MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007955	AGGATT	2	12	78016	78027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007955	ATCTTT	2	12	86896	86907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007955	TATTAA	2	12	87160	87171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007955	ATAAAA	2	12	98504	98515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007955	TCACCT	2	12	110704	110715	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007955	TTGGTG	2	12	130184	130195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007955	CATACT	2	12	130616	130627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007955	TATTAA	2	12	199489	199500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007955	AATGAA	2	12	216758	216769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007955	ACATAT	2	12	232995	233006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007955	ATTTAT	2	12	240364	240375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007955	GAATTT	2	12	250451	250462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007955	ATATTC	2	12	253818	253829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007955	GGAAAA	2	12	268899	268910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007955	TGTTGA	2	12	270204	270215	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007955	ATTTTA	2	12	271537	271548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007955	TTTGAA	2	12	288841	288852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007955	CACAAC	2	12	292327	292338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007955	TTTTTG	2	12	304282	304293	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007955	GTCCAT	2	12	322182	322193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007955	AATATA	2	12	358547	358558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007955	TTTATA	2	12	361820	361831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007955	ACTTTT	2	12	364955	364966	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007955	AATGAA	2	12	369162	369173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007955	TTGTTT	2	12	377251	377262	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007955	GATTAT	2	12	377362	377373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007955	AATTTC	2	12	388285	388296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007955	AGGATT	2	12	391967	391978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007955	TAAAAA	2	12	407177	407188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007955	CTTCAA	2	12	434793	434804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007955	TTATAA	2	12	446920	446931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007955	TAAAAA	2	12	470346	470357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007955	TTGATT	2	12	477027	477038	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007955	TTACAA	2	12	495489	495500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007955	ATGCCA	2	12	511437	511448	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007955	GAATTG	2	12	511726	511737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007955	ATATTT	2	12	512581	512592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007955	ATTTTC	2	12	518581	518592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007955	AATATT	2	12	521803	521814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007955	TTCAAC	2	12	530573	530584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007955	AATTAG	2	12	536227	536238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007955	TAACTT	2	12	542262	542273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007955	AATTTA	2	12	551057	551068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007955	TGATAT	2	12	562414	562425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007955	ATAGTA	2	12	577955	577966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007955	TCAACA	2	12	599218	599229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007955	AATTAT	2	12	649700	649711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007955	ATGAAT	2	12	663529	663540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007955	AATATA	2	12	663787	663798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007955	CATCTG	2	12	701427	701438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007955	AGTATT	2	12	714759	714770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007955	TTTATA	2	12	730960	730971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007955	TTTTAA	2	12	759339	759350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007955	ATACTT	2	12	764952	764963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007955	AGCTTC	2	12	772619	772630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007955	GGTCAA	2	12	774625	774636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007955	CAGAAG	2	12	776276	776287	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007955	AAAATA	2	12	780641	780652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007955	TTCCCC	2	12	780987	780998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007955	TTGATC	2	12	807206	807217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007955	GTTATT	2	12	808000	808011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007955	GCTATT	2	12	812438	812449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007955	TTTAAA	2	12	823545	823556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007955	TAAATA	2	12	831528	831539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007955	TTTTTA	2	12	858973	858984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007955	GAAAAA	2	12	867592	867603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007955	GAAAAA	2	12	869338	869349	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007955	CGTGGG	2	12	869942	869953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007955	AAGTTA	2	12	929610	929621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007955	ATATCT	2	12	934370	934381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007955	TTGATC	2	12	957691	957702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007955	AATTCC	2	12	959505	959516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007955	GAATAT	2	12	960343	960354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007955	TGAGAT	2	12	982870	982881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007955	CCATCA	2	12	1021244	1021255	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007955	TTATAC	2	12	1040542	1040553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007955	AGGATT	2	12	1057616	1057627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007955	AGGATT	2	12	1100471	1100482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007955	TAATTA	2	12	1111689	1111700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007955	AAAAAT	2	12	1111798	1111809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007955	TATATC	2	12	1115799	1115810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007955	TCAACA	2	12	1140116	1140127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007955	ATTGGA	2	12	1176102	1176113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007955	TTCCTC	2	12	1176197	1176208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007955	GATTTT	2	12	1176787	1176798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007955	ATTTTT	2	12	1178968	1178979	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007955	TTTCAT	2	12	1198439	1198450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007955	GTATCA	2	12	1210506	1210517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007955	AAATTG	2	12	1214033	1214044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007955	GAAATA	2	12	1221852	1221863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007955	CACAAT	2	12	1226202	1226213	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007955	AAGAAA	2	12	