MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 2

Total Repeats: 2423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007952	GGTCA	2	10	1386	1395	20 %	20 %	40 %	20 %	91777112
2	NC_007952	GCGTC	2	10	6401	6410	0 %	20 %	40 %	40 %	91777114
3	NC_007952	AGCGG	2	10	7032	7041	20 %	0 %	60 %	20 %	91777115
4	NC_007952	GTCGC	2	10	7544	7553	0 %	20 %	40 %	40 %	91777115
5	NC_007952	AGCGC	2	10	8456	8465	20 %	0 %	40 %	40 %	91777116
6	NC_007952	TCGCC	2	10	8642	8651	0 %	20 %	20 %	60 %	91777117
7	NC_007952	TCGAA	2	10	12635	12644	40 %	20 %	20 %	20 %	91777121
8	NC_007952	CGATC	2	10	12843	12852	20 %	20 %	20 %	40 %	91777121
9	NC_007952	CCGAT	2	10	13155	13164	20 %	20 %	20 %	40 %	91777122
10	NC_007952	AGGCC	2	10	20216	20225	20 %	0 %	40 %	40 %	91777128
11	NC_007952	TGCGC	2	10	20345	20354	0 %	20 %	40 %	40 %	91777128
12	NC_007952	ATCTG	2	10	23062	23071	20 %	40 %	20 %	20 %	91777131
13	NC_007952	GAACT	2	10	24877	24886	40 %	20 %	20 %	20 %	91777133
14	NC_007952	GCGCC	2	10	25977	25986	0 %	0 %	40 %	60 %	91777134
15	NC_007952	GCGCC	2	10	26268	26277	0 %	0 %	40 %	60 %	91777135
16	NC_007952	GCACG	2	10	27860	27869	20 %	0 %	40 %	40 %	91777136
17	NC_007952	TCCGC	2	10	28732	28741	0 %	20 %	20 %	60 %	91777137
18	NC_007952	TGGCA	2	10	31182	31191	20 %	20 %	40 %	20 %	91777139
19	NC_007952	CGGCG	2	10	32223	32232	0 %	0 %	60 %	40 %	91777140
20	NC_007952	GCCGC	2	10	33911	33920	0 %	0 %	40 %	60 %	91777141
21	NC_007952	CGATC	2	10	34753	34762	20 %	20 %	20 %	40 %	91777142
22	NC_007952	CGGCG	2	10	36696	36705	0 %	0 %	60 %	40 %	91777144
23	NC_007952	ACGCC	2	10	37340	37349	20 %	0 %	20 %	60 %	91777144
24	NC_007952	CGGCG	2	10	47579	47588	0 %	0 %	60 %	40 %	91777154
25	NC_007952	GGCGC	2	10	49373	49382	0 %	0 %	60 %	40 %	91777155
26	NC_007952	TGCGC	2	10	50312	50321	0 %	20 %	40 %	40 %	91777155
27	NC_007952	GCGCC	2	10	55263	55272	0 %	0 %	40 %	60 %	91777158
28	NC_007952	TCGGC	2	10	55791	55800	0 %	20 %	40 %	40 %	91777158
29	NC_007952	GCTTG	2	10	57491	57500	0 %	40 %	40 %	20 %	91777161
30	NC_007952	CCACG	2	10	57655	57664	20 %	0 %	20 %	60 %	91777161
31	NC_007952	GTACG	2	10	63298	63307	20 %	20 %	40 %	20 %	91777167
32	NC_007952	CGGAC	2	10	65236	65245	20 %	0 %	40 %	40 %	91777168
33	NC_007952	TCGGC	2	10	66437	66446	0 %	20 %	40 %	40 %	91777169
34	NC_007952	ACGTC	2	10	71011	71020	20 %	20 %	20 %	40 %	91777172
35	NC_007952	TTGCG	2	10	71500	71509	0 %	40 %	40 %	20 %	91777172
36	NC_007952	GCAAG	2	10	72308	72317	40 %	0 %	40 %	20 %	91777173
37	NC_007952	GGCAG	2	10	72806	72815	20 %	0 %	60 %	20 %	91777173
38	NC_007952	CTCGC	2	10	75219	75228	0 %	20 %	20 %	60 %	91777175
39	NC_007952	CGCGC	2	10	75897	75906	0 %	0 %	40 %	60 %	91777177
40	NC_007952	CCGTC	2	10	76291	76300	0 %	20 %	20 %	60 %	91777177
41	NC_007952	GTGCG	2	10	76888	76897	0 %	20 %	60 %	20 %	91777177
42	NC_007952	GCCGC	2	10	77195	77204	0 %	0 %	40 %	60 %	91777177
43	NC_007952	TGCCG	2	10	78202	78211	0 %	20 %	40 %	40 %	91777178
44	NC_007952	GCAAG	2	10	80140	80149	40 %	0 %	40 %	20 %	91777181
45	NC_007952	AACGA	2	10	83797	83806	60 %	0 %	20 %	20 %	91777185
