MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 6565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007955	CATC	2	8	2549641	2549648	25 %	25 %	0 %	50 %	91774331
6502	NC_007955	GCAG	2	8	2550194	2550201	25 %	0 %	50 %	25 %	91774331
6503	NC_007955	CATC	2	8	2551238	2551245	25 %	25 %	0 %	50 %	91774332
6504	NC_007955	CCAT	2	8	2551294	2551301	25 %	25 %	0 %	50 %	91774332
6505	NC_007955	TGCC	2	8	2552090	2552097	0 %	25 %	25 %	50 %	91774332
6506	NC_007955	GCCT	2	8	2552154	2552161	0 %	25 %	25 %	50 %	91774332
6507	NC_007955	GATG	2	8	2553055	2553062	25 %	25 %	50 %	0 %	91774332
6508	NC_007955	TCAT	2	8	2553985	2553992	25 %	50 %	0 %	25 %	91774332
6509	NC_007955	GCAA	2	8	2554349	2554356	50 %	0 %	25 %	25 %	91774333
6510	NC_007955	TACA	2	8	2555341	2555348	50 %	25 %	0 %	25 %	91774334
6511	NC_007955	CCAG	2	8	2555914	2555921	25 %	0 %	25 %	50 %	91774334
6512	NC_007955	TACT	2	8	2556172	2556179	25 %	50 %	0 %	25 %	91774334
6513	NC_007955	AGCC	2	8	2556343	2556350	25 %	0 %	25 %	50 %	91774334
6514	NC_007955	TAAC	2	8	2556605	2556612	50 %	25 %	0 %	25 %	91774334
6515	NC_007955	TGCA	2	8	2556682	2556689	25 %	25 %	25 %	25 %	91774335
6516	NC_007955	ATCC	2	8	2556857	2556864	25 %	25 %	0 %	50 %	91774335
6517	NC_007955	GCAT	2	8	2557618	2557625	25 %	25 %	25 %	25 %	91774335
6518	NC_007955	ATGG	2	8	2558387	2558394	25 %	25 %	50 %	0 %	91774336
6519	NC_007955	CAAC	2	8	2558448	2558455	50 %	0 %	0 %	50 %	91774336
6520	NC_007955	ATGG	2	8	2559251	2559258	25 %	25 %	50 %	0 %	91774337
6521	NC_007955	TGAA	2	8	2559396	2559403	50 %	25 %	25 %	0 %	91774337
6522	NC_007955	CATT	2	8	2559495	2559502	25 %	50 %	0 %	25 %	91774337
6523	NC_007955	ATGG	2	8	2559813	2559820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_007955	GATC	2	8	2560107	2560114	25 %	25 %	25 %	25 %	91774338
6525	NC_007955	TTGT	2	8	2560489	2560496	0 %	75 %	25 %	0 %	91774338
6526	NC_007955	CGTT	2	8	2560745	2560752	0 %	50 %	25 %	25 %	91774338
6527	NC_007955	TTCA	2	8	2561343	2561350	25 %	50 %	0 %	25 %	91774339
6528	NC_007955	TGCT	2	8	2561840	2561847	0 %	50 %	25 %	25 %	91774341
6529	NC_007955	TGCG	2	8	2562168	2562175	0 %	25 %	50 %	25 %	91774341
6530	NC_007955	TAAT	2	8	2562272	2562279	50 %	50 %	0 %	0 %	91774341
6531	NC_007955	TGCC	2	8	2562666	2562673	0 %	25 %	25 %	50 %	91774341
6532	NC_007955	CGTC	2	8	2562809	2562816	0 %	25 %	25 %	50 %	91774341
6533	NC_007955	TCGA	2	8	2563181	2563188	25 %	25 %	25 %	25 %	91774341
6534	NC_007955	GCTG	2	8	2563338	2563345	0 %	25 %	50 %	25 %	91774341
6535	NC_007955	AGGC	2	8	2565023	2565030	25 %	0 %	50 %	25 %	91774343
6536	NC_007955	AAAT	2	8	2565317	2565324	75 %	25 %	0 %	0 %	91774343
6537	NC_007955	TTAA	2	8	2565333	2565340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_007955	TACA	2	8	2566169	2566176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6539	NC_007955	GTTT	2	8	2566216	2566223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_007955	TGGT	2	8	2566797	2566804	0 %	50 %	50 %	0 %	91774345
6541	NC_007955	AAGG	2	8	2568016	2568023	50 %	0 %	50 %	0 %	91774346
6542	NC_007955	CTAC	2	8	2568512	2568519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_007955	TGTT	2	8	2569209	2569216	0 %	75 %	25 %	0 %	91774348
6544	NC_007955	AAAT	2	8	2569644	2569651	75 %	25 %	0 %	0 %	91774348
6545	NC_007955	ATGA	2	8	2569779	2569786	50 %	25 %	25 %	0 %	91774348
6546	NC_007955	GTTG	2	8	2569815	2569822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_007955	TGAG	2	8	2569823	2569830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_007955	TCCA	2	8	2570002	2570009	25 %	25 %	0 %	50 %	91774349
6549	NC_007955	TCCT	2	8	2570165	2570172	0 %	50 %	0 %	50 %	91774349
6550	NC_007955	ATTT	2	8	2570878	2570885	25 %	75 %	0 %	0 %	91774350
6551	NC_007955	CTTG	2	8	2571577	2571584	0 %	50 %	25 %	25 %	91774351
6552	NC_007955	CCTG	2	8	2571645	2571652	0 %	25 %	25 %	50 %	91774351
6553	NC_007955	ATCT	2	8	2572165	2572172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6554	NC_007955	GTTT	2	8	2572216	2572223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_007955	GAGC	2	8	2572485	2572492	25 %	0 %	50 %	25 %	91774352
6556	NC_007955	ATTT	2	8	2572721	2572728	25 %	75 %	0 %	0 %	91774353
6557	NC_007955	TGGG	2	8	2573195	2573202	0 %	25 %	75 %	0 %	91774353
6558	NC_007955	TCTT	2	8	2573377	2573384	0 %	75 %	0 %	25 %	91774354
6559	NC_007955	ATGG	2	8	2573508	2573515	25 %	25 %	50 %	0 %	91774354
6560	NC_007955	CAGT	2	8	2573809	2573816	25 %	25 %	25 %	25 %	91774355
6561	NC_007955	CATC	2	8	2573926	2573933	25 %	25 %	0 %	50 %	91774355
6562	NC_007955	ATCT	2	8	2574569	2574576	25 %	50 %	0 %	25 %	91774355
6563	NC_007955	TCAA	2	8	2574789	2574796	50 %	25 %	0 %	25 %	91774355
6564	NC_007955	TTTA	2	8	2574838	2574845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_007955	GATT	2	8	2575013	2575020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.