MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 10893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007958	GAAG	2	8	918	925	50 %	0 %	50 %	0 %	91974483
2	NC_007958	GCCG	2	8	933	940	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
3	NC_007958	CTCG	2	8	1302	1309	0 %	25 %	25 %	50 %	91974483
4	NC_007958	GCCG	2	8	1423	1430	0 %	0 %	50 %	50 %	91974483
5	NC_007958	CGAC	2	8	2465	2472	25 %	0 %	25 %	50 %	91974484
6	NC_007958	TCGC	2	8	2716	2723	0 %	25 %	25 %	50 %	91974484
7	NC_007958	ATCT	2	8	2803	2810	25 %	50 %	0 %	25 %	91974484
8	NC_007958	CGAC	2	8	2855	2862	25 %	0 %	25 %	50 %	91974484
9	NC_007958	GGAC	2	8	4011	4018	25 %	0 %	50 %	25 %	91974485
10	NC_007958	CAGC	2	8	4080	4087	25 %	0 %	25 %	50 %	91974485
11	NC_007958	TGGA	2	8	4315	4322	25 %	25 %	50 %	0 %	91974485
12	NC_007958	CGCC	2	8	4611	4618	0 %	0 %	25 %	75 %	91974485
13	NC_007958	CCCG	2	8	4994	5001	0 %	0 %	25 %	75 %	91974486
14	NC_007958	GGCC	2	8	5185	5192	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
15	NC_007958	TCCG	2	8	6121	6128	0 %	25 %	25 %	50 %	91974486
16	NC_007958	GCCG	2	8	7199	7206	0 %	0 %	50 %	50 %	91974486
17	NC_007958	CGCT	2	8	7292	7299	0 %	25 %	25 %	50 %	91974486
18	NC_007958	GCCG	2	8	7747	7754	0 %	0 %	50 %	50 %	91974487
19	NC_007958	ATCG	2	8	7883	7890	25 %	25 %	25 %	25 %	91974487
20	NC_007958	AGCC	2	8	8287	8294	25 %	0 %	25 %	50 %	91974487
21	NC_007958	GTCG	2	8	9471	9478	0 %	25 %	50 %	25 %	91974490
22	NC_007958	CCGC	2	8	10028	10035	0 %	0 %	25 %	75 %	91974490
23	NC_007958	TGAC	2	8	10132	10139	25 %	25 %	25 %	25 %	91974490
24	NC_007958	CCGT	2	8	10333	10340	0 %	25 %	25 %	50 %	91974490
25	NC_007958	CGGT	2	8	10453	10460	0 %	25 %	50 %	25 %	91974490
26	NC_007958	AACA	2	8	10497	10504	75 %	0 %	0 %	25 %	91974490
27	NC_007958	GAAC	2	8	11200	11207	50 %	0 %	25 %	25 %	91974491
28	NC_007958	GAAG	2	8	12447	12454	50 %	0 %	50 %	0 %	91974493
29	NC_007958	TCGA	2	8	12949	12956	25 %	25 %	25 %	25 %	91974493
30	NC_007958	GTCC	2	8	12984	12991	0 %	25 %	25 %	50 %	91974493
31	NC_007958	CCGC	2	8	13033	13040	0 %	0 %	25 %	75 %	91974494
32	NC_007958	GTCG	2	8	13754	13761	0 %	25 %	50 %	25 %	91974494
33	NC_007958	CGGC	2	8	13872	13879	0 %	0 %	50 %	50 %	91974494
34	NC_007958	AGGC	2	8	14059	14066	25 %	0 %	50 %	25 %	91974494
35	NC_007958	AGGC	2	8	14344	14351	25 %	0 %	50 %	25 %	91974494
36	NC_007958	GTCA	2	8	14387	14394	25 %	25 %	25 %	25 %	91974494
37	NC_007958	GCCT	2	8	16059	16066	0 %	25 %	25 %	50 %	91974495
38	NC_007958	CTTC	2	8	16361	16368	0 %	50 %	0 %	50 %	91974495
39	NC_007958	AGCC	2	8	16565	16572	25 %	0 %	25 %	50 %	91974495
40	NC_007958	CAGA	2	8	16720	16727	50 %	0 %	25 %	25 %	91974495
41	NC_007958	ACCC	2	8	17372	17379	25 %	0 %	0 %	75 %	91974495
42	NC_007958	TGAC	2	8	17401	17408	25 %	25 %	25 %	25 %	91974495
43	NC_007958	CGCT	2	8	17524	17531	0 %	25 %	25 %	50 %	91974495
44	NC_007958	ACCA	2	8	17833	17840	50 %	0 %	0 %	50 %	91974495
45	NC_007958	TTTC	2	8	17975	17982	0 %	75 %	0 %	25 %	91974495
46	NC_007958	CAGA	2	8	18176	18183	50 %	0 %	25 %	25 %	91974495
47	NC_007958	CGAC	2	8	18428	18435	25 %	0 %	25 %	50 %	91974495
