MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007955	AGACCG	2	12	1684	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772084
2	NC_007955	AGGTAA	2	12	1934	1945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772084
3	NC_007955	TCAAGG	2	12	4439	4450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772089
4	NC_007955	CGATCA	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772091
5	NC_007955	GAGCAA	2	12	9528	9539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772101
6	NC_007955	TTTTAA	2	12	15349	15360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772109
7	NC_007955	CACTTT	2	12	23064	23075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	91772115
8	NC_007955	CTGCTT	2	12	33438	33449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91772127
9	NC_007955	GTGCAA	2	12	36744	36755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772129
10	NC_007955	AGAAAC	2	12	41621	41632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91772135
11	NC_007955	ACTCGA	2	12	43782	43793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772138
12	NC_007955	GGTAAT	2	12	46259	46270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772139
13	NC_007955	TAGTGT	2	12	47959	47970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772140
14	NC_007955	GAAACT	2	12	52685	52696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91772143
15	NC_007955	CTCTTT	2	12	53497	53508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772144
16	NC_007955	GGTTTA	2	12	56738	56749	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772147
17	NC_007955	CTATTG	2	12	57046	57057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772147
18	NC_007955	TGGTTT	2	12	57155	57166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772147
19	NC_007955	TACAAG	2	12	57531	57542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91772147
20	NC_007955	CTTCTG	2	12	58157	58168	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91772147
21	NC_007955	CTGCAA	2	12	58960	58971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772148
22	NC_007955	ATATGA	2	12	59618	59629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91772148
23	NC_007955	CAAAAT	2	12	75034	75045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91772161
24	NC_007955	TGGAAT	2	12	75163	75174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772161
25	NC_007955	CATTCA	2	12	75339	75350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772161
26	NC_007955	TCCCCA	2	12	76352	76363	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	91772162
27	NC_007955	ACCACT	2	12	80973	80984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	91772169
28	NC_007955	AAGGAA	2	12	83835	83846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772172
29	NC_007955	CACTTC	2	12	85081	85092	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	91772172
30	NC_007955	ATGGAT	2	12	85652	85663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772173
31	NC_007955	GGATGC	2	12	88032	88043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91772174
32	NC_007955	TCATCC	2	12	92421	92432	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	91772180
33	NC_007955	TACTTT	2	12	92666	92677	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772180
34	NC_007955	CTTTTG	2	12	93579	93590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772181
35	NC_007955	TACTGC	2	12	95715	95726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772184
36	NC_007955	CTGATT	2	12	100248	100259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772191
37	NC_007955	CCTGCT	2	12	101288	101299	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	91772193
38	NC_007955	TTTCCT	2	12	103377	103388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772195
39	NC_007955	TGCAGT	2	12	104395	104406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772197
40	NC_007955	ATGATC	2	12	105328	105339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772197
41	NC_007955	TATTCA	2	12	118290	118301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772208
42	NC_007955	GTATCG	2	12	118850	118861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772210
43	NC_007955	TTGACA	2	12	123970	123981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772216
44	NC_007955	ATTGTT	2	12	129637	129648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91772224
45	NC_007955	CTGTTT	2	12	134531	134542	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772225
46	NC_007955	AGAACG	2	12	136687	136698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772227
47	NC_007955	TTTTTG	2	12	142088	142099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772232
48	NC_007955	TGGAAT	2	12	153314	153325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772242
49	NC_007955	TCCATG	2	12	160836	160847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772248
50	NC_007955	CTTTAT	2	12	161028	161039	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772248
51	NC_007955	AGTTCC	2	12	163845	163856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772250
52	NC_007955	TACTGA	2	12	177278	177289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772261
53	NC_007955	AGGTAT	2	12	181418	181429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772267
54	NC_007955	GATGAG	2	12	182201	182212	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91772267
55	NC_007955	TGAATG	2	12	186699	186710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772275
56	NC_007955	TTATGC	2	12	187420	187431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772276
57	NC_007955	TTCTTT	2	12	189470	189481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	91772279
58	NC_007955	TTGCGC	2	12	190068	190079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772280
59	NC_007955	TTGGTG	2	12	190404	190415	0 %	50 %	50 %	0 %	91772280
60	NC_007955	ACGGAT	2	12	191556	191567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772281
61	NC_007955	TATGCA	2	12	196093	196104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772285
62	NC_007955	ACGTTG	2	12	197285	197296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772286
63	NC_007955	GATGCT	2	12	202987	202998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772293
64	NC_007955	ATGTTG	2	12	206706	206717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772298
65	NC_007955	GATTTT	2	12	206820	206831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91772299
66	NC_007955	AACCAT	2	12	218183	218194	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	91772310
67	NC_007955	CAATTT	3	18	222999	223016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772313
68	NC_007955	GTCAAG	2	12	234980	234991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772323
69	NC_007955	GAAGGA	2	12	235521	235532	50 %	0 %	50 %	0 %	91772324
70	NC_007955	CATGTT	2	12	236837	236848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772325
71	NC_007955	ATAGAG	2	12	238181	238192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772327
72	NC_007955	GAGATC	2	12	244835	244846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772331
73	NC_007955	CCAAGA	2	12	257959	257970	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91772343
74	NC_007955	TTACTT	2	12	258966	258977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772344
75	NC_007955	CCCCAG	2	12	261108	261119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	91772346
76	NC_007955	TCCTAT	2	12	268386	268397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	91772354
77	NC_007955	GTGGCT	2	12	269980	269991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	91772355
78	NC_007955	GAAATA	2	12	272625	272636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91772358
79	NC_007955	ACAGTT	2	12	272697	272708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772358
80	NC_007955	CTGCAA	2	12	273301	273312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772358
81	NC_007955	AACACA	2	12	278368	278379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772365
82	NC_007955	CAATAT	2	12	279545	279556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772366
