MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 1

Total Repeats: 4151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007951	ACGTG	2	10	253	262	20 %	20 %	40 %	20 %	91781385
2	NC_007951	ACCAC	2	10	1720	1729	40 %	0 %	0 %	60 %	91781385
3	NC_007951	AGCGC	2	10	3561	3570	20 %	0 %	40 %	40 %	91781387
4	NC_007951	GTGCT	2	10	4130	4139	0 %	40 %	40 %	20 %	91781387
5	NC_007951	GTTTT	2	10	5922	5931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007951	CAGGC	2	10	5933	5942	20 %	0 %	40 %	40 %	91781388
7	NC_007951	TCTGC	2	10	7899	7908	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007951	CAAAA	2	10	7943	7952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007951	CCTTC	2	10	11578	11587	0 %	40 %	0 %	60 %	91781391
10	NC_007951	CACAT	2	10	12980	12989	40 %	20 %	0 %	40 %	91781392
11	NC_007951	CAGGT	2	10	13619	13628	20 %	20 %	40 %	20 %	91781393
12	NC_007951	CAAGC	2	10	14408	14417	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007951	CACCC	2	10	16837	16846	20 %	0 %	0 %	80 %	91781396
14	NC_007951	TTCGC	2	10	20146	20155	0 %	40 %	20 %	40 %	91781399
15	NC_007951	CCGGC	2	10	20316	20325	0 %	0 %	40 %	60 %	91781399
16	NC_007951	CGGCG	2	10	20420	20429	0 %	0 %	60 %	40 %	91781399
17	NC_007951	CCACG	2	10	21355	21364	20 %	0 %	20 %	60 %	91781400
18	NC_007951	CGGCG	2	10	23060	23069	0 %	0 %	60 %	40 %	91781402
19	NC_007951	CGGCG	2	10	23531	23540	0 %	0 %	60 %	40 %	91781402
20	NC_007951	GCGCC	2	10	23933	23942	0 %	0 %	40 %	60 %	91781402
21	NC_007951	GGGCA	2	10	25069	25078	20 %	0 %	60 %	20 %	91781403
22	NC_007951	GCGCC	2	10	25813	25822	0 %	0 %	40 %	60 %	91781404
23	NC_007951	GGCGC	2	10	29263	29272	0 %	0 %	60 %	40 %	91781407
24	NC_007951	CGCGG	2	10	30339	30348	0 %	0 %	60 %	40 %	91781408
25	NC_007951	AGCGC	2	10	31763	31772	20 %	0 %	40 %	40 %	91781408
26	NC_007951	TCGAG	2	10	31781	31790	20 %	20 %	40 %	20 %	91781408
27	NC_007951	GGCCG	2	10	32819	32828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007951	TGATC	2	10	33253	33262	20 %	40 %	20 %	20 %	91781411
29	NC_007951	TCGAA	2	10	36241	36250	40 %	20 %	20 %	20 %	91781413
30	NC_007951	CGACG	2	10	36656	36665	20 %	0 %	40 %	40 %	91781413
31	NC_007951	TCGAA	2	10	38029	38038	40 %	20 %	20 %	20 %	91781414
32	NC_007951	GTCGT	2	10	38460	38469	0 %	40 %	40 %	20 %	91781414
33	NC_007951	TCGAG	2	10	39983	39992	20 %	20 %	40 %	20 %	91781415
34	NC_007951	GTGCG	2	10	40559	40568	0 %	20 %	60 %	20 %	91781416
35	NC_007951	CCGCG	2	10	42021	42030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007951	GCGCG	2	10	42241	42250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007951	CCGTA	2	10	42411	42420	20 %	20 %	20 %	40 %	91781417
38	NC_007951	CGTAC	2	10	46190	46199	20 %	20 %	20 %	40 %	91781419
39	NC_007951	GAGGC	2	10	46306	46315	20 %	0 %	60 %	20 %	91781419
40	NC_007951	GCAGC	2	10	47247	47256	20 %	0 %	40 %	40 %	91781420
41	NC_007951	ACGCG	2	10	48053	48062	20 %	0 %	40 %	40 %	91781420
42	NC_007951	ATCGA	2	10	49700	49709	40 %	20 %	20 %	20 %	91781420
43	NC_007951	TGAAG	2	10	50737	50746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007951	CGGCG	2	10	52472	52481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007951	CGTGC	2	10	54480	54489	0 %	20 %	40 %	40 %	91781424
46	NC_007951	GCGCA	2	10	56583	56592	20 %	0 %	40 %	40 %	91781426
47	NC_007951	TCAGA	2	10	60380	60389	40 %	20 %	20 %	20 %	91781428