48	NC_007958	CGTT	2	8	19116	19123	0 %	50 %	25 %	25 %	91974496
49	NC_007958	TCGA	2	8	19185	19192	25 %	25 %	25 %	25 %	91974496
50	NC_007958	CGCT	2	8	19329	19336	0 %	25 %	25 %	50 %	91974496
51	NC_007958	AAGG	2	8	19483	19490	50 %	0 %	50 %	0 %	91974497
52	NC_007958	TTGG	2	8	20063	20070	0 %	50 %	50 %	0 %	91974497
53	NC_007958	GCGA	2	8	20673	20680	25 %	0 %	50 %	25 %	91974497
54	NC_007958	CTGG	2	8	21235	21242	0 %	25 %	50 %	25 %	91974497
55	NC_007958	CACG	2	8	21357	21364	25 %	0 %	25 %	50 %	91974497
56	NC_007958	GGTC	2	8	21415	21422	0 %	25 %	50 %	25 %	91974497
57	NC_007958	GCTT	2	8	22262	22269	0 %	50 %	25 %	25 %	91974497
58	NC_007958	GACC	2	8	22392	22399	25 %	0 %	25 %	50 %	91974497
59	NC_007958	GGCA	2	8	22461	22468	25 %	0 %	50 %	25 %	91974497
60	NC_007958	GGCC	2	8	22613	22620	0 %	0 %	50 %	50 %	91974498
61	NC_007958	TCGA	2	8	22743	22750	25 %	25 %	25 %	25 %	91974498
62	NC_007958	TGGC	2	8	23149	23156	0 %	25 %	50 %	25 %	91974499
63	NC_007958	AGGC	2	8	23368	23375	25 %	0 %	50 %	25 %	91974499
64	NC_007958	GGTT	2	8	23390	23397	0 %	50 %	50 %	0 %	91974499
65	NC_007958	GCCG	2	8	23849	23856	0 %	0 %	50 %	50 %	91974500
66	NC_007958	GAAT	2	8	24065	24072	50 %	25 %	25 %	0 %	91974500
67	NC_007958	GCCC	2	8	24224	24231	0 %	0 %	25 %	75 %	91974500
68	NC_007958	GTTC	2	8	24780	24787	0 %	50 %	25 %	25 %	91974501
69	NC_007958	CTGC	2	8	25109	25116	0 %	25 %	25 %	50 %	91974501
70	NC_007958	GGCC	2	8	25342	25349	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
71	NC_007958	GCCG	2	8	26126	26133	0 %	0 %	50 %	50 %	91974502
72	NC_007958	CCAA	2	8	26466	26473	50 %	0 %	0 %	50 %	91974502
73	NC_007958	CGAT	2	8	26555	26562	25 %	25 %	25 %	25 %	91974502
74	NC_007958	CTCG	2	8	26717	26724	0 %	25 %	25 %	50 %	91974502
75	NC_007958	ACCT	2	8	27110	27117	25 %	25 %	0 %	50 %	91974502
76	NC_007958	CCGG	2	8	27564	27571	0 %	0 %	50 %	50 %	91974503
77	NC_007958	GTTC	2	8	27807	27814	0 %	50 %	25 %	25 %	91974504
78	NC_007958	CTCG	2	8	27918	27925	0 %	25 %	25 %	50 %	91974504
79	NC_007958	GTGA	2	8	28819	28826	25 %	25 %	50 %	0 %	91974505
80	NC_007958	TGCC	2	8	29089	29096	0 %	25 %	25 %	50 %	91974505
81	NC_007958	GACC	2	8	29472	29479	25 %	0 %	25 %	50 %	91974506
82	NC_007958	GACC	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	91974506
83	NC_007958	CCGG	2	8	30154	30161	0 %	0 %	50 %	50 %	91974507
84	NC_007958	GGCA	2	8	30705	30712	25 %	0 %	50 %	25 %	91974507
85	NC_007958	CGGC	2	8	30946	30953	0 %	0 %	50 %	50 %	91974507
86	NC_007958	TCGC	2	8	31139	31146	0 %	25 %	25 %	50 %	91974507
87	NC_007958	CAGG	2	8	31276	31283	25 %	0 %	50 %	25 %	91974507
88	NC_007958	GATC	2	8	31628	31635	25 %	25 %	25 %	25 %	91974507
89	NC_007958	TGGA	2	8	31740	31747	25 %	25 %	50 %	0 %	91974507
90	NC_007958	ATCC	2	8	32020	32027	25 %	25 %	0 %	50 %	91974507
91	NC_007958	TAGT	2	8	32454	32461	25 %	50 %	25 %	0 %	91974508
92	NC_007958	GCTG	2	8	32644	32651	0 %	25 %	50 %	25 %	91974508
93	NC_007958	GCGG	2	8	33713	33720	0 %	0 %	75 %	25 %	91974509
94	NC_007958	GCGG	2	8	33731	33738	0 %	0 %	75 %	25 %	91974509
95	NC_007958	GCCG	2	8	33825	33832	0 %	0 %	50 %	50 %	91974509
