MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacillus flagellatus KT

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007947	TTTTG	2	10	12289	12298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007947	TTTTC	2	10	29782	29791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007947	ATGAC	2	10	47937	47946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007947	TCGTG	2	10	65181	65190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007947	GGGAG	2	10	66745	66754	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007947	GTAGC	2	10	79973	79982	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007947	TTCAT	2	10	116785	116794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007947	GGAAT	2	10	148292	148301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007947	GCAGC	2	10	155733	155742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007947	GCGGA	2	10	175619	175628	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007947	CATTT	2	10	175990	175999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007947	TGGAA	2	10	178351	178360	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007947	TTACT	2	10	183785	183794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007947	CTGGG	2	10	205697	205706	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007947	GTAAG	2	10	205748	205757	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007947	TTGCC	2	10	210637	210646	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007947	GCTGT	2	10	214721	214730	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007947	CAAAT	2	10	236212	236221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007947	TCTCA	2	10	244521	244530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007947	CTGCA	2	10	247776	247785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007947	ATAGA	2	10	286444	286453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007947	GATTG	2	10	301229	301238	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007947	ATACT	2	10	304545	304554	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007947	ATGAC	2	10	304704	304713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007947	GTTGG	2	10	326225	326234	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007947	TAGCC	2	10	332238	332247	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007947	GGTAG	2	10	336955	336964	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007947	TTGGA	2	10	342463	342472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007947	GTTTA	2	10	342493	342502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007947	AGCGA	2	10	350121	350130	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007947	GCAAG	2	10	363834	363843	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007947	CGCAG	2	10	363904	363913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007947	AAGCC	2	10	376896	376905	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007947	TGCGG	2	10	408106	408115	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007947	TCAAA	2	10	412372	412381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007947	CCAAC	2	10	414064	414073	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007947	AGCGA	2	10	414806	414815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007947	GCCGC	2	10	416256	416265	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_007947	TGAAT	2	10	422271	422280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007947	CTTGC	2	10	430562	430571	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007947	GTTTG	2	10	436775	436784	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007947	GGATA	2	10	451600	451609	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007947	ATTGC	2	10	463755	463764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007947	GCCAG	2	10	465693	465702	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007947	TCGGG	2	10	503118	503127	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007947	GTGAC	2	10	514455	514464	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007947	TGTGA	2	10	519426	519435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007947	AAGCA	2	10	519984	519993	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007947	GGTCT	2	10	538635	538644	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007947	CATGT	2	10	540407	540416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007947	TAAAG	2	10	540451	540460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007947	CCAGC	2	10	550534	550543	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_007947	CCTGC	2	10	564884	564893	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_007947	GAAAG	2	10	565492	565501	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007947	TTTTA	2	10	582603	582612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007947	ACATC	2	10	607477	607486	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007947	TCGGC	2	10	611717	611726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007947	CCTTT	2	10	630415	630424	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007947	GTCGC	2	10	634121	634130	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007947	AGTAG	2	10	634245	634254	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007947	GGGGC	2	10	635032	635041	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007947	CAGAA	2	10	637572	637581	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007947	ATCAG	2	10	637833	637842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007947	TACTG	2	10	659550	659559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007947	TAGCT	2	10	680780	680789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007947	CTTTT	2	10	685317	685326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007947	ATTTT	2	10	685396	685405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007947	TAGAT	2	10	685832	685841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007947	CTATT	2	10	701359	701368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007947	ATGGA	2	10	701490	701499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007947	CATTG	2	10	740976	740985	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007947	TGGTG	2	10	741010	741019	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007947	TTCAG	2	10	741445	741454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007947	TGGAT	2	10	765190	765199	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007947	GAAAA	2	10	786851	786860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007947	GCGAT	2	10	790462	790471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007947	GGGCT	2	10	813036	813045	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007947	AGCGC	2	10	871260	871269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007947	GCCGC	2	10	871431	871440	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007947	CTTAA	2	10	889075	889084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007947	AATCC	2	10	890078	890087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007947	TTGTC	2	10	890304	890313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007947	GGAAA	2	10	891134	891143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007947	GCAGC	2	10	905859	905868	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007947	GTCAG	2	10	915090	915099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007947	TATGC	2	10	915206	915215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007947	GTCAG	2	10	915284	915293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007947	GAAGG	2	10	926345	926354	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007947	ATGGA	2	10	930883	930892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007947	TGGTT	2	10	935683	935692	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007947	TGAAT	2	10	942071	942080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007947	CAGCA	2	10	974169	974178	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007947	TGATA	2	10	984778	984787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007947	GGGCT	2	10	997405	997414	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007947	AATTG	2	10	1006179	1006188	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007947	AGCGC	2	10	1014292	1014301	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007947	GCCGC	2	10	1014463	1014472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_007947	CTTAA	2	10	1032107	1032116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007947	AATCC	2	10	1033110	1033119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007947	TTGTC	2	10	1033336	1033345	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007947	GGAAA	2	10	1034166	1034175	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007947	GCAGC	2	10	1048891	1048900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007947	GTCAG	2	10	1058122	1058131	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007947	TATGC	2	10	1058238	1058247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007947	GTCAG	2	10	1058316	1058325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007947	GAAGG	2	10	1069377	1069386	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007947	ATGGA	2	10	1073915	1073924	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007947	TGGTT	2	10	1078715	1078724	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007947	TGAAT	2	10	1085103	1085112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007947	CAGCA	2	10	1117201	1117210	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007947	TGATA	2	10	1127810	1127819	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007947	GGGCT	2	10	1140437	1140446	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007947	AATTG	2	10	1149211	1149220	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007947	AATTT	2	10	1156629	1156638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007947	TATTG	2	10	1178600	1178609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007947	TTCTA	2	10	1178623	1178632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007947	GATTG	2	10	1186494	1186503	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007947	TCGGA	2	10	1197191	1197200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007947	GTTTT	2	10	1224404	1224413	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007947	CCACC	2	10	1225202	1225211	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_007947	CAATG	2	10	1229706	1229715	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007947	TCCGC	2	10	1236052	1236061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007947	GGACA	2	10	1239508	1239517	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007947	AAATT	2	10	1241480	1241489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007947	AAAGA	2	10	1241736	1241745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007947	TGAAA	2	10	1247499	1247508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007947	GGCTT	2	10	1247678	1247687	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007947	GAGCG	2	10	1257023	1257032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007947	AAATG	2	10	1260225	1260234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007947	TCGCT	2	10	1271821	1271830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007947	GCCAG	2	10	1273198	1273207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007947	AATGG	2	10	1289146	1289155	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007947	CATGA	2	10	1292554	1292563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007947	GGCGC	2	10	1306907	1306916	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007947	CCCGG	2	10	1319778	1319787	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007947	GAATC	2	10	1333704	1333713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007947	GCCGG	2	10	1336025	1336034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007947	ATTTA	2	10	1345057	1345066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007947	CGATG	2	10	1367369	1367378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007947	TACTC	2	10	1376725	1376734	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_007947	ACCAG	2	10	1377458	1377467	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007947	GCCAT	2	10	1406819	1406828	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007947	TTTTG	2	10	1411344	1411353	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007947	TTCTT	2	10	1415754	1415763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_007947	CTTAC	2	10	1796264	1796273	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.