83	NC_007955	ACATCG	2	12	280156	280167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772366
84	NC_007955	CTCTTT	2	12	281490	281501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772367
85	NC_007955	TTATCT	2	12	283937	283948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772370
86	NC_007955	GTGCCT	2	12	284829	284840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772371
87	NC_007955	ATACTT	2	12	286152	286163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772372
88	NC_007955	TTTGTT	2	12	286567	286578	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772372
89	NC_007955	TAACAT	2	12	290197	290208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772374
90	NC_007955	TGAAGA	2	12	290495	290506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772374
91	NC_007955	TCCCCA	2	12	291009	291020	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	91772374
92	NC_007955	TAAATT	2	12	291211	291222	50 %	50 %	0 %	0 %	91772374
93	NC_007955	AGAATT	2	12	291890	291901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91772374
94	NC_007955	TTTTTG	2	12	293741	293752	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772375
95	NC_007955	CGGCTG	2	12	295072	295083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91772376
96	NC_007955	GCAGAG	2	12	296008	296019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91772376
97	NC_007955	AGTTCA	2	12	301331	301342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772379
98	NC_007955	CTTTTG	2	12	314970	314981	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772388
99	NC_007955	AGGAAC	2	12	315428	315439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772388
100	NC_007955	ACAAAG	2	12	321113	321124	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91772394
101	NC_007955	AAAGAT	2	12	327304	327315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91772399
102	NC_007955	TGATAT	2	12	328994	329005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91772402
103	NC_007955	ATTGAA	2	12	334563	334574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91772407
104	NC_007955	AAAATA	2	12	344456	344467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	229220840
105	NC_007955	CGTAAG	2	12	345339	345350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772417
106	NC_007955	TGAAAA	2	12	346933	346944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91772419
107	NC_007955	GGTATT	2	12	349862	349873	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772422
108	NC_007955	GTTCAA	2	12	360477	360488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772433
109	NC_007955	GGTATT	2	12	360604	360615	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772433
110	NC_007955	GTTGTG	2	12	373282	373293	0 %	50 %	50 %	0 %	91772444
111	NC_007955	TCATCG	2	12	376737	376748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772447
112	NC_007955	AGCTAT	2	12	379203	379214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772449
113	NC_007955	AATATA	2	12	382399	382410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772450
114	NC_007955	TTTTTG	2	12	383861	383872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772451
115	NC_007955	GTCCAA	2	12	385511	385522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772452
116	NC_007955	ACCATC	2	12	385539	385550	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	91772452
117	NC_007955	TTGACA	2	12	386679	386690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772453
118	NC_007955	GCATTG	2	12	396354	396365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772461
119	NC_007955	GGGTGT	2	12	396880	396891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772461
120	NC_007955	CGGAGT	2	12	401289	401300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91772465
121	NC_007955	TGAGGA	2	12	404398	404409	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91772466
122	NC_007955	TCAAAT	2	12	414123	414134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772476
123	NC_007955	GCCAGT	2	12	415275	415286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91772477
124	NC_007955	CATTGC	2	12	415756	415767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772477
125	NC_007955	GGAGAT	2	12	425233	425244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91772483
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127	NC_007955	TCGATG	2	12	438390	438401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772492
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129	NC_007955	CAAAAT	2	12	442743	442754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91772494
130	NC_007955	ATCGTA	2	12	451324	451335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772500
131	NC_007955	CTTGAA	2	12	458258	458269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772508
132	NC_007955	TCCAGT	2	12	460306	460317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772510
133	NC_007955	TATCAA	2	12	460961	460972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772510
134	NC_007955	ATTGCC	2	12	465187	465198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772514
135	NC_007955	GGTGCA	2	12	465599	465610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91772514
136	NC_007955	ATGATC	2	12	468773	468784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772518
137	NC_007955	CAAAAA	2	12	471260	471271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	91772521
138	NC_007955	GAAGCT	2	12	478086	478097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772525
139	NC_007955	CTCATC	2	12	478546	478557	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	91772525
140	NC_007955	GCTATC	2	12	481159	481170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772527
141	NC_007955	TCAATA	2	12	483391	483402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772529
142	NC_007955	CATTAA	2	12	495235	495246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772541
143	NC_007955	GATCAT	2	12	496602	496613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772542
144	NC_007955	GATTTC	2	12	498236	498247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772544
145	NC_007955	CAGATG	2	12	499546	499557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772545
146	NC_007955	ACCATG	2	12	503962	503973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772547
147	NC_007955	GATGCC	2	12	509744	509755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91772550
148	NC_007955	TGCCTG	2	12	510029	510040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772550
149	NC_007955	TCAGCC	2	12	510348	510359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	91772550
150	NC_007955	TTGCCA	2	12	511231	511242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772550
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220	NC_007955	ACTGAA	2	12	774966	774977	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91772762
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230	NC_007955	AGTAGC	2	12	816983	816994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772793
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232	NC_007955	GCAAAA	2	12	821898	821909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91772800
233	NC_007955	AGCATG	2	12	827450	827461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772806
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338	NC_007955	TTGATC	2	12	1179534	1179545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91773085
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341	NC_007955	CTTCTG	2	12	1201000	1201011	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91773102
342	NC_007955	AAGTTT	2	12	1202707	1202718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	91773104
343	NC_007955	TTGAAA	2	12	1205777	1205788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91773106
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456	NC_007955	TCGATC	2	12	1555608	1555619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91773446
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