96	NC_007958	GGTC	2	8	34172	34179	0 %	25 %	50 %	25 %	91974509
97	NC_007958	CGGG	2	8	34213	34220	0 %	0 %	75 %	25 %	91974509
98	NC_007958	GATC	2	8	34821	34828	25 %	25 %	25 %	25 %	91974509
99	NC_007958	TGCC	2	8	34850	34857	0 %	25 %	25 %	50 %	91974509
100	NC_007958	CGAT	2	8	34890	34897	25 %	25 %	25 %	25 %	91974509
101	NC_007958	TTCG	2	8	34956	34963	0 %	50 %	25 %	25 %	91974509
102	NC_007958	TCGC	2	8	35177	35184	0 %	25 %	25 %	50 %	91974509
103	NC_007958	CGCC	2	8	35221	35228	0 %	0 %	25 %	75 %	91974509
104	NC_007958	ACGC	2	8	35421	35428	25 %	0 %	25 %	50 %	91974510
105	NC_007958	CGAG	2	8	35692	35699	25 %	0 %	50 %	25 %	91974510
106	NC_007958	CGGC	2	8	36096	36103	0 %	0 %	50 %	50 %	91974510
107	NC_007958	CTGC	2	8	36139	36146	0 %	25 %	25 %	50 %	91974510
108	NC_007958	TCGC	2	8	36174	36181	0 %	25 %	25 %	50 %	91974510
109	NC_007958	GACC	2	8	36329	36336	25 %	0 %	25 %	50 %	91974510
110	NC_007958	GGCC	2	8	36787	36794	0 %	0 %	50 %	50 %	91974510
111	NC_007958	GCAA	2	8	37520	37527	50 %	0 %	25 %	25 %	91974511
112	NC_007958	CGGC	2	8	37722	37729	0 %	0 %	50 %	50 %	91974512
113	NC_007958	CCGG	2	8	37888	37895	0 %	0 %	50 %	50 %	91974512
114	NC_007958	TCGT	2	8	38052	38059	0 %	50 %	25 %	25 %	91974512
115	NC_007958	CGGC	2	8	38612	38619	0 %	0 %	50 %	50 %	91974513
116	NC_007958	CCGG	2	8	38658	38665	0 %	0 %	50 %	50 %	91974513
117	NC_007958	GGAC	2	8	38943	38950	25 %	0 %	50 %	25 %	91974514
118	NC_007958	GTTC	2	8	39164	39171	0 %	50 %	25 %	25 %	91974514
119	NC_007958	CGGA	2	8	39694	39701	25 %	0 %	50 %	25 %	91974515
120	NC_007958	GTCC	2	8	39712	39719	0 %	25 %	25 %	50 %	91974515
121	NC_007958	CCCG	2	8	40269	40276	0 %	0 %	25 %	75 %	91974516
122	NC_007958	CTGG	2	8	40675	40682	0 %	25 %	50 %	25 %	91974517
123	NC_007958	GGCG	2	8	41048	41055	0 %	0 %	75 %	25 %	91974517
124	NC_007958	CGTC	2	8	41282	41289	0 %	25 %	25 %	50 %	91974517
125	NC_007958	GCCT	2	8	41445	41452	0 %	25 %	25 %	50 %	91974517
126	NC_007958	GCAT	2	8	41454	41461	25 %	25 %	25 %	25 %	91974517
127	NC_007958	CGAT	2	8	41496	41503	25 %	25 %	25 %	25 %	91974517
128	NC_007958	GGGC	2	8	41719	41726	0 %	0 %	75 %	25 %	91974517
129	NC_007958	GGCC	2	8	42342	42349	0 %	0 %	50 %	50 %	91974518
130	NC_007958	CGAA	2	8	42377	42384	50 %	0 %	25 %	25 %	91974518
131	NC_007958	CGGG	2	8	42431	42438	0 %	0 %	75 %	25 %	91974518
132	NC_007958	CGGC	2	8	42679	42686	0 %	0 %	50 %	50 %	91974518
133	NC_007958	GGCC	2	8	42831	42838	0 %	0 %	50 %	50 %	91974518
134	NC_007958	CTGG	2	8	42855	42862	0 %	25 %	50 %	25 %	91974518
135	NC_007958	GCCG	2	8	43524	43531	0 %	0 %	50 %	50 %	91974518
136	NC_007958	ACCT	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	91974518
137	NC_007958	CCGA	2	8	44458	44465	25 %	0 %	25 %	50 %	91974518
138	NC_007958	CGGC	2	8	45718	45725	0 %	0 %	50 %	50 %	91974519
139	NC_007958	GGTT	2	8	46588	46595	0 %	50 %	50 %	0 %	91974519
140	NC_007958	GCCG	2	8	46670	46677	0 %	0 %	50 %	50 %	91974519
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142	NC_007958	GCCG	2	8	47676	47683	0 %	0 %	50 %	50 %	91974519
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