MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	GTCGGC	2	12	76780	76791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007958	TTGTCG	2	12	76892	76903	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007958	GGTCGA	2	12	81840	81851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007958	CCGGTT	2	12	118615	118626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007958	GGAGGG	2	12	128477	128488	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007958	CCCTCC	2	12	128591	128602	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_007958	CGGCTG	2	12	154483	154494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007958	ACGCGC	2	12	251001	251012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007958	TCCCGC	2	12	253673	253684	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007958	CGCCCG	2	12	254924	254935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007958	TGAGGA	2	12	282138	282149	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007958	GGGCGC	2	12	290143	290154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007958	TGGGCT	2	12	339068	339079	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007958	TGCGCG	2	12	368134	368145	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007958	GGCCGC	2	12	433575	433586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007958	GCGCTC	2	12	518758	518769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007958	TGTTCC	2	12	552100	552111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007958	ACCCCC	2	12	557194	557205	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_007958	GACGCT	2	12	594739	594750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007958	ATAATC	2	12	615762	615773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007958	CGAGCG	2	12	660426	660437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007958	ATTCTC	2	12	672818	672829	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007958	TCGATG	2	12	679827	679838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007958	GGAGGG	2	12	720624	720635	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007958	CCCTCC	2	12	720738	720749	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_007958	TGCCTG	2	12	785013	785024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007958	CGTCCG	2	12	801961	801972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007958	TTCGCT	2	12	855841	855852	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007958	GCACGC	2	12	859563	859574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007958	CACCCC	2	12	876170	876181	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_007958	AGGGGG	2	12	876215	876226	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007958	TTCGCG	2	12	924062	924073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007958	GGGTGA	2	12	930835	930846	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007958	GCGCGG	2	12	958969	958980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007958	TCCTGC	2	12	980564	980575	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007958	CCGCAC	2	12	992652	992663	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_007958	GCGCCC	2	12	1010129	1010140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007958	TGGTTC	2	12	1042713	1042724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007958	GGTGGG	2	12	1055035	1055046	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007958	TCGCCC	2	12	1058446	1058457	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007958	CGATCG	2	12	1059956	1059967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007958	TGCGGC	2	12	1078884	1078895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007958	GTCACA	2	12	1118201	1118212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007958	GCGATC	2	12	1152960	1152971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007958	TTCGGC	2	12	1217452	1217463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007958	GGAGGG	2	12	1233381	1233392	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007958	TCGAAT	2	12	1243670	1243681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007958	CGGCCG	2	12	1280362	1280373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007958	CCCTCC	2	12	1326297	1326308	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_007958	GTCGGC	2	12	1343209	1343220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007958	GCAGCG	2	12	1346312	1346323	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007958	GGAGGG	2	12	1350755	1350766	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007958	CGGCGT	2	12	1358372	1358383	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007958	TCGCGC	2	12	1383642	1383653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007958	TCCAGC	2	12	1401491	1401502	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007958	CAATCG	2	12	1431619	1431630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007958	GTTTTT	2	12	1448713	1448724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007958	TCAGGG	2	12	1462680	1462691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007958	GTCTTA	2	12	1513180	1513191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007958	ATGTCT	2	12	1556820	1556831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007958	CGTTTT	2	12	1584148	1584159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007958	CGTCGC	2	12	1601933	1601944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007958	GGGGCA	2	12	1614210	1614221	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007958	GATTTT	2	12	1702011	1702022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007958	TCGGCG	2	12	1719278	1719289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007958	CAGCGC	2	12	1732719	1732730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007958	GTCGGC	2	12	1799388	1799399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007958	CGGCTC	2	12	1841137	1841148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007958	CAAAAT	2	12	1841287	1841298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007958	GTGCGG	2	12	1851483	1851494	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007958	GACGAG	2	12	1868150	1868161	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007958	TCAACG	2	12	1889793	1889804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007958	GGCGCT	2	12	1890934	1890945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007958	CCGCGC	2	12	1919042	1919053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007958	CGATTT	2	12	1936619	1936630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007958	CCGGCC	2	12	1936984	1936995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007958	GCAACG	2	12	1976812	1976823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007958	CGGACC	2	12	1987257	1987268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007958	CTTTTG	2	12	1996696	1996707	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007958	GAGTTT	2	12	2060572	2060583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007958	GGAGGG	2	12	2115479	2115490	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007958	CCCTCC	2	12	2115727	2115738	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_007958	CGATTG	2	12	2158128	2158139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007958	TGCCGA	2	12	2178155	2178166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007958	CGAACC	2	12	2201508	2201519	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007958	GGAGGG	2	12	2206776	2206787	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007958	CCCTCC	2	12	2206892	2206903	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