46	NC_007952	TCGAT	2	10	84164	84173	20 %	40 %	20 %	20 %	91777185
47	NC_007952	CGCAG	2	10	84839	84848	20 %	0 %	40 %	40 %	91777185
48	NC_007952	GCGCC	2	10	89321	89330	0 %	0 %	40 %	60 %	91777190
49	NC_007952	GCGTC	2	10	91234	91243	0 %	20 %	40 %	40 %	91777193
50	NC_007952	CGGCG	2	10	91733	91742	0 %	0 %	60 %	40 %	91777193
51	NC_007952	TGCCG	2	10	92538	92547	0 %	20 %	40 %	40 %	91777194
52	NC_007952	GGCGC	2	10	97933	97942	0 %	0 %	60 %	40 %	91777198
53	NC_007952	ACCGT	2	10	99633	99642	20 %	20 %	20 %	40 %	91777199
54	NC_007952	GCACG	2	10	99970	99979	20 %	0 %	40 %	40 %	91777199
55	NC_007952	TGGCC	2	10	100639	100648	0 %	20 %	40 %	40 %	91777200
56	NC_007952	TTCGA	2	10	101881	101890	20 %	40 %	20 %	20 %	91777201
57	NC_007952	TGGTC	2	10	101990	101999	0 %	40 %	40 %	20 %	91777201
58	NC_007952	CAAGG	2	10	104128	104137	40 %	0 %	40 %	20 %	91777202
59	NC_007952	GCGAG	2	10	107534	107543	20 %	0 %	60 %	20 %	91777203
60	NC_007952	TCGCT	2	10	111524	111533	0 %	40 %	20 %	40 %	91777206
61	NC_007952	CGGCG	2	10	111624	111633	0 %	0 %	60 %	40 %	91777206
62	NC_007952	ATTAC	2	10	112073	112082	40 %	40 %	0 %	20 %	91777206
63	NC_007952	CGCTG	2	10	112453	112462	0 %	20 %	40 %	40 %	91777207
64	NC_007952	TGCAA	2	10	113899	113908	40 %	20 %	20 %	20 %	91777208
65	NC_007952	CGCGC	2	10	114811	114820	0 %	0 %	40 %	60 %	91777209
66	NC_007952	CATCG	2	10	115387	115396	20 %	20 %	20 %	40 %	91777210
67	NC_007952	GCGCG	2	10	117519	117528	0 %	0 %	60 %	40 %	91777213
68	NC_007952	AGCGA	2	10	118195	118204	40 %	0 %	40 %	20 %	91777214
69	NC_007952	GGCAC	2	10	118408	118417	20 %	0 %	40 %	40 %	91777214
70	NC_007952	GCCCA	2	10	118582	118591	20 %	0 %	20 %	60 %	91777215
71	NC_007952	CGATT	2	10	119229	119238	20 %	40 %	20 %	20 %	91777215
72	NC_007952	GCAGA	2	10	119620	119629	40 %	0 %	40 %	20 %	91777216
73	NC_007952	TCCGG	2	10	119810	119819	0 %	20 %	40 %	40 %	91777216
74	NC_007952	CGTGC	2	10	120749	120758	0 %	20 %	40 %	40 %	91777216
75	NC_007952	ATTTT	2	10	124192	124201	20 %	80 %	0 %	0 %	91777218
76	NC_007952	GAGAG	2	10	124283	124292	40 %	0 %	60 %	0 %	91777219
77	NC_007952	GCGTC	2	10	124396	124405	0 %	20 %	40 %	40 %	91777219
78	NC_007952	GCGCG	2	10	124546	124555	0 %	0 %	60 %	40 %	91777220
79	NC_007952	TGCCG	2	10	129014	129023	0 %	20 %	40 %	40 %	91777226
80	NC_007952	CGCTG	2	10	134161	134170	0 %	20 %	40 %	40 %	91777229
81	NC_007952	CGCGG	2	10	134504	134513	0 %	0 %	60 %	40 %	91777229
82	NC_007952	TCGGC	2	10	135315	135324	0 %	20 %	40 %	40 %	91777229
83	NC_007952	ATACG	2	10	135367	135376	40 %	20 %	20 %	20 %	91777229
84	NC_007952	TCGTA	2	10	137262	137271	20 %	40 %	20 %	20 %	91777229
85	NC_007952	GTACG	2	10	140017	140026	20 %	20 %	40 %	20 %	91777229
86	NC_007952	CGGCA	2	10	140737	140746	20 %	0 %	40 %	40 %	91777229
87	NC_007952	TGATC	2	10	142958	142967	20 %	40 %	20 %	20 %	91777231
88	NC_007952	TGCGG	2	10	143813	143822	0 %	20 %	60 %	20 %	91777232
89	NC_007952	TCGAT	2	10	144311	144320	20 %	40 %	20 %	20 %	91777232
90	NC_007952	CCGAG	2	10	147238	147247	20 %	0 %	40 %	40 %	91777234
91	NC_007952	CGGCA	2	10	148781	148790	20 %	0 %	40 %	40 %	91777235