48	NC_007951	GCGTC	2	10	60874	60883	0 %	20 %	40 %	40 %	91781429
49	NC_007951	GCGCC	2	10	62130	62139	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_007951	TGGCG	2	10	63208	63217	0 %	20 %	60 %	20 %	91781431
51	NC_007951	CGCGG	2	10	64041	64050	0 %	0 %	60 %	40 %	91781432
52	NC_007951	GCGCC	2	10	66707	66716	0 %	0 %	40 %	60 %	91781434
53	NC_007951	TACGT	2	10	67063	67072	20 %	40 %	20 %	20 %	91781434
54	NC_007951	AAATC	2	10	68960	68969	60 %	20 %	0 %	20 %	91781436
55	NC_007951	GCGCG	2	10	69375	69384	0 %	0 %	60 %	40 %	91781436
56	NC_007951	GCGCG	2	10	69621	69630	0 %	0 %	60 %	40 %	91781436
57	NC_007951	GCGAC	2	10	69824	69833	20 %	0 %	40 %	40 %	91781436
58	NC_007951	CGGGC	2	10	69996	70005	0 %	0 %	60 %	40 %	91781436
59	NC_007951	CGGCG	2	10	74642	74651	0 %	0 %	60 %	40 %	91781443
60	NC_007951	TGGCG	2	10	76481	76490	0 %	20 %	60 %	20 %	91781445
61	NC_007951	GGCAG	2	10	76730	76739	20 %	0 %	60 %	20 %	91781445
62	NC_007951	CACGC	2	10	80382	80391	20 %	0 %	20 %	60 %	91781447
63	NC_007951	GCACG	2	10	81363	81372	20 %	0 %	40 %	40 %	91781448
64	NC_007951	GGGCC	2	10	81734	81743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007951	GCCAG	2	10	81854	81863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007951	TCGGC	2	10	82506	82515	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007951	CGTGC	2	10	83920	83929	0 %	20 %	40 %	40 %	91781450
68	NC_007951	CGGCC	2	10	85116	85125	0 %	0 %	40 %	60 %	91781451
69	NC_007951	GGCCA	2	10	85477	85486	20 %	0 %	40 %	40 %	91781451
70	NC_007951	CTGAA	2	10	85551	85560	40 %	20 %	20 %	20 %	91781451
71	NC_007951	CGTTT	2	10	85644	85653	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007951	CGCGG	2	10	92154	92163	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007951	GAGCG	2	10	93737	93746	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007951	GCCGT	2	10	96844	96853	0 %	20 %	40 %	40 %	91781462
75	NC_007951	TTTCG	2	10	97361	97370	0 %	60 %	20 %	20 %	91781463
76	NC_007951	TCACG	2	10	98051	98060	20 %	20 %	20 %	40 %	91781463
77	NC_007951	ATCAG	2	10	98998	99007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007951	GCTTC	2	10	100749	100758	0 %	40 %	20 %	40 %	91781466
79	NC_007951	GCCGC	2	10	101273	101282	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007951	GCCGC	2	10	102325	102334	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_007951	GCCGG	2	10	103582	103591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007951	TCGCG	2	10	104952	104961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007951	CGCGC	2	10	106938	106947	0 %	0 %	40 %	60 %	91781473
84	NC_007951	GTTCA	2	10	107689	107698	20 %	40 %	20 %	20 %	91781474
85	NC_007951	GCCGA	2	10	108315	108324	20 %	0 %	40 %	40 %	91781474
86	NC_007951	GGTAA	2	10	108766	108775	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007951	CCGCA	2	10	109630	109639	20 %	0 %	20 %	60 %	91781475
88	NC_007951	TGTCG	2	10	110181	110190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007951	CGCCA	2	10	111980	111989	20 %	0 %	20 %	60 %	91781478
90	NC_007951	CAGTC	2	10	113729	113738	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007951	CCGCG	2	10	114510	114519	0 %	0 %	40 %	60 %	91781481
92	NC_007951	GCGCC	2	10	117358	117367	0 %	0 %	40 %	60 %	91781483
93	NC_007951	TGGAT	2	10	120869	120878	20 %	40 %	40 %	0 %	91781484
94	NC_007951	CGCGC	2	10	124460	124469	0 %	0 %	40 %	60 %	91781487