88	NC_007958	CGCATC	2	12	2215367	2215378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007958	TGCAAT	2	12	2265904	2265915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007958	CTGTTG	2	12	2267990	2268001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007958	GACAGG	2	12	2317174	2317185	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007958	GGGTTG	2	12	2358123	2358134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007958	ACCCCC	2	12	2358165	2358176	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_007958	AAACGC	2	12	2365195	2365206	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007958	AGCCGA	2	12	2394309	2394320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007958	GAATCC	2	12	2416888	2416899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007958	TCCGAG	2	12	2437438	2437449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007958	CTTTCC	2	12	2449625	2449636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007958	ACGGCG	2	12	2475350	2475361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007958	AATCAA	2	12	2480000	2480011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007958	TGAAGG	2	12	2487004	2487015	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007958	GCGGCC	2	12	2512509	2512520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007958	GTGGAG	2	12	2519875	2519886	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007958	AAAATA	2	12	2535392	2535403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007958	CACTCT	2	12	2546789	2546800	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007958	GACCGA	2	12	2546840	2546851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007958	GACGGA	2	12	2547468	2547479	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007958	CAGTTT	2	12	2565475	2565486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007958	GCGCCT	2	12	2587484	2587495	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007958	TCAGGT	2	12	2626343	2626354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007958	GCCGGG	2	12	2635271	2635282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007958	GCTTCG	2	12	2658233	2658244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007958	GCGGGT	2	12	2668014	2668025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007958	GATTTG	2	12	2741908	2741919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007958	CGAAAC	2	12	2760646	2760657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007958	ATCAGC	2	12	2767312	2767323	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007958	TCTACC	2	12	2817994	2818005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007958	CGCACC	2	12	2829140	2829151	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007958	CGCCGA	2	12	3020921	3020932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007958	CGGGCG	2	12	3048838	3048849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007958	CCACCG	2	12	3057001	3057012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007958	ATGCCG	2	12	3103257	3103268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007958	CGCCAG	2	12	3137199	3137210	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007958	CTCGAA	2	12	3156063	3156074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007958	CGTCGA	2	12	3156683	3156694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007958	TTTCAT	2	12	3176681	3176692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007958	AGCTCC	2	12	3197263	3197274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007958	GACGCC	2	12	3232460	3232471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007958	TTCCGG	2	12	3232597	3232608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007958	GGATTG	2	12	3256231	3256242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007958	GAGCAA	2	12	3269650	3269661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007958	GGCATT	2	12	3270588	3270599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007958	CGCGTG	2	12	3273879	3273890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007958	GCCCGC	2	12	3364153	3364164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007958	TCGGAA	2	12	3419557	3419568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_007958	GATGTC	2	12	3475356	3475367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007958	CCTACC	2	12	3549548	3549559	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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139	NC_007958	GGCGCC	2	12	3573022	3573033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007958	CGTCCC	2	12	3584805	3584816	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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144	NC_007958	ATATCG	2	12	3620915	3620926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_007958	CACGAC	2	12	3692619	3692630	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007958	GACTCT	2	12	3701605	3701616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007958	CCGCAA	2	12	3720022	3720033	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007958	GCCGTC	2	12	3769576	3769587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007958	TAGAAT	2	12	3828249	3828260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_007958	GGAGGG	2	12	3897426	3897437	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_007958	CTATTG	2	12	3974654	3974665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_007958	CTTCGG	2	12	4001124	4001135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007958	GGTTTG	2	12	4001196	4001207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007958	TTGGTC	2	12	4020564	4020575	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007958	GAGCTT	2	12	4042600	4042611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_007958	ACCGTA	2	12	4075961	4075972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007958	GACATG	2	12	4079167	4079178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.