MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 1669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007955	TATT	2	8	2279504	2279511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_007955	GAAA	2	8	2280811	2280818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007955	GAAG	2	8	2280852	2280859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_007955	TTAT	2	8	2282753	2282760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_007955	TTCA	2	8	2282800	2282807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_007955	TAAA	2	8	2282820	2282827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_007955	AATG	2	8	2304042	2304049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007955	TTTC	2	8	2304152	2304159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_007955	TGAT	2	8	2304232	2304239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_007955	TTGC	2	8	2321934	2321941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_007955	AAGG	2	8	2325616	2325623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007955	ATGA	2	8	2326814	2326821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_007955	ATCT	2	8	2328046	2328053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_007955	TCAA	2	8	2328101	2328108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_007955	GAAG	2	8	2328315	2328322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007955	AATC	2	8	2328572	2328579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_007955	TCAT	2	8	2330171	2330178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_007955	TATG	2	8	2330227	2330234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007955	AAAG	2	8	2331180	2331187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_007955	TGCG	2	8	2331292	2331299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_007955	ATTC	2	8	2332347	2332354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_007955	TTAA	2	8	2332386	2332393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007955	CGAT	2	8	2333605	2333612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_007955	TCCA	2	8	2334368	2334375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_007955	AAAT	2	8	2334694	2334701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_007955	CATG	2	8	2344717	2344724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_007955	ATTA	2	8	2354595	2354602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1529	NC_007955	CTAT	2	8	2355230	2355237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_007955	TAAA	2	8	2356384	2356391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_007955	TAAA	2	8	2358291	2358298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_007955	TAAT	2	8	2358308	2358315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_007955	GAAA	2	8	2362152	2362159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_007955	GAAA	2	8	2362238	2362245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_007955	TTTC	2	8	2362264	2362271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1537	NC_007955	TCAA	2	8	2366980	2366987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_007955	CTGA	2	8	2369755	2369762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_007955	CTTT	2	8	2373565	2373572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_007955	CTTT	2	8	2374317	2374324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_007955	ATAA	2	8	2374574	2374581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007955	CATT	2	8	2381815	2381822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1544	NC_007955	TTAA	2	8	2383747	2383754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_007955	TTTA	2	8	2384008	2384015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_007955	TCTT	2	8	2384515	2384522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_007955	CTTT	2	8	2384538	2384545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_007955	TGCA	2	8	2386285	2386292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_007955	TGTT	2	8	2386535	2386542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007955	GTTT	2	8	2386890	2386897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_007955	GCTT	2	8	2389045	2389052	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_007955	TTCT	2	8	2397411	2397418	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_007955	GTAT	2	8	2397658	2397665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1555	NC_007955	TGCC	2	8	2397979	2397986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_007955	TCAT	2	8	2400680	2400687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_007955	ATTT	2	8	2400691	2400698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_007955	AAGA	2	8	2413994	2414001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_007955	TAGC	2	8	2415173	2415180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1562	NC_007955	CGAT	2	8	2415559	2415566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_007955	TGTA	2	8	2416209	2416216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_007955	GCAA	2	8	2416378	2416385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_007955	TTTG	2	8	2419421	2419428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007955	GAAT	2	8	2420478	2420485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_007955	TCTA	2	8	2421264	2421271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_007955	CCTA	2	8	2421720	2421727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_007955	AATC	2	8	2421729	2421736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_007955	AAAT	2	8	2423352	2423359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_007955	AATA	4	16	2423404	2423419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1574	NC_007955	AAAG	2	8	2425824	2425831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_007955	TGAG	2	8	2427357	2427364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_007955	CTCA	2	8	2446093	2446100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1605	NC_007955	TCTA	2	8	2450198	2450205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1607	NC_007955	TGTA	2	8	2451570	2451577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_007955	AAAG	2	8	2451812	2451819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_007955	CATT	2	8	2455408	2455415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_007955	TGTC	2	8	2456534	2456541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_007955	TATT	2	8	2458405	2458412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_007955	TAAA	2	8	2458911	2458918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_007955	GAAT	2	8	2466957	2466964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007955	ATAA	2	8	2469114	2469121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_007955	CTGA	2	8	2478475	2478482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_007955	ATCT	2	8	2478491	2478498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_007955	GGAT	2	8	2478817	2478824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_007955	GGAT	2	8	2480326	2480333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_007955	TTCC	2	8	2481336	2481343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_007955	TGAT	2	8	2481395	2481402	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_007955	TCCT	2	8	2494756	2494763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1638	NC_007955	ATTA	2	8	2500258	2500265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.