MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 2

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007952	CACAGC	2	12	4069	4080	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007952	CGCGTG	2	12	23785	23796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007952	ACAAGG	3	18	41994	42011	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007952	CCGATC	2	12	52720	52731	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007952	GACAGC	2	12	54557	54568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007952	CCGGCG	2	12	87466	87477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007952	CACTCT	2	12	163257	163268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007952	GCCGCA	7	42	174347	174388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007952	TGGCAA	3	18	280041	280058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007952	CGCGGC	2	12	339137	339148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007952	GTGATG	2	12	397140	397151	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007952	CATTGC	2	12	399688	399699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007952	AATTCA	2	12	418518	418529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007952	GCTCGC	2	12	450438	450449	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007952	TGCACT	2	12	525097	525108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007952	GAGCTT	2	12	538899	538910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007952	TCGTGA	2	12	571079	571090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007952	TCGGCT	2	12	603783	603794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007952	GAATGC	2	12	610908	610919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007952	AATCGT	2	12	610955	610966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007952	CGCCGT	2	12	651969	651980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007952	GGGCAG	2	12	696623	696634	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007952	GCACGG	2	12	696643	696654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007952	TGAACC	2	12	755285	755296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007952	GTCTGG	2	12	795984	795995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007952	GAGCTT	2	12	867327	867338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007952	CGGCCC	2	12	897516	897527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007952	CCGCGC	2	12	931062	931073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007952	GTGGCG	2	12	941012	941023	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007952	GCGCTC	2	12	944566	944577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007952	GAAGCG	2	12	990365	990376	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007952	GCCGGC	2	12	1015973	1015984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007952	CCGATC	3	18	1033018	1033035	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007952	TCCTGA	2	12	1033087	1033098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007952	GCCAAA	2	12	1044227	1044238	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007952	GAATCA	2	12	1052349	1052360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007952	GTTGCC	2	12	1076795	1076806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007952	TTGCCC	2	12	1076814	1076825	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007952	TGCGCT	2	12	1139680	1139691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007952	ATCGAC	2	12	1140530	1140541	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007952	GCCGCG	2	12	1148608	1148619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007952	CGGTTT	2	12	1163135	1163146	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007952	TTTACC	2	12	1216375	1216386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007952	GGGAAC	2	12	1233008	1233019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007952	GTTCGA	2	12	1233108	1233119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007952	CTGCCG	2	12	1242226	1242237	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007952	GCCTCG	2	12	1262645	1262656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007952	CTGCAT	2	12	1292988	1292999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007952	TGGCAA	2	12	1370165	1370176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007952	CGCTTG	2	12	1421588	1421599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007952	TCGGAA	2	12	1438876	1438887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007952	AATATG	2	12	1446278	1446289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007952	CGCTGC	2	12	1493934	1493945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007952	TGCTTG	2	12	1511033	1511044	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007952	GCACGG	2	12	1513628	1513639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007952	GTGAAC	2	12	1515332	1515343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007952	GTTGCC	2	12	1529705	1529716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007952	GGGAAG	2	12	1547664	1547675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007952	CGTGCA	2	12	1547882	1547893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007952	AAACAT	2	12	1583400	1583411	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007952	GGAACG	2	12	1634385	1634396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007952	GTGCCG	2	12	1639503	1639514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007952	AGCGGA	2	12	1651891	1651902	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007952	GCACGG	2	12	1658026	1658037	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007952	GCGGCA	2	12	1752675	1752686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007952	CTCGGC	2	12	1793464	1793475	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007952	GCGTCC	2	12	1851376	1851387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007952	TGTTCC	2	12	1907323	1907334	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007952	TTCTCC	2	12	1914176	1914187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007952	GTGCCG	2	12	1928481	1928492	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007952	CCCTCA	2	12	1961112	1961123	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007952	CTGCCC	2	12	1996617	1996628	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007952	GTTCCC	2	12	2026180	2026191	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007952	GGTTCA	2	12	2066694	2066705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007952	CGGCAG	2	12	2086285	2086296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007952	CCAACG	2	12	2089577	2089588	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007952	CCGCGC	2	12	2090375	2090386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007952	GAAAGA	2	12	2103845	2103856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007952	TGAACC	2	12	2233605	2233616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007952	GTCGAT	2	12	2236085	2236096	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007952	CGCTCG	2	12	2266715	2266726	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007952	GCCAAA	3	18	2283545	2283562	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007952	GCGCTT	2	12	2313548	2313559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007952	GCGACA	2	12	2353093	2353104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007952	CTAGAA	2	12	2362128	2362139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007952	TGGCAC	2	12	2405589	2405600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007952	GACACG	2	12	2407316	2407327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007952	AGAAAG	2	12	2453221	2453232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007952	CGAGTC	2	12	2494584	2494595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007952	CTCAGT	2	12	2497239	2497250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007952	TGCCGC	2	12	2503116	2503127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007952	CATGGA	2	12	2509357	2509368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007952	GTCATG	2	12	2538489	2538500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007952	GTCTTT	2	12	2539647	2539658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007952	CGGCGC	2	12	2576429	2576440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007952	GAAACA	2	12	2596876	2596887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007952	CTGATC	2	12	2669346	2669357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007952	TGGCGT	3	18	2673086	2673103	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007952	TGGCGT	3	18	2673110	2673127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007952	GGCGTT	8	48	2673129	2673176	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007952	GGCGCT	8	48	2673177	2673224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007952	TACGTC	2	12	2678077	2678088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007952	TCCCGC	2	12	2747301	2747312	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007952	ACTGCC	2	12	2764904	2764915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007952	GCTATC	2	12	2814197	2814208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007952	CTTTAT	2	12	2824963	2824974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007952	GCAGAT	2	12	2825312	2825323	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007952	GCGGAC	2	12	2825460	2825471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007952	CAGAAG	2	12	2867329	2867340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007952	CGTGAT	2	12	2913861	2913872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007952	CGAATC	2	12	2929287	2929298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007952	CAGCTT	2	12	2938746	2938757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007952	GGCTCG	2	12	2986855	2986866	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007952	TCCGGC	2	12	2992951	2992962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007952	GCCGTC	2	12	3018137	3018148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007952	GGACGA	2	12	3086335	3086346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007952	CGCTCG	2	12	3092199	3092210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007952	CGCGAA	2	12	3112107	3112118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007952	AGCGCG	2	12	3115069	3115080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007952	CCGCGC	2	12	3138231	3138242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007952	CGGATG	2	12	3173986	3173997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007952	AAGCGG	2	12	3176257	3176268	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007952	CTGACG	2	12	3186890	3186901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007952	CGAAAC	2	12	3213961	3213972	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007952	GCAGTA	2	12	3231063	3231074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007952	GGCATG	2	12	3248048	3248059	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007952	TTCGCA	2	12	3307682	3307693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007952	GTATGA	2	12	3326310	3326321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.