92	NC_007952	GCGCA	2	10	149219	149228	20 %	0 %	40 %	40 %	91777235
93	NC_007952	CGGGT	2	10	149810	149819	0 %	20 %	60 %	20 %	91777235
94	NC_007952	CCACC	2	10	157069	157078	20 %	0 %	0 %	80 %	91777244
95	NC_007952	GATCT	2	10	158919	158928	20 %	40 %	20 %	20 %	91777246
96	NC_007952	AAGCC	2	10	160469	160478	40 %	0 %	20 %	40 %	91777247
97	NC_007952	GTGGA	2	10	161581	161590	20 %	20 %	60 %	0 %	91777248
98	NC_007952	ATCGA	2	10	161824	161833	40 %	20 %	20 %	20 %	91777248
99	NC_007952	AGCGG	2	10	163090	163099	20 %	0 %	60 %	20 %	91777249
100	NC_007952	CGAAG	2	10	163418	163427	40 %	0 %	40 %	20 %	91777250
101	NC_007952	AAGTA	2	10	165835	165844	60 %	20 %	20 %	0 %	91777252
102	NC_007952	GGCGC	2	10	167015	167024	0 %	0 %	60 %	40 %	91777253
103	NC_007952	AGGCG	2	10	167257	167266	20 %	0 %	60 %	20 %	91777253
104	NC_007952	ACGTC	2	10	167778	167787	20 %	20 %	20 %	40 %	91777253
105	NC_007952	CCGCA	2	10	168030	168039	20 %	0 %	20 %	60 %	91777253
106	NC_007952	CGGCC	2	10	168424	168433	0 %	0 %	40 %	60 %	91777253
107	NC_007952	CCGCA	2	10	169489	169498	20 %	0 %	20 %	60 %	91777255
108	NC_007952	CACCC	2	10	172061	172070	20 %	0 %	0 %	80 %	91777257
109	NC_007952	GCCGC	2	10	172256	172265	0 %	0 %	40 %	60 %	91777257
110	NC_007952	ACGAC	2	10	172642	172651	40 %	0 %	20 %	40 %	161621320
111	NC_007952	ACGCG	2	10	173009	173018	20 %	0 %	40 %	40 %	161621320
112	NC_007952	GCGCG	2	10	173703	173712	0 %	0 %	60 %	40 %	91777259
113	NC_007952	TTCGC	2	10	174824	174833	0 %	40 %	20 %	40 %	91777260
114	NC_007952	CGGCG	2	10	175813	175822	0 %	0 %	60 %	40 %	91777261
115	NC_007952	CGATG	2	10	175902	175911	20 %	20 %	40 %	20 %	91777261
116	NC_007952	AGATG	2	10	177709	177718	40 %	20 %	40 %	0 %	91777263
117	NC_007952	CGTCC	2	10	178287	178296	0 %	20 %	20 %	60 %	91777263
118	NC_007952	CTTCG	2	10	178549	178558	0 %	40 %	20 %	40 %	91777263
119	NC_007952	AAGCG	2	10	178858	178867	40 %	0 %	40 %	20 %	91777263
120	NC_007952	CGATG	2	10	181031	181040	20 %	20 %	40 %	20 %	91777265
121	NC_007952	CCGCG	2	10	181453	181462	0 %	0 %	40 %	60 %	91777266
122	NC_007952	GCATG	2	10	182473	182482	20 %	20 %	40 %	20 %	91777267
123	NC_007952	ACGGC	2	10	182504	182513	20 %	0 %	40 %	40 %	91777267
124	NC_007952	CGAAG	2	10	182580	182589	40 %	0 %	40 %	20 %	91777267
125	NC_007952	GCATG	2	10	182943	182952	20 %	20 %	40 %	20 %	91777268
126	NC_007952	CGAGT	2	10	184060	184069	20 %	20 %	40 %	20 %	91777268
127	NC_007952	ATGCA	2	10	186775	186784	40 %	20 %	20 %	20 %	91777270
128	NC_007952	CGCGC	2	10	186785	186794	0 %	0 %	40 %	60 %	91777270
129	NC_007952	CGCGG	2	10	188103	188112	0 %	0 %	60 %	40 %	91777271
130	NC_007952	CGGGC	2	10	188280	188289	0 %	0 %	60 %	40 %	91777271
131	NC_007952	CGGTT	2	10	189589	189598	0 %	40 %	40 %	20 %	91777271
132	NC_007952	CAGCA	2	10	190077	190086	40 %	0 %	20 %	40 %	91777271
133	NC_007952	CGATA	2	10	191377	191386	40 %	20 %	20 %	20 %	91777272
134	NC_007952	TCACT	2	10	191428	191437	20 %	40 %	0 %	40 %	91777272
135	NC_007952	GTCCG	2	10	191522	191531	0 %	20 %	40 %	40 %	91777272
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