95	NC_007951	ATCGA	2	10	125184	125193	40 %	20 %	20 %	20 %	91781487
96	NC_007951	TCCCG	2	10	125972	125981	0 %	20 %	20 %	60 %	91781488
97	NC_007951	TGCGG	2	10	126465	126474	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007951	CGCGC	2	10	126738	126747	0 %	0 %	40 %	60 %	91781489
99	NC_007951	CGCGC	2	10	127816	127825	0 %	0 %	40 %	60 %	91781490
100	NC_007951	GCCGC	2	10	127954	127963	0 %	0 %	40 %	60 %	91781490
101	NC_007951	GCGCC	2	10	128545	128554	0 %	0 %	40 %	60 %	91781491
102	NC_007951	CGTGC	2	10	128870	128879	0 %	20 %	40 %	40 %	91781491
103	NC_007951	GCGCG	2	10	129265	129274	0 %	0 %	60 %	40 %	91781491
104	NC_007951	GGCGT	2	10	132738	132747	0 %	20 %	60 %	20 %	91781494
105	NC_007951	CCAGG	2	10	136530	136539	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007951	AACCA	2	10	138066	138075	60 %	0 %	0 %	40 %	91781498
107	NC_007951	GCCGG	2	10	139224	139233	0 %	0 %	60 %	40 %	91781498
108	NC_007951	AATGC	2	10	141249	141258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007951	GCCGC	2	10	143061	143070	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_007951	AGCCC	2	10	143241	143250	20 %	0 %	20 %	60 %	91781503
111	NC_007951	GCCGA	2	10	143996	144005	20 %	0 %	40 %	40 %	91781503
112	NC_007951	CGAGC	2	10	145857	145866	20 %	0 %	40 %	40 %	91781505
113	NC_007951	TTCGC	2	10	145981	145990	0 %	40 %	20 %	40 %	91781505
114	NC_007951	AGCGA	2	10	146923	146932	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007951	CCCGA	2	10	148255	148264	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_007951	GCGGT	2	10	148746	148755	0 %	20 %	60 %	20 %	91781507
117	NC_007951	CCGTT	2	10	150155	150164	0 %	40 %	20 %	40 %	91781508
118	NC_007951	GCGCC	2	10	151343	151352	0 %	0 %	40 %	60 %	91781509
119	NC_007951	CGGCG	2	10	153304	153313	0 %	0 %	60 %	40 %	91781511
120	NC_007951	ATCCG	2	10	155219	155228	20 %	20 %	20 %	40 %	91781513
121	NC_007951	CTCGG	2	10	156401	156410	0 %	20 %	40 %	40 %	91781514
122	NC_007951	GGCCG	2	10	157196	157205	0 %	0 %	60 %	40 %	91781515
123	NC_007951	GCGCG	2	10	157815	157824	0 %	0 %	60 %	40 %	91781515
124	NC_007951	CTCGC	2	10	158606	158615	0 %	20 %	20 %	60 %	91781515
125	NC_007951	CGCAA	2	10	161706	161715	40 %	0 %	20 %	40 %	91781519
126	NC_007951	TGACC	2	10	163427	163436	20 %	20 %	20 %	40 %	91781520
127	NC_007951	ACGTA	2	10	165686	165695	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007951	GCTCA	2	10	167085	167094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007951	CGGCC	2	10	169214	169223	0 %	0 %	40 %	60 %	91781524
130	NC_007951	GCCGC	2	10	169819	169828	0 %	0 %	40 %	60 %	91781525
131	NC_007951	GCTGC	2	10	171517	171526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007951	AAACG	2	10	172097	172106	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007951	ATCGC	2	10	176868	176877	20 %	20 %	20 %	40 %	91781534
134	NC_007951	CGGCG	2	10	177087	177096	0 %	0 %	60 %	40 %	91781535
135	NC_007951	CGCGG	2	10	177511	177520	0 %	0 %	60 %	40 %	91781535
136	NC_007951	CAAGC	2	10	179937	179946	40 %	0 %	20 %	40 %	91781537
137	NC_007951	AAAAC	2	10	180658	180667	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007951	AGCGG	2	10	181516	181525	20 %	0 %	60 %	20 %	91781538
139	NC_007951	TGATC	2	10	182057	182066	20 %	40 %	20 %	20 %	91781539
140	NC_007951	CGCAA	2	10	182923	182932	40 %	0 %	20 %	40 %	91781541
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