1240183	1240194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007955	AGTCAA	2	12	1287538	1287549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007955	ATTTTC	2	12	1313220	1313231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007955	GATTTA	2	12	1342349	1342360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007955	AATCCT	2	12	1344171	1344182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007955	AAATAA	2	12	1347515	1347526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007955	TAGAAA	2	12	1353850	1353861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007955	CATATA	2	12	1356732	1356743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007955	AGATAT	2	12	1360317	1360328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007955	GTATAT	2	12	1365389	1365400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007955	GGTTTT	2	12	1373694	1373705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007955	GATAAT	2	12	1386255	1386266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007955	GAACAG	2	12	1404639	1404650	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007955	GCTGAA	2	12	1407026	1407037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007955	TAAAAA	2	12	1416227	1416238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007955	AATTTG	2	12	1432322	1432333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007955	CACCAA	2	12	1455781	1455792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007955	ACCCAT	2	12	1455890	1455901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007955	GTCACC	2	12	1456202	1456213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007955	AATCCT	2	12	1489106	1489117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007955	GGAAGA	2	12	1494613	1494624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007955	ACTAAA	2	12	1512597	1512608	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007955	TTTTCT	2	12	1524499	1524510	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007955	AATTCA	2	12	1525903	1525914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007955	ATTAAG	2	12	1544492	1544503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007955	TCAGCT	2	12	1557464	1557475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007955	CATATA	2	12	1559025	1559036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007955	CATCCT	2	12	1562253	1562264	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007955	GCTGTT	2	12	1569511	1569522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007955	TGATAA	2	12	1604117	1604128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007955	TGCATA	2	12	1617500	1617511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007955	TTTTTA	2	12	1628841	1628852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007955	AGAACA	2	12	1636417	1636428	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007955	TATTTT	2	12	1645996	1646007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007955	TAAAGA	2	12	1653325	1653336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007955	CTTTTT	2	12	1711823	1711834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007955	TTAATA	2	12	1737367	1737378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007955	TTTTTA	2	12	1742718	1742729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007955	ATATCG	3	18	1746669	1746686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007955	AGGATT	2	12	1748075	1748086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007955	GCTAAA	2	12	1777296	1777307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007955	CCGACA	2	12	1785264	1785275	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007955	TTAAAA	2	12	1803038	1803049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007955	ATTGTA	2	12	1815197	1815208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007955	CAATAT	2	12	1824175	1824186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007955	TGGTAT	2	12	1824805	1824816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007955	CAATTG	2	12	1841846	1841857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_007955	TAGAAT	2	12	1848473	1848484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007955	AACTAT	2	12	1859688	1859699	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_007955	TTTCGG	2	12	1875633	1875644	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_007955	TGATGG	2	12	1878968	1878979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007955	AAGGAA	2	12	1884963	1884974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007955	TATAGT	2	12	1889730	1889741	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007955	TGGTAT	2	12	1897644	1897655	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007955	AGGATT	2	12	1897860	1897871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007955	TGTCAT	2	12	1923544	1923555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007955	TTAATT	2	12	2004172	2004183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007955	GTTAAT	2	12	2014051	2014062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007955	AATGAA	2	12	2017031	2017042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007955	AATATT	2	12	2039947	2039958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007955	TGGTTT	2	12	2057791	2057802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007955	ATAAAA	2	12	2067052	2067063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007955	GAAAAA	2	12	2168658	2168669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007955	ACAAAG	2	12	2169334	2169345	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_007955	CTAAAA	2	12	2170090	2170101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007955	ACTTTC	2	12	2172478	2172489	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007955	TTGCGA	2	12	2183230	2183241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_007955	TACTTA	2	12	2184103	2184114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_007955	AGCTGA	2	12	2241177	2241188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_007955	TGGTCT	2	12	2245101	2245112	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_007955	AGCTAC	2	12	2251841	2251852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007955	AAAAAC	2	12	2279481	2279492	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_007955	ACAAAT	2	12	2281511	2281522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_007955	TCAATT	2	12	2308476	2308487	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_007955	TGGAAT	2	12	2330280	2330291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007955	ATGATA	2	12	2335683	2335694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_007955	ATCAAA	2	12	2366697	2366708	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_007955	GCTTTT	2	12	2383649	2383660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_007955	CATCAA	2	12	2397900	2397911	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_007955	TTACCT	2	12	2398823	2398834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007955	AATCCT	2	12	2415669	2415680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007955	CGGTGA	2	12	2416002	2416013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_007955	ATGGGT	2	12	2416315	2416326	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007955	TGGCCT	2	12	2426804	2426815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_007955	GAAAAA	2	12	2454678	2454689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_007955	TGATGG	2	12	2480956	2480967	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_007955	TGTGAA	2	12	2494815	2494826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_007955	ATTATG	2	12	2523746	2523757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_007955	ATATTT	2	12	2535664	2535675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_007955	TAAAAA	2	12	2543901	2543912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.