	74956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_007959	CGAG	2	8	74984	74991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007959	TCAC	2	8	77187	77194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007959	CGAG	2	8	79208	79215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007959	GCAG	2	8	79423	79430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007959	CGGA	2	8	79473	79480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007959	CGAG	2	8	79695	79702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007959	CTCG	2	8	79862	79869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007959	ATTG	2	8	81470	81477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007959	CCGC	2	8	81809	81816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_007959	CTAC	2	8	82820	82827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007959	ATGG	2	8	83845	83852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007959	AGGT	2	8	83881	83888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007959	CAAT	2	8	84293	84300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007959	GCAC	2	8	84836	84843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007959	AGGA	2	8	84965	84972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007959	CAGG	2	8	89278	89285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007959	ATGG	2	8	89325	89332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007959	GAAA	2	8	91197	91204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007959	GCAT	2	8	91681	91688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007959	CGGC	2	8	91793	91800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007959	GTAG	2	8	91871	91878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007959	CGAC	2	8	91996	92003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007959	TCAG	2	8	92173	92180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007959	TCAA	2	8	92301	92308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007959	CCAA	2	8	92606	92613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007959	CGAT	2	8	93385	93392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007959	TCAG	2	8	93582	93589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007959	CTAT	2	8	93633	93640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007959	TCAA	2	8	93709	93716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007959	GCCC	2	8	95305	95312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_007959	ATCC	2	8	95487	95494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007959	GAAG	2	8	95817	95824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007959	GCCA	2	8	96328	96335	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007959	CTCC	2	8	97753	97760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_007959	GGAA	2	8	97773	97780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007959	TCGG	2	8	100197	100204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007959	GAAG	2	8	100311	100318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007959	AAGC	2	8	100994	101001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007959	CAGT	2	8	103810	103817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007959	GTCC	3	12	105505	105516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007959	CAAG	2	8	106033	106040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007959	AGCT	2	8	107633	107640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007959	GAAT	2	8	107983	107990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007959	GCCG	2	8	108462	108469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007959	TGGA	2	8	108792	108799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007959	GGGC	2	8	108835	108842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007959	TCAT	2	8	109006	109013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007959	AAGT	2	8	109911	109918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007959	CCCG	2	8	110259	110266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_007959	CCCA	2	8	110272	110279	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_007959	GACG	2	8	110498	110505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007959	CCGA	2	8	110986	110993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007959	GGAC	2	8	111149	111156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007959	TGAT	2	8	111203	111210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007959	TCGC	2	8	111278	111285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007959	CCCG	2	8	111708	111715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_007959	CGGG	2	8	111722	111729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007959	CGAT	2	8	111770	111777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007959	ATCG	2	8	112636	112643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007959	TTCG	2	8	112846	112853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007959	GCGG	2	8	113808	113815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007959	GCTC	2	8	114764	114771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007959	TGGC	2	8	115181	115188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007959	CCGC	2	8	115700	115707	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_007959	CGAT	2	8	116470	116477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007959	GCGG	2	8	116517	116524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007959	CCTC	2	8	117305	117312	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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166	NC_007959	GAGC	2	8	124775	124782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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301	NC_007959	GCCG	2	8	260369	260376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
302	NC_007959	AACA	2	8	260637	260644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
303	NC_007959	CCGA	2	8	260707	260714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
304	NC_007959	GCGG	2	8	261707	261714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
305	NC_007959	CGGC	3	12	263212	263223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
306	NC_007959	CGAG	2	8	263279	263286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
307	NC_007959	ATCA	2	8	269464	269471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
308	NC_007959	GTAT	2	8	270006	270013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
309	NC_007959	CGAG	2	8	270198	270205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
310	NC_007959	GCAA	2	8	284324	284331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
311	NC_007959	GGGC	2	8	284737	284744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
312	NC_007959	TCCC	2	8	286261	286268	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
313	NC_007959	CTTG	2	8	291907	291914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
314	NC_007959	CCTT	2	8	292091	292098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
315	NC_007959	AGTC	2	8	292111	292118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
316	NC_007959	GGCC	2	8	292591	292598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
317	NC_007959	CGAC	2	8	293113	293120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.